Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 102 Aligned Residues 417 % Identity 20% Template c1iv8A_ PDB info PDB header:isomerase Chain: A: PDB Molecule:maltooligosyl trehalose synthase; PDBTitle: crystal structure of maltooligosyl trehalose synthase Resolution 1.90 Å

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		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K
Query Conservation
Alig confidence								.	.								.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.								.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		F	N	F	G	D	V	.	.	I	D	N	L	W	Y	F	.	D	L	G	V	S	H	L	Y	L	S	P	V	L	M	A	S	P	G	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	Y	D	V	I	D	H	S	R	I	N	D	E	L	G	G	.	.	.	.	.	E	K	E	Y	R	R	L	I	E	T	A	H	T
Template Known Secondary structure		B						.	.			T	T	T	T		.																	T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S									T	T	T	T		.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure								.	.								.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		14	.	.	.	.	.			20	.	.	.	.	.	.		.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.										.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.						.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270												.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	G	L	G	I	I	Q	D	I	V	P	N	H	M	A	V	N	S	L	N	W	R	L	M	D	V	L	M	G	S	Y	Y	T	Y	F	D	F	F	P	E	D	D	K	I	R	L	P	I	L	G	E	D	L	D	T	V	I	S	K	G	L	L	K	I	V	K	D	G	D	E	Y	F	L	E	Y	F	K	W	K	L
Template Known Secondary structure		T	T										S						T	T													G	G	G	B		B		T	T		S	S							S	S								T	T								S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.
																		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.			.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	.	.	G	R	T	P	E	F	R
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																								.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.														.	.
Template Conservation																																																											.
Template Sequence		P	L	T	E	V	G	N	D	I	Y	D	T	L	Q	K	Q	N	Y	T	L	M	S	W	K	N	P	P	S	Y	R	R	F	F	D	V	N	T	L	I	G	V	N	V	E	D	H	V	F	Q	E	S	H	S	I	L	D	L	.	D	V	D	G	Y	R	I	D	H	I	D	G	L	Y	D	P	E	K	Y	I	N	D
Template Known Secondary structure				S				S	S						T	T	S	S						T	T	S			S	B				T	T							B											T			T	T	S	.			S					T	T	G	G	G		S
Template Predicted Secondary structure																																																											.
Template SS confidence
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.		.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.
Predicted Secondary structure																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template Sequence		L	R	S	I	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	N	I	I	I	V	E	K	I	L	G	F	Q	E	E	L	K	.	.	.	.	L	N	S	D	G	T	T	G	Y	D	F	L	N	Y	S	N	L	L	F	N	F	N	Q	E	I	M	D	S	I	Y	E	N	F	T	A	E	K	I	S	I	S	E	S
Template Known Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												T	T					.	.	.	.	S	S	S	S			S	S									G	G	G															T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.
Template SS confidence
		243	.	.	.	.												.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.					.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.
										422	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	K	I	K	A	Q	I	I	D	E	L	F	S	Y	E	V	R	L	A	S	Q	L	G	I	S	Y	D	I	L	R	D	Y	L	S	C	I	D	V	Y	R	T	Y	A	N	Q	I	V	K	E	C	D	K	T	N	E	I	E	E	A	T	K	R	N	P	E	A	Y	T	K	L	Q	Q	Y	M	P	A	V	Y	A	A
Template Known Secondary structure													S	T	T	T								T	S														S	S			S	T	T				G	G	G	T	T	T	S																		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		309	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.
																																													435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	E	D	T	F	L	F	R	Y	N	R	L	I	S	I	N	E	V	G	S	D	L	R	Y	Y	K	I	S	P	D	Q	F	H	V	F	N	Q	K	R	R	G	K	I	T	L	N	A	T	S	T	H	D	T	K	F	S	E	D	V	R	M	K	I	S	V	L	S	E	F	P	E	E	W	K	N	V	E	E	W	H
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	G	G	G	T			S	S	G	G	G			T	T			T	T																	T	T							S			S	S		S	S										G	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		392	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
																447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																														.		.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.		.
Template Sequence		S	I	I	N	P	K	V	S	R	N	D	E	Y	R	Y	Y	Q	V	L	V	G	S	F	Y	E	G	F	S	N	D	F	E	R	I	Q	H	M	I	S	V	R	E	A	.	I	.	N	T	S	W	R	N	Q	N	K	E	Y	E	N	R	V	M	E	L	V	E	E	T	F	T	N	K	D	F	I	K	S	F	M	K
Template Known Secondary structure				S			S	S																	T	T		S		S											T	T	T		.		.				S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																													.		.
Template SS confidence
		473	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.		.		.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
																		501	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.																			.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	A	S	S	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	E	S	I	R	R	I	G	M	I	K	S	L	S	L	V	A	L	K	I	M	S	A	G	I	P	D	F	Y	Q	G	T	E	I	W	R	Y	L	L	T	D	.	.	.	.	.	.	P	D	N	R	V	P	V	D	F	K	K	L	H	E	I	L	E	K	S	K	F	E	K	N	M	L	E	S	M	D	D	G	R
Template Known Secondary structure																							S	S	S						T	T	T	T	S						S	T	.	.	.	.	.	.	T	G	G	G														T					T						G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		555	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.							.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.
		547	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.		.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.			.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.													.	.
Query SS confidence																				.													.	.
Query Sequence		L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	.	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	.	.	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P
Query Conservation																				.													.	.
Alig confidence																				.													.	.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	K	M	Y	L	T	Y	L	L	S	L	R	K	Q	L	A	E	D	F	L	K	G	E	Y	K	G	L	D	L	E	E	G	L	C	G	F	I	R	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	I	L	V	I	I	K	T	K	G	S	V	N	Y	K	L	K	L	E
Template Known Secondary structure																T							S									T	T							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T							S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		631	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		624	.	.		.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.
Query SS confidence					.
Query Sequence		A	G	E	.	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V
Query Conservation					.
Alig confidence					.					.	.
Template Conservation										.	.
Template Sequence		E	G	A	I	Y	T	D	V	.	.	L	T	G	E	E	I	K	K	E	V	Q	I	N	E	L	P	R	I	L	V	R	M
Template Known Secondary structure		S	S						T	.	.	T	T						S						S	S
Template Predicted Secondary structure										.	.
Template SS confidence
		691	.	.	.	.	.	.	.			.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720