Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 46 Aligned Residues 416 % Identity 21% Template c2z1kA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:(neo)pullulanase; PDBTitle: crystal structure of ttha1563 from thermus thermophilus hb8 Resolution 2.30 Å

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		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L
Query Conservation																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																										.	.	.	.
Template Conservation																																																			.	.																										.	.	.	.
Template Sequence		Y	E	G	A	F	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	F	R	A	G	P	P	G	R	P	A	P	A	G	P	F	E	P	W	E	A	P	P	T	L	R	G	F	K	G	G	T	L	W	G	V	.	.	A	E	K	L	P	Y	L	L	D	L	G	V	E	A	I	Y	L	N	P	V	F	A	S	T	A	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	S	S								G	G	G	S				S				S	S				S					T	T	S				S	S											.	.			T								T													S	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																			.	.																										.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.			.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.													.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	L	F	S
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	N	H	R	Y	H	T	V	D	Y	F	Q	V	D	P	I	L	G	G	.	.	.	.	.	N	E	A	L	R	H	L	L	E	V	A	H	A	H	G	V	R	V	I	L	D	G	V	F	N	H	T	G	R	G	F	F	A	F	Q	H	L	X	E	N	G	E	Q	S	P	Y	R	D	W	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	T	T			S									G	G	G	T		.	.	.	.	.														T	T										S	B			T	T	S										G	G	G		T	T	G	G	G	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
									78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.						.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		279	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.		.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	.	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence																																																	.																	.														.	.
Template Conservation																																																	.																															.	.
Template Sequence		H	V	K	G	F	P	L	K	A	Y	T	A	H	P	N	Y	E	A	W	W	G	N	P	E	L	P	K	L	K	V	E	T	P	A	V	R	E	Y	L	L	A	V	A	E	H	W	I	.	R	F	G	V	D	G	W	R	L	D	V	P	N	E	I	P	D	P	T	F	W	R	E	F	R	Q	R	V	K	G	.	.
Template Known Secondary structure			B		S	S	S			T	T	S	S	S		S	B		B	G	G	G		T	T	S	B	B	B		T	T	S																.			T							S	S	G	G	G																	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.																															.	.
Template SS confidence
		146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																										.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																										.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	A	N	P	E	A	Y	I	V	G	E	I	W	E	E	A	D	F	W	L	Q	G	D	X	F	D	.	.	.	A	V	X	N	Y	P	L	A	R	A	V	L	G	F	V	G	G	E	A	L	D	R	D	L	A	A	Q	T	G	L	G	R	I	E	P	L	Q	A	L	A	F	S	H	R	L	E	D	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.			T	T								S	S			S	G	G	G	S	S	S	S		S	.	.	.			B														G	G	G	S						T	T	S	T	T		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																										.	.	.
Template SS confidence
						223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.				.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
						428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	G	R	Y	R	P	E	V	V	R	A	Q	X	N	L	L	T	S	H	D	T	P	R	L	L	S	L	X	R	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	R	A	R	L	A	L	A	L	L
Template Known Secondary structure		T	T	S	S						T	T					S			T	T	S							T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure																																								.	.
Query SS confidence																																								.	.
Query Sequence		L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	.	.	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N
Query Conservation																																								.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.											.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	L	L	P	G	N	P	T	V	Y	Y	G	E	E	V	G	X	A	G	G	K	D	.	.	.	.	.	.	P	E	N	R	G	G	X	V	W	E	E	A	R	W	Q	K	D	L	R	E	T	V	K	R	L	A	R	L	R	K	E	H	P	A	L	R	T	A	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	L	R	I	Y
Template Known Secondary structure		T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	T	.	.	.	.	.	.	T	T	T								G	G	G	S																			T					S	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.							360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.									.	.	400	.	.	.
		582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.								.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.		.	.	.	.	.	650	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.																						.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.	.	.																						.
Query Sequence		R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	.	.	.	.	.	.	.	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	.	W	Q	G	P	A	H	G	L	C
Query Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.																						.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	Q	D	G	H	L	A	F	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	Y	L	A	V	V	N	A	S	P	H	P	F	R	Q	D	F	P	L	H	G	V	F	P	R	G	G	R	A	V	D	L	L	S	G	E	V	C	T	P	Q	G	G	R	L	C	G	P	V	L	P	P	F	S	L	A
Template Known Secondary structure				T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T								S	S	S						S	B		T	T	S		T	T							T	T	T							B	T	T	B								T	T
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.														.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
		654	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	W	R
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		471	.	.