Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 44 Aligned Residues 427 % Identity 15% Template c2taaA_ PDB info PDB header:hydrolase (o-glycosyl) Chain: A: PDB Molecule:taka-amylase a; PDBTitle: structure and possible catalytic residues of taka-amylase a Resolution 3.00 Å

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		144	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.									.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.
Template Conservation																																														.	.																													.	.	.
Template Sequence		T	P	A	D	W	R	S	Q	S	I	Y	F	L	L	T	D	R	F	A	R	T	D	G	S	T	T	A	T	C	N	T	A	D	Q	K	Y	C	G	G	T	W	Q	G	I	.	.	I	D	K	L	D	Y	I	Q	G	M	G	F	T	A	I	W	I	T	P	V	T	A	Q	L	P	Q	D	C	.	.	.	A	Y	G
Template Known Secondary structure			T	T	T	G	G	G	S							B	T	T	B			T	T			T	T					G	G	G		S						G	G	G	G	.	.	G	T																			S				S	S			.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.																													.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.			.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.				.	.	.
		216	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D
Query Conservation
Alig confidence																							.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.	.
Template Sequence		D	A	Y	T	G	Y	W	Q	T	D	I	Y	S	L	N	E	N	Y	G	T	A	.	.	.	.	.	D	D	L	K	A	L	S	S	A	L	H	E	R	G	M	Y	L	M	V	D	V	V	A	N	H	M	G	Y	D	G	A	G	S	S	V	D	Y	S	V	F	K	P	F	S	S	Q	D	Y	F	H	P	F	C	F
Template Known Secondary structure				T	T					S	S	S	S	S			S	S	S			T	.	.	.	.	.	T													S									T	T	B					S		G	G	G				S	S		T	T		S	S	S	T	T	B					B
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.
Template SS confidence
		77	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.						.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.
		296	.	.	.	300	.	.															.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	H	N	W	T	G	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	Q	N	Y	E	D	Q	T	Q	V	E	D	C	W	L	G	D	N	T	V	S	L	P	D	L	D	T	T	K	D	V	V	K	N	E	W	Y	D	W	V	G	S	L	V	S	N	Y	S	I	D	G	L	R	I	D	T	V	K	H	V	Q	K	D	F	W	P	G	Y	N	K	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S	G	G	G		S	S	T	T	T	S	B				T	T					B	B			S	S	S															T	T	T			S					T	T		S	T	T		T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		152	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.																							.																																											.	.	.	.
Template Conservation		.	.																							.																																											.	.	.	.
Template Sequence		.	.	A	G	V	Y	C	I	G	E	V	L	D	G	D	P	A	Y	T	C	P	Y	Q	N	.	V	M	D	G	V	L	N	Y	P	I	Y	Y	P	L	L	N	A	F	K	S	T	S	G	S	M	D	D	L	Y	N	M	I	N	T	V	K	S	D	C	P	D	S	.	.	.	.	T	L	L	G	T	F	V	E	N
Template Known Secondary structure		.	.	S		S															T	G	G	G	T	.	T	T	S	B														S	S	S	T	T			T														B			T	.	.	.	.	T						S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																							.																																											.	.	.	.
Template SS confidence
				223	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.		.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.					.	.	.	290	.	.	.	.	.
		442	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	P	R	F	A	S	Y	T	N	D	I	A	L	A	K	N	V	A	A	F	I	I	L	N	D	G	L	P	I	I	Y	A	G	Q	E	Q	H	Y	A
Template Known Secondary structure		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			G	G	G	S																	S	S	S						T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		296	.																																								.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		522	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.
Query SS confidence																						.	.
Query Sequence		Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	.	.	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L
Query Conservation																						.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.											.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	G	N	D	.	.	.	.	.	.	P	A	N	R	E	A	T	W	L	S	G	Y	P	T	D	S	E	L	Y	K	L	I	A	S	A	N	A	I	R	N	Y	A	I	S	K	D	T	G	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	T	Y	K	N	P	Y	I	K	D	D	T	T	I	A	M	R
Template Known Secondary structure				S	S	.	.	.	.	.	.	S	T	T				G	G	G	S	S			T	T	S																				S			T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S								S	S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		337	.	.	340							.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.															380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
		600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.				.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.							.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.		.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.														.	.	.	.	.	.													.
Query SS confidence																.	.	.														.	.	.	.	.	.													.
Query Sequence		Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	.	.	.	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	A	G	E	.	.	.	.	.	.	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	.	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F
Query Conservation																.	.	.														.	.	.	.	.	.													.
Alig confidence																.	.	.														.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation
Template Sequence		K	G	T	D	G	S	Q	I	V	T	I	L	S	N	K	G	A	S	G	D	S	Y	T	L	S	L	S	G	A	S	Y	T	A	G	Q	Q	L	T	E	V	I	G	C	T	T	V	T	V	G	S	D	G	N	V	P	V	P	M	A	G	G	L	P	R	V	L
Template Known Secondary structure					S	T	T											T	T									S	S					T	T						S	T	T								T	T	T							S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.