Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 29 Aligned Residues 424 % Identity 20% Template c2wcsA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha amylase, catalytic region; PDBTitle: crystal structure of debranching enzyme from nostoc2 punctiforme (npde) Resolution 2.80 Å

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		142	.	.	.	.	.	.		.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
Predicted Secondary structure									.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	P	P	R	T	P	W	.	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A
Query Conservation									.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation																																																											.	.
Template Sequence		Q	I	Q	T	P	D	W	V	K	H	A	V	F	Y	Q	I	F	P	D	R	F	A	R	S	K	Q	P	R	K	R	L	L	Q	E	A	R	W	E	D	W	D	S	M	P	T	L	Q	G	Y	K	G	G	D	L	W	G	I	.	.	M	E	D	L	D	Y	I	Q	N	L	G	I	N	A	I	Y	F	T	P	I	F
Template Known Secondary structure							T	T	G	G	G								G	G	G	T				S	S					S		T	T			T	T	T	G	G	G						T			S							.	.			T								T							S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.			.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		203	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	S	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	R	Y	H	T	H	D	Y	Y	Q	V	D	P	M	L	G	G	.	.	.	.	.	N	E	A	F	K	E	L	L	D	A	A	H	Q	R	N	I	K	V	V	L	D	G	V	F	N	H	S	S	R	G	F	F	F	F	H	D	V	L	E	N	G	P
Template Known Secondary structure				S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T		T	T	S									G	G	G	T		.	.	.	.	.														T	T										S	B			T	T	S										G	G
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.												.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.						.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.															.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Query SS confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Query Sequence		D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	.	T	P	E	F
Query Conservation																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.
Alig confidence																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.																		.
Template Conservation																																																											.
Template Sequence		H	S	P	W	V	N	W	F	K	I	E	G	W	P	L	S	P	Y	N	G	E	F	P	A	N	Y	V	G	W	A	G	N	R	A	L	P	E	F	N	H	D	N	P	E	V	R	E	Y	I	M	E	I	A	E	Y	W	L	.	K	F	G	I	D	G	W	R	L	D	V	P	F	E	I	K	T	P	G	F	W	Q
Template Known Secondary structure		G		T	T	G	G	G	B		B		S	S	S			S	S			S	S			S	B		B	G	G	G		T	T	S	B	B	B		T	T	S																.			T								S	T	T	S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																																											.
Template SS confidence
		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200		.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	410	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	P	L
Query Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.																										.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template Sequence		E	F	R	D	R	T	K	A	.	.	.	.	.	.	I	N	P	E	A	Y	I	V	G	E	V	W	G	D	S	R	Q	W	L	D	G	T	Q	F	D	.	.	.	G	V	M	N	Y	L	F	A	G	P	T	I	A	F	A	A	G	D	R	V	V	L	E	Q	V	Q	S	R	D	Y	Q	P	Y	P	P	L	F	A
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.			T	T									S			G	G	G		S	S	S	S		S	.	.	.																T	G	G	G			S	S	S			T	T	T					S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template SS confidence
		223	.	.	.	.	.	.	230							.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.				.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R
Query Conservation
Alig confidence																				.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	Y	A	T	K	I	Q	E	V	L	Q	L	Y	P	W	E	I	.	.	Q	L	T	Q	L	N	L	L	A	S	H	D	T	A	R	L	M	T	I	A	G	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure													T	S	S					.	.		T	T					S			T	T	S							T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.			.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
		492	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E
Query Conservation
Alig confidence		.																																		.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Template Conservation		.																																		.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Template Sequence		.	I	A	S	V	E	L	S	T	L	L	L	L	T	F	P	G	A	P	S	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	P	G	G	I	D	.	.	.	.	.	.	P	D	S	R	R	G	F	P	E	A	N	W	N	Q	E	I	F	N	T	H	R	Q	L	I	T	I	R	Q	T	Y	P	A	L	R	T	G	D	.	.	.
Template Known Secondary structure		.												T	T	S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	S	.	.	.	.	.	.	S	S	S																												T					S		.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.																																		.	.	.	.	.	.																																						.	.	.
Template SS confidence
			335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.							.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		572	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.					.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.						.	.	.	.	.	640	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.	.	.												.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																						.	.	.	.												.	.	.	.	.
Query Sequence		E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	.	.	.	.	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	.	.	.	.	.	G	E	D	N	P	V	I	T
Query Conservation																																																						.	.	.	.												.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.												.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Q	V	L	Y	A	Q	G	Q	L	Y	L	F	A	R	T	L	G	T	E	E	L	I	I	A	I	N	A	G	T	S	S	A	T	A	N	V	D	V	A	S	L	H	T	Q	P	N	K	L	L	Y	G	T	A	E	A	E	W	N	G	E	E	G	T	Q	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T									T	T										S	S	S										S		S	S								S										S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																406	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
		643	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		L	S	L	T	L	P	A	R	S	G	C	I	L	G
Template Known Secondary structure								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.