Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 16 Aligned Residues 508 % Identity 23% Template c1ehaA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycosyltrehalose trehalohydrolase; PDBTitle: crystal structure of glycosyltrehalose trehalohydrolase2 from sulfolobus solfataricus Resolution 3.00 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	G	A	H	Y	D	G	Q	G	V	N	F	T	L	F	S	A	H	A	E	R	V	E	L	C	V	F	D	A	N	G	Q	E	H	R	Y	D	L	P	G	H	S	G	D	I	W	H	G	Y	L	P	D	A	R	P	G	L	R	Y	G	Y	R	V	H	G	P	W	Q	P	A	E	G	H	R	F	N	P	A	K	L
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	A	Y	K	I	D	G	N	E	V	I	F	T	L	W	A	P	Y	Q	K	S	V	K	L	K	V	.	.	.	.	L	E	K	G	L	Y	E	M	E	R	D	E	K	G	Y	F	T	I	T	L	N	N	V	K	V	R	D	R	Y	K	Y	V	L	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	S	E
Template Known Secondary structure			S					S	S									T	T		S			B		B	B	.	.	.	.	S	S	S		B							T	T	S							S	S			S									T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.					.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.													.	.	.
		92	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	D	P	C	A	R	Q	I	D	G	E	F	K	D	N	P	L	L	H	A	G	H	N	E	P	D	Y	R	D	N	A	A	I	A	P	K	C	V	V	V	V	D	H	Y	D	W	E	D	D	A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L	T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.									.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.									.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	P	D	P	A	S	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Q	P	E	G	V	H	G	P	S	Q	I	I	Q	E	S	.	K	E	F	N	N	E	T	F	.	.	L	K	K	E	D	L	I	I	Y	E	I	H	V	G	T	F	T	P	E	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					T	T		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S	S	S	T	T	S									.					S			S	.	.			S	S	S								T	T	T	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.									.	.																				.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		66	.	.	.	70	.	.																					.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.		.	90	.	.	.	.	.	.			.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.
		172	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	G	T	F	E	G	V	.	.	I	R	K	L	D	Y	L	K	D	L	G	I	T	A	I	E	I	M	P	I	A	Q	F	P	G	K	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	Y	D	G	V	Y	L	Y	A	V	Q	N	S	Y	G	G	.	.	.	.	.	P	E	G	F	R	K	L	V	D	E	A
Template Known Secondary structure		.	.		S					.	.			T								T										B			S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.		S	T	T				T	T	S	B		S	T	T			.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.							.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
				116	.	.	.	120	.			.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.										150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.						.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D
Query Conservation
Alig confidence																												.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Template Conservation																												.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Template Sequence		H	K	K	G	L	G	V	I	L	D	V	V	Y	N	H	V	G	P	E	G	N	Y	M	V	K	L	.	.	.	.	.	.	G	P	Y	F	S	Q	K	Y	K	T	.	.	.	.	P	W	G	L	T	F	N	F	D	D	A	E	S	D	E	V	R	K	F	I	L	E	N	V	E	Y	W	I	K	E	Y	N	V	D
Template Known Secondary structure					T										S				S	S	S			S	T	T	T	.	.	.	.	.	.	S			S		S	S				.	.	.	.	S	S	S					S	S	S	T	T	T	T	T																S
Template Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.	.											.	.	.	.
Template SS confidence
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.							.	.	.	.	.	.	210	.	.	.					.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.			.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																									.	.
Query SS confidence																																																									.	.
Query Sequence		G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	.	.	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L
Query Conservation																																																									.	.
Alig confidence																														.	.	.	.																								.	.
Template Conservation																														.	.	.	.
Template Sequence		G	F	R	L	D	A	V	H	A	I	I	D	T	S	P	K	H	I	L	E	E	I	A	D	V	V	H	K	.	.	.	.	Y	N	R	I	V	I	A	E	S	D	L	N	D	P	R	V	V	N	P	K	E	K	V	G	Y	N	I	D	A	Q	W	V	D	D	F	H	H	S	I	H	A	Y	L	T	G	E	R	Q
Template Known Secondary structure						T	T	G	G	G					S	S	S													.	.	.	.		T									S			T	T	T	T			T	T	T	T					S																S				S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.					.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	Y	Y	T	D	F	G	N	L	D	D	I	V	K	S	Y	K	D	V	F	V	Y	D	G	K	Y	S	N	F	R	R	K	T	H	G	E	P	V	G	E	L	D	G	C	N	F	V	V	Y	I	Q	N	H	D	Q	V	G	N	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		G	G	G	G	G													S	S		S							T	T	T	T									S			G	G	G					S								T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	E	R	I	I	K	L	V	D	R	E	S	Y	K	I	A	A	A	L	Y	L	L	S	P	Y	I	P	M	I	F	M	G	E	E	Y	G	E	E	N	P	F	Y	F	F	S	D	F	S	D	S	K	L	I	Q	G	V	R	E	G	R	K	K	E	N	G	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				S	G	G	G	S														T	S	S	S						T	T	G	G	G	T													S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
												534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	D	P	Q	D	E	S	T	F	N	A	S	K	L	S	W	K	.	I	D	E	E	I	F	S	F	Y	K	I	L	I	K	M	R	K	E	L	S	I	A	C	D	R	R	V	N	V	V	N	G	E	N	W	L	I	I	K	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S		T	T	S						T	T	S					.																				T		S	S										S	S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																				.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		451	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.		.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
		604	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	D	R	F	L	I	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q
Query Conservation
Alig confidence		.																						.	.																					.
Template Conservation		.																						.	.																					.
Template Sequence		.	R	E	Y	F	S	L	Y	V	F	S	K	S	S	I	E	V	K	Y	S	G	T	.	.	L	L	L	S	S	N	N	S	F	P	Q	H	I	E	E	G	K	Y	E	F	.	D	K	G	F	A	L	Y	K
Template Known Secondary structure		.	S	S							S	S	S										B	.	.					S	S	S				S	B			S	S					.		S
Template Predicted Secondary structure		.																						.	.																					.
Template SS confidence
			509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.			530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.		550	.	.	.	.	.	.	.