Job Description P15067 Confidence 97.82% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 136 Aligned Residues 316 % Identity 13% Template c1r46B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alpha-galactosidase a; PDBTitle: structure of human alpha-galactosidase Resolution 3.25 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.		.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.
Query SS confidence																																														.
Query Sequence		L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	.	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H
Query Conservation																																														.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	K	D	A	G	Y	E	Y	L	C	I	D	D	C	W	M	A	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	D	S	E	G	R	L	Q	A	D	P	Q	R	F	P	H	G	.	.	.	.	.	.	.	I	R	Q	L	A	N	Y	V	H	S	K	G	L	K	L	G	I	Y	A	D	V	G	N
Template Known Secondary structure						T								S	S		B		S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	S				B		T	T	T		T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	T	T									T	T									S	S	S
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.															100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.								.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		267	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template Sequence		K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	C	A	G	F	P	G	S	F	G	Y	Y	D	I	D	A	Q	T	F	A	D	W	.	G	V	D	L	L	K	F	D	G	C	Y	C	D	S	L	E	N	L
Template Known Secondary structure		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S	B			T	T	T												.	T										S		S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.
Template SS confidence
		140																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.		.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
		347	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K
Query Conservation
Alig confidence															.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation															.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	D	G	Y	K	H	M	S	L	A	L	N	R	.	.	.	T	G	R	S	I	V	Y	S	C	E	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	L	Y	M	W	P	F	Q	K	P
Template Known Secondary structure															.	.	.			S									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure															.	.	.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.				.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
		427	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S
Query Conservation
Alig confidence																																																																		.	.
Template Conservation																																																																		.	.
Template Sequence		N	Y	T	E	I	R	Q	Y	C	N	H	W	R	N	F	A	D	I	D	D	S	W	K	S	I	K	S	I	L	D	W	T	S	F	N	Q	E	R	I	V	D	V	A	G	P	G	G	W	N	D	P	D	M	L	V	I	G	N	F	G	L	S	W	N	.	.	Q	Q	V	T	Q	M	A	L	W	A	I	M	A	A
Template Known Secondary structure							T	T	T		S					S					S	S													T	T	T	T	T						B	T	T	B							B		T	T	S	S	S	S				.	.												T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.			.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.
		507	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.			.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																															.	.
Query SS confidence																																															.	.
Query Sequence		Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	.	.	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A
Query Conservation																																															.	.
Alig confidence			.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.
Template Conservation			.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	.	.	.	.	L	F	M	S	N	D	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	H	I	S	P	Q	A	K	A	L	L	Q	D	K	D	V	I	A	I	N	Q	D	P	L	G	K	Q	G	Y	Q	L	R	Q	G	D	N	F	E	V	W	E	R	P	L	S	G
Template Known Secondary structure			.	.	.	.					S		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S																			T		T	T										S	S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		293					.	.	.	.	.	.	300																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.			.	.	.	.	620	.	.	.												.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.					.	.	640	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Query Sequence		Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	.	.	E	V	T	E	I	V	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	.	.	.	.	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G
Query Conservation																																	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	W	A	V	A	M	I	N	R	Q	E	I	G	G	P	R	S	Y	T	I	A	V	A	S	L	G	K	G	V	A	C	N	P	A	C	F	I	T	Q	L	L	P	V	K	R	K	L	G	F	Y	E	W	T	S	R	L	R	S	H	I
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												S	S	S								S	T	T	T	B	T	T	T	B	S	S	S									S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		347																				.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.
		648	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		N	P	T	G	T	V	L	L	Q
Template Known Secondary structure			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		408	.	410	.	.	.	.	.	.