Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 45 Aligned Residues 434 % Identity 17% Template c2ze0A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-glucosidase; PDBTitle: alpha-glucosidase gsj Resolution 2.00 Å

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		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.							.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.							.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	K	E	G	V	A	Y	Q	I	Y	P	R	S	F	M	D	A	N	G	D	G	I	.	.	.	.	G	D	L	R	G	I	.	.	I	E	K	L	D	Y	L	V	E	L	G	V	D	I	V	W	I	C	P	I	Y	R	S	P	N	A	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	G	Y	D	I	S	D	Y	Y
Template Known Secondary structure												G	G	G	T			S	S	S	S	S	S	.	.	.	.							.	.			T								T															T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T		S		S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.							.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		6	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.					.	.	30	.	.	.			.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60											.	.	.	.	.	.	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.			.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	.	.	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																			.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.																																					.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.
Template Sequence		A	I	M	D	E	F	G	T	.	.	.	.	.	M	D	D	F	D	E	L	L	A	Q	A	H	R	R	G	L	K	V	I	L	D	L	V	I	N	H	T	S	D	E	H	P	W	F	I	E	S	R	S	S	R	D	N	P	K	R	D	W	Y	I	W	R	D	G	K	D	G	R	E	P	N	N	W	E	S	I	F
Template Known Secondary structure					G	G	G			.	.	.	.	.														T	T										S	B			T	T	S										S	S	S	T	T	G	G	G	B						B	T	T	B		S	S					T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		70	.	.	.	.	.	.	.						.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
																295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.
Template Sequence		G	G	S	A	W	Q	Y	D	E	R	T	G	Q	Y	Y	L	H	I	F	D	V	K	Q	P	D	L	N	W	E	N	S	E	V	R	Q	A	L	Y	E	M	V	N	W	W	L	.	D	K	G	I	D	G	F	R	I	D	A	I	S	H	I	K	K	K	P	G	L	P	D	L	P	L	K	Y	V	P	S	F	A	G
Template Known Secondary structure		S	S	B	S					T	T	T	T						S	S		T	T			B	B		T	T																	.			T								S	G	G	G	S	S			T	T								S
Template Predicted Secondary structure																																															.
Template SS confidence
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.		190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
					347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.														.
Query SS confidence		.	.	.														.
Query Sequence		.	.	.	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S
Query Conservation		.	.	.														.
Alig confidence		.	.	.														.
Template Conservation
Template Sequence		H	M	N	Q	P	G	I	M	E	Y	L	R	E	L	K	E	Q	T	F	A	R	Y	D	I	M	T	V	G	E	A	N	G	V	T	V	D	E	A	E	Q	W	V	G	E	E	N	G	V	F	N	M	I	F	Q	F	E	H	L	G	L	W	E	R	R	A	S	I	D	V	R	R	L	K	R	T	L	T	K	W	Q
Template Known Secondary structure			S	S		T	T												T	G	G	G	S	S								T	T			T	T	T	T						S	S	S		S		S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	G	L	E	N	R	.	.	.	.	G	W	N	A	L	F	L	E	N	H	D	L	P	R	S	V	S	T	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	D	R	D	Y	W	A	E	S	A	K	A	L	G	A	L
Template Known Secondary structure					T	T	T	.	.	.	.			B				S			T	T	S							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		310	.	.	.	.	.					.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.															.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	F	F	M	Q	G	T	P	F	I	Y	Q	G	Q	E	I	G	M	T	N	V	R	F	D	D	I	R	D	Y	R	D	V	S	A	L	R	I	I	W	K	T	G	R	D	N	S	R	T	P	M	Q	W	S	G	A	S	N	A	G	F	T	T	G	T	P	W	I	K	V	N	E	N	Y	R	T	I	N	V	E	A
Template Known Secondary structure				T	S	S	S						T	T	G	G	G	T							S	S	G	G	G			S												G	G	G	G	T	S						S	S	G	G	G	G	S		S	S			S	S				G	G	G	G	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		352	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
								546	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	R	R	D	P	N	S	V	W	S	F	Y	R	Q	M	I	Q	L	R	K	A	N	E	L	F	V	Y	G	T	Y	D	L	L	L	E	N	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	S	I	Y	A	Y	T	R	T	L	G	R	D	R	A	L	V	V	V	N	L	S	D	R	P	S	L
Template Known Secondary structure						T	T	S																T					S						S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S									T	T										S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		445	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		620	.	.	.	.				.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.
Query SS confidence							.	.	.
Query Sequence		I	V	L	P	A	.	.	.	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q	R
Query Conservation							.	.	.
Alig confidence							.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	R	Y	D	G	F	R	L	Q	S	S	D	L	A	L	S	N	Y	P	V	R	P	H	K	N	A	T	R	F	K	L	K	P	Y	E	A	R	V	Y	I	W
Template Known Secondary structure					T	T	S		B		G	G	G					S	S						S	S	B	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.