Job Description P15067 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:29 GMT 2012 Rank 18 Aligned Residues 528 % Identity 19% Template c1ea9D_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: D: PDB Molecule:cyclomaltodextrinase; PDBTitle: cyclomaltodextrinase Resolution 3.2 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.			30	.	.	.	.	.	.	.				.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.					.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
Predicted Secondary structure																					.	.									.	.	.																			.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.									.	.	.																			.	.	.	.
Query Sequence		P	L	G	A	H	Y	D	G	Q	G	V	N	F	T	L	F	S	A	H	.	.	A	E	R	V	E	L	C	V	.	.	.	F	D	A	N	G	Q	E	H	R	Y	D	L	P	G	H	S	G	D	.	.	.	.	I	W	H	G	Y	L	P	D	A	R	P	G	L	R	Y	G	Y	R	V	H	G	P	W	Q	P	A
Query Conservation																					.	.									.	.	.																			.	.	.	.
Alig confidence																					.	.									.	.	.																			.	.	.	.																						.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Template Sequence		N	F	S	Y	A	Y	N	G	T	T	V	H	L	R	I	R	T	K	K	D	D	M	T	A	V	Y	A	L	A	G	D	K	Y	M	W	D	H	T	M	E	Y	V	P	M	T	K	L	A	T	D	E	L	F	D	Y	W	E	C	E	V	T	P	P	Y	R	R	V	K	Y	G	F	L	L	Q	Q	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T						T	T							B		B	T	T			S							B		T	T	S		T	T	T													S	S	B										G	G	G						B				S	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		13	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	H	R	F	N	P	A	K	L	L	I	D	P	C	A	R	Q	I	D	G	E	F	K	D	N	P	L	L	H	A	G	H	N	E	P	D	Y	R	D	N	A	A	I	A	P	K	C	V	V	V	V	D	H	Y	D	W	E	D	D	A	P	P	R	T	P	W	G	S	T	I	I	Y	E	A	H	V	K	G	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	G	H	E	K	R	W	M	T	E	Y	D	F	L	T	E	P	P	A	N	P	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	F	E	Y	P	F	I	N	P	V	D	V	F	Q	P	P	A	W	V	K	D	A	I	F	Y	Q	I	F	P	E	R	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	S	S					B		S	S				S	S			S	S	S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S								G	G	G	S					T	T	T	T	S								G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.																.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	Y	L	H	P	E	I	P	V	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	N	G	D	T	R	N	D	P	E	G	T	L	P	W	G	S	A	D	P	T	P	S	C	F	F	G	G	D	L	Q	G	V	.	.	I	D	H	L	D	H	L	S	K	L	G	V	N	A	V	Y	F	T	P	L	F	K	A	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	H	K	Y	D	T	E	D	Y
Template Known Secondary structure						S		S		S	S						S	S	S				S	S							S				.	.			T		T	T	T	T	T	T	T														S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	T	T	S		S
Template Predicted Secondary structure																																			.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.			.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.												200	.	.	.	.	.	.	.	.
		227	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290											.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L	H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	D	G	D	Y
Query Conservation																																																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Q	I	D	P	Q	F	G	D	.	.	.	.	.	K	D	T	L	K	K	L	V	D	L	C	H	E	R	G	I	R	V	L	L	D	A	V	F	N	H	S	G	R	T	F	P	P	F	V	D	V	L	K	N	G	E	K	S	K	Y	K	D	W	F	H	I	R	S	L	P	L	E	V	V	D	G	I	P	T	Y
Template Known Secondary structure						T	T	T			.	.	.	.	.													T	T	T										S	B			T	T	S										T	T	T		G	G	G	G	G	B		B	S	S	S	S				S	S	S	S		S	B
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.
Template SS confidence
		209	210	.	.	.	.	.	.	.						.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		297	.	.	300	.	.			.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.
Query SS confidence								.	.
Query Sequence		H	N	W	T	G	C	.	.	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C	H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D
Query Conservation								.	.
Alig confidence								.	.																																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	T	F	A	F	E	P	L	M	P	K	L	N	T	E	H	P	D	V	K	E	Y	L	L	K	A	A	E	Y	W	I	R	E	T	G	I	D	G	W	R	L	D	V	A	N	E	V	S	H	Q	F	W	R	E	F	R	R	V	V	K	Q	.	.	.	.	.	.	A	N	P	D	A	Y	I	L	G	E	V	W	H
Template Known Secondary structure			B	S	S	S		T	T		B	B	B		T	T	S																			T							T	T	G	G	G	S															.	.	.	.	.	.			T	T									S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.							.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	N	F	P	P	L	F	A	E	W	N	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N
Query Conservation
Alig confidence														.	.	.																																									.	.
Template Conservation														.	.	.																																									.	.
Template Sequence		E	S	S	I	W	L	E	G	D	Q	F	D	.	.	.	A	V	M	N	Y	P	F	T	N	A	V	L	D	F	F	I	H	Q	I	A	D	A	E	K	F	S	F	M	L	G	K	Q	L	A	G	Y	P	R	Q	A	.	.	S	E	V	M	F	N	L	L	D	S	H	D	T	A	R	L	L	T	Q	A	D	G	D
Template Known Secondary structure				S	G	G	G	S	S	S	S		S	.	.	.	S					T	T									S	S			S		T	T													S					.	.								S	S		T	T	S							T	T	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.																																									.	.
Template SS confidence
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.				370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.			410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N	N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	R	K	M	K	L	A	V	L	F	Q	F	T	Y	F	G	T	P	C	I	Y	Y	G	D	E	V	G	L	D	G	G	H	D	.	.	.	.	.	.	P	G	C
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														S	S	S						T	T	T	T	T			S			S	T	.	.	.	.	.	.	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																								433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.							.	.	.
		535	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.
Predicted Secondary structure									.	.
Query SS confidence									.	.
Query Sequence		L	T	W	L	D	W	S	.	.	Q	A	S	S	G	L	T	A	F	T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	A	I	N
Query Conservation									.	.
Alig confidence									.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	K	C	M	E	W	D	E	T	K	H	D	K	D	L	F	A	F	Y	Q	T	V	I	R	L	R	Q	A	H	A	A	L	R	T	G	T	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	T	A	E	K	N	S	R	Q	I	A	Y	L	R	E	D	D	Q	D	T	I	L	V	V	M	N
Template Known Secondary structure									T	T	T																				T					S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		469	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.																.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.
		613	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.			.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.
Query SS confidence													.	.
Query Sequence		A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	.	.	A	G	E	W	H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q	R
Query Conservation													.	.
Alig confidence													.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	D	K	A	G	H	T	L	T	L	P	V	R	H	A	Q	W	T	H	L	W	Q	D	D	V	L	T	A	A	H	G	Q	L	T	V	K	L	P	A	Y	G	F	A	V	L	K	A
Template Known Secondary structure				T	T										S	S	S						S	S	S								S	S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		534	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580