Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 570 % Identity 25% Template c2e8yA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:amyx protein; PDBTitle: crystal structure of pullulanase type i from bacillus subtilis str.2 168 Resolution 2.11 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	G	A	H	Y	D	G	Q	G	V	N	F	T	L	F	S	A	H	A	E	R	V	E	L	C	V	F	D	A	N	G	Q	E	H	R	Y	D	L	P	G	H	S	G	D	I	W	H	G	Y	L	P	D	A	R	P	G	L	R	Y	G	Y	R	V	H	G	P	W	Q	P	A	E	G	H	R	F	N	P	A	K
Query Conservation
Alig confidence																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	L	G	A	V	Y	T	A	D	H	T	V	F	K	V	W	A	P	A	A	T	S	A	A	V	K	L	S	H	P	N	K	S	G	R	T	F	Q	M	T	R	L	E	K	G	V	Y	A	V	T	V	T	G	D	L	H	G	Y	E	Y	L	F	C	I	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	S	E	W	M
Template Known Secondary structure									S	S									T	T		S									T	T	S											G	G	G								S			T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.										170	.	.	.	.	.
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	L	I	D	P	C	A	R	Q	I	D	G	E	F	K	D	N	P	L	L	H	A	G	H	N	E	P	D	Y	R	D	N	A	A	I	A	P	K	C	V	V	V	V	D	H	Y	D	W	E	D	D	A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Sequence		E	T	V	D	Q	Y	A	K	A	V	T	V	N	G	E	K	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	R	P	D	Q	M	K	W	T	A	P	L	K	P	F	S	H	P	V	D	A	V	I	Y	E	T	H	L	R	D	F	S	I	.	H	E	N	S	G	M
Template Known Secondary structure						T	T		S	S	B		G	G	G		S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	S		G	G	G														.	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template SS confidence
		176	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.		.	.	230	.	.	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180										.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.
Query Sequence		E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.																						.	.
Template Conservation																																																										.
Template Sequence		I	N	K	G	K	Y	L	A	L	T	E	T	D	T	Q	T	A	N	G	S	S	S	G	L	A	Y	V	K	E	L	G	V	T	H	V	E	L	L	P	V	N	D	F	A	G	V	D	E	E	K	P	L	D	A	Y	N	.	W	G	Y	N	P	L	H	F	F	A	P	E	G	S	Y	A	S	N	P	H	D	P	Q
Template Known Secondary structure		S	S	T	T	S	G	G	G	G	G		T	T		B		T	T	S		B										T		S					S						S	S	S		T	T	S	G	G	G				.				S									S	T	T	S	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																										.
Template SS confidence
		234	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
			240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S
Query Conservation		.
Alig confidence		.																																				.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.
Template Sequence		T	R	K	T	E	L	K	Q	M	I	N	T	L	H	Q	H	G	L	R	V	I	L	D	V	V	F	N	H	V	Y	K	R	E	N	S	P	.	.	.	.	F	E	K	T	V	P	G	Y	F	F	R	H	D	E	C	G	K	P	S	N	G	T	G	V	G	N	D	I	A	S	E	R	R	M	A	R	K	F	I	A
Template Known Secondary structure																	T	T									T	T			S	S	G	G	G	S		.	.	.	.					S	T	T	T	S	B		B		T	T	S	S	B			T	T	S	S	S			B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.
Template SS confidence
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.					.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.								.	.	.	390	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	.	.	.	.	.	.	.	P	L	F	A	E
Query Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	C	V	V	Y	W	L	E	E	Y	N	V	D	G	F	R	F	D	L	L	G	I	L	D	I	D	T	V	L	Y	M	K	E	K	A	T	K	.	.	.	.	.	.	A	K	P	G	I	L	L	F	G	E	G	W	D	L	A	T	P	L	P	H	E	Q	K	A	A	L	A	N	A	P	R	M	P	G	I	G	F
Template Known Secondary structure																			T	T	G	G	G	S	B														.	.	.	.	.	.		S	T	T													S	S		G	G	G	B			G	G	G	G	G	G		T	T
Template Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		389	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.							.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.										.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.			430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Query Sequence		W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	.	.	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.																									.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	D	M	F	R	D	A	V	K	G	N	T	F	H	L	K	A	T	G	F	A	L	G	N	G	E	S	A	Q	A	V	M	H	G	I	A	G	S	S	G	W	K	A	L	A	P	I	V	P	E	P	S	Q	S	I	N	Y	V	E	S	H	D	N	H	T	F	W	D	K	M	S	F	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure														S	S	S	T	T				G	G	G	T		G	G	G									B	T	T	S		B	T	T	B			S	S	S	S	G	G	G					S			S	S	S	S									.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.
		461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	L	P	Q	E	N	D	S	R	K	R	S	R	Q	R	L	A	V	A	I	I	L	L	A	Q	G	V	P	F	I	H	S	G	Q	E	F	F	R	T	K	Q	G	V	E	N	S	Y	Q	S	S	D	S	I	N	Q	L	D	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T																			T	S	B	S						T	T	G	G	G	T				T	T		S			T	T							S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																								536	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.
		541			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure			.	.
Query SS confidence			.	.
Query Sequence		S	.	.	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T
Query Conservation			.	.
Alig confidence			.	.																														.																										.	.	.	.
Template Conservation																																		.																										.	.	.	.
Template Sequence		D	R	R	E	T	F	K	E	D	V	H	Y	I	R	R	L	I	S	L	R	K	A	H	P	A	F	R	L	R	S	A	A	.	D	I	Q	R	H	L	E	C	L	T	L	K	E	H	L	I	A	Y	R	L	Y	D	L	D	E	.	.	.	.	V	D	E	W	K	D	I	I	V	I	H	H	A	S	P	D	S	V
Template Known Secondary structure							T																		G	G	G	G			S			.													S	S										T	T	.	.	.	.	T		S	S	S									S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																		.																										.	.	.	.
Template SS confidence
		594	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.		.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650					.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.
		619	620	.	.	.	.		.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.			.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.														.	.
Query SS confidence								.														.	.
Query Sequence		E	I	V	L	P	A	.	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	.	.	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation								.														.	.
Alig confidence								.														.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	W	R	L	P	N	D	I	P	Y	R	L	L	C	D	P	S	G	F	Q	E	D	P	T	E	I	K	K	T	V	A	V	N	G	I	G	T	V	I	L	Y
Template Known Secondary structure						S	S		S								T	T											S						S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		669	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.