Job Description P15067 Confidence 98.44% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 121 Aligned Residues 330 % Identity 15% Template c3a5vA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase; PDBTitle: crystal structure of alpha-galactosidase i from mortierella vinacea Resolution 2.00 Å

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		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	K	D	L	G	Y	N	Y	V	I	I	D	D	C	W	Q	K	N	E	R	E	S	.	.	.	.	.	.	S	K	T	L	L	A	D	P	T	K	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	R	G	I	K	P	L	V	D	D	I	H	N	L	G	L	K	A	G	I	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T								S	S		B		S	S			T	.	.	.	.	.	.	T	S				B		T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T												T	T						.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.							.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.															.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	S	A	G	T	L	T	C	G	G	H	I	A	S	L	G	Y	E	D	I	D	A	K	T	W	A	K	.	W	G	I	D	Y	L	K	Y	D	N	C	Y	N	Q	G	Q	S	G	T	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S	S	B		T	T	S		B			T	T												.		T									T	T		T	T			S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template SS confidence
																																	93	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.			360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.
Query SS confidence														.	.
Query Sequence		R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	.	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F
Query Conservation														.	.
Alig confidence														.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	L	S	Y	D	R	Y	K	A	M	G	N	A	L	N	K	T	G	R	P	M	L	Y	S	L	C	N	W	G	E	D	G	P	W	N	F	A	S	T	I	S	N	S	W	R	I	S	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																		T		S								S	T	T	T	T						S	T	T	T		S					S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L
Query Conservation
Alig confidence																																																												.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.
Template Sequence		V	Y	D	N	F	N	R	P	D	P	A	C	P	C	T	T	Y	D	C	V	L	A	G	F	R	C	S	V	M	N	I	I	N	K	A	V	A	V	S	Q	K	A	R	S	G	G	W	N	D	L	D	M	L	E	V	G	N	G	.	.	.	.	G	M	N	Q	E	E	Y	R	V	H	Y	T	I	W	A	A	L	K
Template Known Secondary structure		B		S		S	S				T	T	S				S	S			S				S		B													G	G	G		B	T	T	B							B		T	T	S	S	.	.	.	.	S	S															T	T
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.
Template SS confidence
		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.					.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.			.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																.	.
Query SS confidence																																																.	.
Query Sequence		S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	.	.	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y
Query Conservation																																																.	.
Alig confidence				.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.									.																				.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.																				.	.	.	.
Template Sequence		S	P	.	.	.	.	L	I	L	G	N	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	N	I	T	N	T	T	K	E	I	I	M	N	K	E	V	I	A	V	N	Q	.	D	S	S	F	S	P	A	N	R	I	W	V	K	G	D	Q	Q	L	F	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				.	.	.	.					S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S																			T	.		T	T											T	T					.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.																				.	.	.	.
Template SS confidence
		266	.					.	.	270	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.		.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.
		584	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.															.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.			.	.	640	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Query SS confidence																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Query Sequence		A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	.	.	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G
Query Conservation																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	N	L	A	N	N	T	Q	V	V	I	L	L	N	A	G	D	S	A	A	K	M	T	A	T	W	D	D	I	W	V	Y	N	L	P	N	V	D	S	S	R	S	I	E	V	R	D	L	W	K	Q	K	S	L	G	N	F	S	N	H	I	T	L	D	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T										S	S	S												T	G	G	G	T	T	S	B		T	T								T	T	T	T								S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																315	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		648	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	A	H	G	V	R	L	L	K
Template Known Secondary structure			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.