Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 456 % Identity 20% Template c1jgiA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:amylosucrase; PDBTitle: crystal structure of the active site mutant glu328gln of2 amylosucrase from neisseria polysaccharea in complex with3 the natural substrate sucrose Resolution 2.00 Å

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		148	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F
Query Conservation
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	N	K	Q	V	G	G	V	C	Y	V	D	L	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	L	K	G	L	.	.	K	D	K	I	P	Y	F	Q	E	L	G	L	T	Y	L	Y	L	M	P	L	F	K	C	P	E	G	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	G	Y	A	V	S	S	Y	R
Template Known Secondary structure			T	T													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S					.	.			T								T		S								B				S	S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	S		S		S	S
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		95	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.												110	.	.	.	.	.			.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.									.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.
Template Sequence		D	V	N	P	A	L	G	T	.	.	.	.	.	I	G	D	L	R	E	V	I	A	A	L	H	E	A	G	I	S	A	V	V	D	F	I	F	N	H	T	S	N	E	H	E	W	A	Q	R	C	A	A	G	D	P	L	F	D	N	F	Y	Y	I	F	P	D	R	R	M	P	D	Q	Y	D	R	T	L	R	E	I
Template Known Secondary structure		S	B		T	T	T			.	.	.	.	.														T	T										S				T	T	S									T		G	G	G	T	T	S	B				S	S	S								T	S				S
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.
Template SS confidence
		154	.	.	.	.	.	160	.						.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
																				296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.						350	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	.	.	.	.	.	D	A	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.																								.	.	.	.	.
Template Conservation																																																		.
Template Sequence		F	P	D	Q	H	P	G	G	F	S	Q	L	E	D	G	R	W	V	W	T	T	F	N	S	F	Q	W	D	L	N	Y	S	N	P	W	V	F	R	A	M	A	G	E	M	L	F	L	A	.	N	L	G	V	D	I	L	R	M	D	A	V	A	F	I	W	K	Q	M	G	T	S	C	E	N	L	P	Q	A	H	A
Template Known Secondary structure			T	T	T		S	T	T					T	T	S						S	S		T	T				B		T	T	S																.	T	T	T								T	G	G	G	S				T	T	S		S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																		.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.		.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
		353	.	.	.	.	.	.			360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		L	F	T	A	I	Q	N	.	.	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	I	R	A	F	N	A	V	M	R	I	A	A	P	A	V	F	F	K	S	Q	A	I	V	H	P	D	Q	V	V	Q	Y	I	G	Q	D	E	C	Q	I	G	Y	N	P	L	Q	M	A	L	L	W	N	T	L	A	T	R	E	V	.	.	.	.	.	.	.	N	L	L	H	Q	A	L	T	Y	R	H	N	L	P
Template Known Secondary structure															T	T									S						G	G	G	B	S	T	T	S	B	S																					.	.	.	.	.	.	.										S
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.								.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.		.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Query Sequence		L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	.	L	G	G	S	L	D	L
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.
Template Conservation
Template Sequence		E	H	T	A	W	V	N	Y	V	R	S	H	D	D	I	G	W	T	F	A	D	E	D	A	A	Y	L	G	I	S	G	Y	D	H	R	Q	F	L	N	R	F	F	V	N	R	F	D	G	S	F	A	R	G	V	P	F	Q	Y	N	P	S	T	G	D	C	R	V	S	G	T	A	A	A	L	V	G	L	A	Q	D
Template Known Secondary structure		T	T							S			S	S		B												T	T															T	T		S	T	T												T	T	T														T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
		489	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.							.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540										.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	.	.	.	.	.	.	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A
Query Conservation																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		D	P	H	A	V	D	R	I	K	L	L	Y	S	I	A	L	S	T	G	G	L	P	L	I	Y	L	G	D	E	V	G	T	L	N	D	D	D	W	S	Q	D	S	N	K	S	D	D	S	R	W	A	H	R	P	R	Y	N	E	A	L	Y	A	Q	R	N	D	P	S	T	A	A	G	Q	I	Y	Q	D	L	R	H
Template Known Secondary structure			T	T															S	S	S						T	T	G	G	G	T					S	S	G	G	G		T	T	T	T	T		G	G	G	G	G										T	T	T	T		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
		554	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.			.	.	.	.	.	.	630	.
Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Query SS confidence																																																																								.	.
Query Sequence		L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	.	.	A	G	E	W	H	A	I	P
Query Conservation																																																																								.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	I	A	V	R	Q	S	N	P	R	F	D	G	G	R	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	F	N	T	N	N	K	H	I	I	G	Y	I	R	N	N	A	L	L	A	F	G	N	F	S	E	Y	P	Q	T	V	T	A	H	T	L	Q	A	M	P	F	K	A	H
Template Known Secondary structure										G	G	G		S	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S		T	T							T	T	T								S	S	S						T	T	T	T	T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		541	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
		632	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		D	L	I	G	G	K	T	V	S	L	N	Q	D	L	T	L	Q	P	Y	Q	V	M	W	L	E
Template Known Secondary structure			T	T	T						S	S	S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		602	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.