Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 76 Aligned Residues 359 % Identity 19% Template c2qpuB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-amylase type a isozyme; PDBTitle: sugar tongs mutant s378p in complex with acarbose Resolution 1.70 Å

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		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.		.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.
Query SS confidence																																																																															.
Query Sequence		E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	.	A	Y
Query Conservation																																																																															.
Alig confidence											.	.	.														.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.
Template Conservation											.	.	.														.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	V	L	F	Q	G	F	N	W	.	.	.	E	S	W	K	Q	S	G	G	W	Y	N	M	M	.	.	M	G	K	V	D	D	I	A	A	A	G	V	T	H	V	W	L	P	P	P	S	H	S	V	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	E	G	Y	M	P	G	R	L	Y	D	I	D	A	S	K	Y
Template Known Secondary structure										T	.	.	.	T	G	G	G		T	T							.	.	G	G	G							T	T										S		B	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		S	B			T	T		G	G	G		S	S
Template Predicted Secondary structure											.	.	.														.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10				.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.			.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.												.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y
Query Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.
Template Sequence		G	N	.	.	.	.	.	A	A	E	L	K	S	L	I	G	A	L	H	G	K	G	V	Q	A	I	A	D	I	V	I	N	H	R	C	A	D	Y	K	D	S	R	G	I	Y	C	I	F	E	G	G	T	S	D	G	R	L	D	W	G	P	H	M	I	C	R	D	D	T	K	Y	S	D	G	T	A	N	L	D	T
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.														T	T										S	B				S				T	T	S								S	S	S	S		T	T				G	G	G	B		T	T		T	T	T			S		S				S
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		66	.						.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140
		297	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A
Query Conservation
Alig confidence																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	A	D	F	A	A	A	P	D	I	D	H	L	N	D	R	V	Q	R	E	L	K	E	W	L	L	W	L	K	S	D	L	G	F	D	A	W	R	L	D	F	A	R	G	Y	S	P	E	M	A	K	V	Y	I	D	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	S	L	A	V	A	E	V	W	D	N	M
Template Known Secondary structure		S				T	T	S		B	B		T	T	S																	T	T								T	T	G	G	G	S													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		141	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.											.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
		377	.	.	380	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I
Query Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	T	G	G	D	G	K	P	N	Y	D	Q	D	A	H	R	Q	N	L	V	N	W	V	D	K	V	G	G	A	A	S	A	G	M	V	F	D	F	T	T	K	G	I	L	N	A	A	V	E	G	E	L	W	.	.	.	.	.	.	R	L	I	D	P	Q	G	K	A	P	G	V	M	G	W	W	P	A	K	A	V
Template Known Secondary structure			B		T	T	S		B		S																	T	G	G	G	S	S																T	T	T		G	G	.	.	.	.	.	.	G	S	S		T	T	S	S		S	S	G	G	G	T		G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.							.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	F	V	D	N	H	D	T	G	S	T	Q	A	M	W	P	F	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	K	V	M	Q	G	Y	A	Y	I	L	T	H	P	G	I	P	C	I	F	Y	D	H
Template Known Secondary structure				S			T	T	T	S	T	T	T		S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G									T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		285	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
		517	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	F	N	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	F	K	D	Q	I	A	A	L	V	A	I	R	K	R	N	G	I	T	A	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	K	I	L	M	H	E	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S															T	T			T	T		.	.	.	.	.	.	.	.									T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		327	.	.	330																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.									.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
		597	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G
Query Conservation
Alig confidence		.																							.	.
Template Conservation		.																							.	.
Template Sequence		.	A	Y	V	A	E	I	D	G	K	V	V	V	K	I	G	P	R	Y	D	V	G	A	.	.	V	I	P	A	G	F	V	T	S	A	H	G	N	D
Template Known Secondary structure		.							T	T	T						S	S					G	G	.	.	G	S		T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure		.																							.	.
Template SS confidence
			363	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.			.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.