Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 34 Aligned Residues 440 % Identity 18% Template c3a47A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:oligo-1,6-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of isomaltase from saccharomyces cerevisiae Resolution 1.59 Å

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		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.							.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.							.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	K	E	A	T	F	Y	Q	I	Y	P	A	S	F	K	D	S	N	D	D	G	W	.	.	.	.	G	D	M	K	G	I	.	.	A	S	K	L	E	Y	I	K	E	L	G	A	D	A	I	W	I	S	P	F	Y	D	S	P	Q	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	G	Y	D	I	A	N	Y	E
Template Known Secondary structure												G	G	G	S			S	S	S	S	S	S	.	.	.	.							.	.			T								T		S													T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.							.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.					.	.	.	40	.	.			.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.											70	.	.	.	.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.			.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																				.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	.	.	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																				.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.																																						.	.																					.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.
Template Sequence		K	V	W	P	T	Y	G	T	.	.	.	.	.	N	E	D	C	F	A	L	I	E	K	T	H	K	L	G	M	K	F	I	T	D	L	V	I	N	H	C	S	S	E	H	E	W	F	K	E	S	R	S	S	K	T	N	P	K	R	D	W	F	F	W	R	P	P	K	G	Y	D	A	E	G	K	P	I	P	P	N
Template Known Secondary structure					T	T	T			.	.	.	.	.														T	T										S	B			T	T	S							T	T		S	S	S	T	T	G	G	G	B						S				T	T	S					S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.						.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
																									298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	W	K	S	Y	F	G	G	S	A	W	T	F	D	E	K	T	Q	E	F	Y	L	R	L	F	C	S	T	Q	P	D	L	N	W	E	N	E	D	C	R	K	A	I	Y	E	S	A	V	G	Y	W	L	D	H	G	V	D	G	F	R	I	D	V	G	S	L	Y	S	K	V	V	G	L	P	D	A	P	V	V	D
Template Known Secondary structure			B	B		T	T	S	S	B	S					T	T	T	T						S	S	S	T	T			B	B		T	T													T						T	T							T	T	G	G	G	S				T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.
																							350	.	.	.	.	.	.	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.				380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																					.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																					.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	.	.	.	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																					.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																					.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	N	S	T	W	Q	S	S	D	P	Y	T	L	N	G	P	R	I	H	E	F	H	Q	E	M	N	Q	F	I	R	N	R	V	K	D	G	R	E	I	M	T	V	G	E	M	Q	H	A	S	D	E	T	K	R	L	Y	T	S	A	S	R	H	E	L	S	E	L	F	N	F	S	H	T	D	V	G	T	S	P	L
Template Known Secondary structure		T	T		S	S	B							S	S		T	T																	S	S																								G	G	G		S		S										T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	R	Y	N	L	V	P	F	E	L	K	D	W	K	I	A	L	A	E	L	F	R	Y	I	N	G	T	D	C	W	S	T	I	Y	L	E	N	H	D	Q	P	R	S	I	T	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure																				T	T	T	G	G	G	T	T	S	S							S			T	T	S								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
		485	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	D	D	S	P	K	N	R	V	I	S	G	K	L	L	S	V	L	L	S	A	L	T	G	T	L	Y	V	Y	Q	G	Q	E	L	G	Q	I	N	F	K	N	W	P	V	E	K	Y	E	D	V	E	I	R	N	N	Y	N	A	I	K	E	E	H	G	E	N	S	E	E	M	K	K	F	L	E	A	I	A	L	I
Template Known Secondary structure		S			S	T	T	T														T		S	S						T	T	G	G	G	T						S			G	G	G																			S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		361	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
						534	.	.	.	.	.	540	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N
Query Conservation		.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	R	D	H	A	R	T	P	M	Q	W	S	R	E	E	P	N	A	G	F	S	G	P	S	A	K	P	W	F	Y	L	N	D	S	F	R	E	G	I	N	V	E	D	E	I	K	D	P	N	S	V	L	N	F	W	K	E	A	L	K	F	R	K	A	H	K	D	I	T	V	Y	G	Y	.	.	.	.	.	.	D
Template Known Secondary structure			G	G	G	G	T	S								T	T	T	T	T	S	S		T	T				S	S				G	G	G	G	G	T		S								T	T	S															T					T	S			.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.							.
		577	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.		.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.
Query SS confidence																																																		.
Query Sequence		V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	A	.	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F
Query Conservation																																																		.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.	.	.																												.
Template Conservation															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	E	F	I	D	L	D	N	K	K	L	F	S	.	.	.	.	.	.	.	.	F	T	K	K	Y	N	N	K	T	L	F	A	A	L	N	F	S	S	D	A	T	D	F	K	I	P	N	D	D	S	S	F	K	L	E	F	G	N	Y	P	K	K	E	V	D	A	S	S	R	T	L	K	P	W	E	G	R	I	Y
Template Known Secondary structure						S	T	T		S	S				.	.	.	.	.	.	.	.						T	T										S	S	S							T	T			T	T							S	S		G	G	G			T	T						T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.									.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.