Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 39 Aligned Residues 430 % Identity 20% Template c1wzaA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-amylase a; PDBTitle: crystal structure of alpha-amylase from h.orenii Resolution 1.60 Å

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		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190									.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.							.	.										.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.							.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	H	G	T	Y	Y	E	I	F	V	R	S	F	Y	D	S	D	G	D	G	I	.	.	.	.	G	D	L	K	G	I	.	.	I	E	K	L	D	Y	L	N	D	G	D	P	E	T	I	A	D	L	G	V	N	G	I	W	L	M	P	I	F	K	S	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H
Template Known Secondary structure												G	G	G	S			S	S	S	S	S		.	.	.	.							.	.			T							S		T	T			S	S				S											S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.							.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		29	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50					.	.	.	.	.	.			.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.												90	.
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.																							.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	F
Query Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Y	D	V	T	D	Y	Y	K	I	N	P	D	Y	G	T	.	.	.	.	.	L	E	D	F	H	K	L	V	E	A	A	H	Q	R	G	I	K	V	I	I	D	L	P	I	N	H	T	S	E	R	H	P	W	F	L	K	A	S	R	D	K	N	S	E	Y	R	D	Y	Y	V	W	A	G	P	D	T	D	T	K
Template Known Secondary structure				S		S							G	G	G			.	.	.	.	.														T	T										S	B			T	T	S								T		T	T		T	T	G	G	G	B		B			S
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.						.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I
Query Conservation
Alig confidence																																																		.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		E	T	K	L	D	G	G	R	V	W	H	Y	S	P	T	G	M	Y	Y	G	Y	F	W	S	G	M	P	D	L	N	Y	N	N	P	E	V	Q	E	K	V	I	G	I	A	K	Y	W	L	.	K	Q	G	V	D	G	F	R	L	D	G	A	M	H	I	F	P	P	A	Q	Y	D	K	N	F	T	W	W	E	K	F
Template Known Secondary structure		B		S	S	S		B		S					T	T						S	S		T	T	S		B	B		T	T	S																.		T	T											T	T	S		G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		167	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.		.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.
		358	.		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.
Query SS confidence				.
Query Sequence		Q	N	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I
Query Conservation				.
Alig confidence				.																										.																																	.
Template Conservation																														.																																	.
Template Sequence		R	Q	E	I	E	E	V	K	P	V	Y	L	V	G	E	V	W	D	I	S	E	T	V	A	P	Y	F	K	.	Y	G	F	D	S	T	F	N	F	K	L	A	E	A	V	I	A	T	A	K	A	G	F	P	F	G	F	N	K	K	A	K	.	H	I	Y	G	V	Y	D	R	E	V	G	F	G	N	Y	I	D	A
Template Known Secondary structure						T	T	T	S										S						G	G	G	G	T	.	T	T		S			B															T		S									.										T		T	T	S				B
Template Predicted Secondary structure																														.																																	.
Template SS confidence
		246	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.		.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.		.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D
Query Conservation
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	F	L	T	N	H	D	Q	N	R	I	L	D	Q	L	G	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	N	K	A	R	V	A	A	S	I	Y	L	T	L	P	G	N	P	F	I	Y	Y	G	E
Template Known Secondary structure			B	S			T	T	S							T	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T	S	S	S						T	T	G
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
		517	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	I	G	M	R	G	Q	G	P	H	E	V	I	R	E	P	F	Q	W	Y	N	G	S	G	E	G	E	T	Y	W	E	P	A	M	Y	N	D	G	F	T	S	V	E	Q	E	E	K	N	L	D	S	L	L	N	H	Y	R	R	L	I	H	F	R	N	E	N	P	V	F	Y	T	G	K	I	E	I	I	N	G	G
Template Known Secondary structure		G	G	T					S	S					T						S	S	S			T	T				S	S			T	T	T	T	T	T							T	T		T	T	S																T					S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
		576	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.					.	.	.	.	.	.	650	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.	.
Query Sequence		N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	.	.	.	.	V	W	Q	G	P	A	H	G
Query Conservation																																																																						.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	V	V	A	F	R	R	Y	N	D	K	R	D	L	Y	V	Y	H	N	L	V	N	R	P	V	K	I	K	V	A	S	G	N	W	T	L	L	F	N	S	G	D	K	E	I	T	P	V	E	D	N	N	K	L	M	Y	T	I	P	A	Y	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T									S	S										S	S	S								S	S								S	S	S	S								S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																			446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		652	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	C	V	F	Q	R
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		T	I	V	L	E	K
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		509	510	.	.	.	.