Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 594 % Identity 24% Template c2x4bA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:limit dextrinase; PDBTitle: barley limit dextrinase in complex with beta-cyclodextrin Resolution 2.10 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.		.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.
Query SS confidence																																						.
Query Sequence		P	L	G	A	H	Y	D	G	Q	G	V	N	F	T	L	F	S	A	H	A	E	R	V	E	L	C	V	F	D	A	N	G	Q	E	H	R	.	Y	D	L	P	G	H	S	G	D	I	W	H	G	Y	L	P	D	A	R	P	G	L	R	Y	G	Y	R	V	H	G	P	W	Q	P	A	E	G	H	R	F	N	P	A
Query Conservation																																						.
Alig confidence																																						.																																							.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.
Template Sequence		P	L	G	A	V	F	S	E	D	S	V	S	L	H	L	W	A	P	T	A	Q	G	V	S	V	C	F	F	D	G	P	A	G	P	A	L	E	T	V	Q	L	K	E	S	N	G	V	W	S	V	T	G	P	R	E	W	E	N	R	Y	Y	L	Y	E	V	D	V	Y	H	P	T	K	A	Q	V	.	.	.	L	K
Template Known Secondary structure									S	S									T	T		S								S	T	T	T	S												T	T								G	G	G	T	T												T	T	T	T			.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.				.	.
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	L	I	D	P	C	A	R	Q	I	D	G	E	F	K	D	N	P	L	L	H	A	G	H	N	E	P	D	Y	R	D	N	A	A	I	A	P	K	C	V	V	V	V	D	H	Y	D	W	E	D	D	A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P
Query Conservation
Alig confidence																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	L	A	G	D	P	Y	A	R	S	L	S	A	N	G	A	R	T	W	L	V	D	I	N	N	E	T	L	K	P	A	S	W	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	A	D	E	K	P	K	L	D	S	F	S	D	I	T	I	Y	E	L	H	I	R	D	F	S	A	H	D	G	T	V	D
Template Known Secondary structure							T	T		S		B	S	G	G	G	S	S						T	T		G	G	G	S		T	T	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G					S				S		G	G	G														T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.														240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.
		170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.						.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.																													.
Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence														.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	.	.	.	.	.	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Query Conservation														.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence														.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		S	D	S	R	G	G	F	R	A	F	A	Y	Q	A	S	A	G	M	E	H	L	R	K	L	S	D	A	G	L	T	H	V	H	L	L	P	S	F	H	F	A	G	V	D	D	I	K	S	N	W	K	F	V	D	E	C	E	L	A	T	F	P	P	G	S	D	M	Q	Q	A	A	V	V	A	I	Q	E	E	D	P
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	S	G	G	G	G	G		T	T	S													T													S	S	S		S		G	G	G										T	T	S		T	T		S										T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		273	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.			240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.
Query SS confidence																									.	.
Query Sequence		N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	.	.	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G
Query Conservation																									.	.
Alig confidence																									.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	N	W	G	Y	N	P	V	L	W	G	V	P	K	G	S	Y	A	S	D	P	D	G	P	S	R	I	I	E	Y	R	Q	M	V	Q	A	L	N	R	I	G	L	R	V	V	M	D	V	V	Y	N	H	L	D	S	S	G	P	C	G	I	S	S	V	L	D	K	I	V	P	G	Y	Y	V	R	R	D	T	N	G
Template Known Secondary structure																G	G	G	S	S		S	S	S	T																T	T										S	B		S			S	S		S	T	T							S	T	T	T	S	B		B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		353	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.			360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.
Query SS confidence																																																																			.	.
Query Sequence		D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	.	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P
Query Conservation																																																																			.	.
Alig confidence						.																																																													.	.
Template Conservation						.
Template Sequence		Q	I	E	N	.	S	A	A	M	N	N	T	A	S	E	H	F	M	V	D	R	L	I	V	D	D	L	L	N	W	A	V	N	Y	K	V	D	G	F	R	F	D	L	M	G	H	I	M	K	R	T	M	M	R	A	K	S	A	L	Q	S	L	T	T	D	A	H	G	V	D	G	S	K	I	Y	L	Y	G	E	G
Template Known Secondary structure			B			.	T	T	S	S	S	B	B		T	T	S																		S								T	T	G	G	G	S	B													T							S	S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure						.
Template SS confidence
		433	.	.	.		.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.
		373	.	.	.	.									.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	D	I	A	P	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		W	D	F	A	E	V	A	R	N	Q	R	G	I	N	G	S	Q	L	N	M	S	G	T	G	I	G	S	F	N	D	R	I	R	D	A	I	N	G	G	N	P	F	G	N	P	L	Q	Q	G	F	N	T	G	L	F	L	E	P	N	G	F	Y	Q	G	N	E	A	D	T	R	R	S	L	A	T	Y	A	D	Q	I
Template Known Secondary structure					G	G	G	G	G	G	T	T	S	S	B			T	T	T	T	T	T	T	T															S		T	T	S		T	T				T	T	T	T	T	T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		512	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.
		426	.	.																																		.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N
Query Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	I	G	L	A	G	N	L	R	D	Y	V	L	I	S	H	T	G	E	A	K	K	G	S	E	I	H	T	F	D	G	L	P	V	G	Y	T	A	S	P	I	E	T	I	N	Y	V	S	A	H	D	N	E	T	L	F	D	V	I	S	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						B	T		B	S	S						T	T	S					T	T	T	S	B		T	T	S		B	S			B	S	S	G	G	G					S			S	S	S											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		592	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	P	M	I	L	S	V	D	E	R	C	R	I	N	H	L	A	S	S	M	M	A	L	S	Q	G	I	P	F	F	H	A	G	D	E	I	L	R	S	K	S	I	D	R	D	S	Y	N	S	G	D	W	F	N	K	L	D	F	T	Y	E	T	N	N	W	G	V	G	L	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		T	T	S																		T	S	B	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S		G	G	G	S									T	T	S	S					S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
												654	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.
																														545	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.														.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	S	E	K	N	E	D	N	W	P	L	M	K	P	R	L	E	N	P	S	F	K	P	A	K	G	H	I	L	A	A	L	D	S	F	V	D	I	L	K	I	R	Y	S	S	P	L	F	R	L	S	T	A	N	D	I	K	Q	R	V	R	F	H	N	T	G	P	S	L	V	P	G	V	I	V	M	G	I	E	D
Template Known Secondary structure							G	G	G											G	G	G	S																					T	T		G	G	G	G			S												S		S	T	T			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		724	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.
		584	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.			.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.										.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	.	.	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L
Query Conservation																																										.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.																				.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	G	E	S	P	E	M	A	Q	L	D	T	N	F	.	.	.	.	.	.	S	Y	V	V	T	V	F	N	V	C	P	H	E	V	S	M	D	I	P	A	L	A	S	M	G	F	E	L	H	P	V	Q	V	N	S	S	D	T	L	V	R	K	S	A	Y	E	A	A	T	G	R	F	T	V	P	G	R	T	V
Template Known Secondary structure				S	S	S		S	S					S	S		.	.	.	.	.	.										S	S	S							G	G	G		S	S										T		S		T	T	G	G	G					T	T	T	T						T	T
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		804	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.							.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.
		653	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	V	F
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		S	V	F
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		878	.	880