Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 533 % Identity 24% Template c2by0A_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:maltooligosyltrehalose trehalohydrolase; PDBTitle: is radiation damage dependent on the dose-rate used during2 macromolecular crystallography data collection Resolution 1.55 Å

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		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.			.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure																.	.
Query SS confidence																.	.
Query Sequence		A	I	G	K	P	A	P	L	G	A	H	Y	D	G	.	.	Q	G	V	N	F	T	L	F	S	A	H	A	E	R	V	E	L	C	V	F	D	A	N	G	Q	E	H	R	Y	D	L	P	G	H	S	G	D	I	W	H	G	Y	L	P	D	A	R	P	G	L	R	Y	G	Y	R	V	H	G	P	W	Q	P	A	E
Query Conservation																.	.
Alig confidence																.	.																				.	.	.	.	.																					.														.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.	.																					.														.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	H	D	P	R	T	R	L	G	A	T	P	L	P	G	G	A	G	T	R	F	R	L	W	T	S	T	A	R	T	V	A	V	R	V	.	.	.	.	.	N	G	T	E	H	V	X	T	S	L	G	G	G	I	Y	E	L	E	L	P	.	V	G	P	G	A	R	Y	L	F	V	L	D	G	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S			G	G	G		S						G	G	G	T									S	S		S	S						.	.	.	.	.	T	T										T	T							S	.			T	T								T	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.																					.														.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		18	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.						.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.		.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	H	R	F	N	P	A	K	L	L	I	D	P	C	A	R	Q	I	D	G	E	F	K	D	N	P	L	L	H	A	G	H	N	E	P	D	Y	R	D	N	A	A	I	A	P	K	C	V	V	V	V	D	H	Y	D	W	E	D	D	A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	V	P	T	P	D	P	Y	A	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	P	D	G	V	H	G	E	A	E	V	V	D	F	G	T	F	D	W	T	D	A	D	W	H	G	I	K	L	A	D	C	V	F	Y	E	V	H	V	G	T	F	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.						T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T		T	T	S							T	T	S	S					T	T						G	G	G												S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									86	.	.	.	90	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	R	A	A	.	.	A	E	K	L	P	Y	L	K	E	L	G	V	T	A	I	Q	V	X	P	L	A	A	F	D	G	Q	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	Y	D	G	A	A	F	Y	A	P	Y	A	P	Y	G	R	.	.	.	.	.	P	E
Template Known Secondary structure		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S					.	.		T	T								T													S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T									G	G	G			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		139	140										.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.										.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.						.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R
Query Conservation
Alig confidence																																	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	L	X	A	L	V	D	A	A	H	R	L	G	L	G	V	F	L	D	V	V	Y	N	H	F	G	P	S	G	N	Y	.	.	.	.	.	L	S	S	Y	A	P	S	Y	F	T	D	R	F	S	.	.	.	.	.	.	.	S	A	W	G	X	G	L	D	Y	A	E	P	H	X	R	R	Y	V	T	G	N	A	R
Template Known Secondary structure													T	T										S				S	S	S			.	.	.	.	.						G	G	G							.	.	.	.	.	.	.		S	S	S					T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		194	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.						.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.								.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R
Query Conservation
Alig confidence																																							.	.																										.	.	.
Template Conservation																																							.	.																										.	.	.
Template Sequence		X	W	L	R	D	Y	H	F	D	G	L	R	L	D	A	T	P	Y	X	T	D	D	S	E	T	H	I	L	T	E	L	A	Q	E	I	H	E	.	.	L	G	G	T	H	L	L	L	A	E	D	H	R	N	L	P	D	L	V	T	V	N	H	L	D	.	.	.	G	I	W	T	D	D	F	H	H	E	T	R	V
Template Known Secondary structure										S					T	T	G	G	G					S	S	S												T	.	.	T		S										S			T					T	S			S	.	.	.					T
Template Predicted Secondary structure																																							.	.																										.	.	.
Template SS confidence
		262	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.			.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.				.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		403	.	.	.	.	.	.									410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence									.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	W	L	H	Y	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S
Query Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	T	G	E	Q	E	G	Y	Y	A	G	Y	R	G	G	A	E	A	L	A	Y	T	I	R	R	G	W	R	Y	E	G	Q	F	W	A	V	K	G	E	E	H	E	R	G	H	P	S	D	A	L	E	A	P	N	F	V	Y	C	I	Q	N	H	D	Q	I	G	N	R	P	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S	G	G	G	G	G				S											S	S	S									T	T										T	T			G	G	G					S								T	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.
		475	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	E	R	L	H	Q	S	D	G	V	T	L	H	E	Y	R	G	A	A	A	L	L	L	T	L	P	X	T	P	L	L	F	Q	G	Q	E	W	A	A	S	T	P	F	Q	F	F	S	D	H	A	G	E	L	G	Q	A	V	S	E	G	R	K	K	E	F	D	V	P	D	P	Q	A	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.			G	G	G	S	T	T																S	S	S						T	T	G	G	G	T		S	S																													T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										409	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
					534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.					.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.												.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.												.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	.	.	.	.	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R
Query Conservation		.	.	.												.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.												.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	T	F	L	N	S	K	L	N	W	A	E	R	E	G	G	E	H	A	R	T	L	R	L	Y	R	D	L	L	R	L	R	R	E	D	P	V	L	H	N	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	R	E	N	L	T	T	G	H	D	G	D	V	L	W	V	R	T	V	T	G	A	G	E
Template Known Secondary structure							T	S			G	G	G	G	G	S																					T	T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G							T	T									T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530																.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.
		607	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.				620	.	.	.		.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.					.
Query SS confidence															.	.	.					.
Query Sequence		F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	.	.	.	I	V	L	P	.	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V
Query Conservation															.	.	.					.
Alig confidence															.	.	.					.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.
Template Sequence		R	V	L	L	W	N	L	G	Q	D	T	R	A	V	A	E	V	K	L	P	F	T	V	P	R	R	L	L	L	H	T	E	G	R	.	.	.	.	.	E	D	L	T	L	G	A	G	E	A	V	L	V
Template Known Secondary structure									S	S	S				G	G	G	S			S	S										T	T			.	.	.	.	.	S	S	S				T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.						.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.