Job Description P08200 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:00:54 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 358 % Identity 23% Template d1lwda_ SCOP info Isocitrate/Isopropylmalate dehydrogenase-like Isocitrate/Isopropylmalate dehydrogenase-like Dimeric isocitrate & isopropylmalate dehydrogenases Resolution 1.85

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	K	I	T	L	Q	N	G	K	L	N	V	P	E	N	P	I	I	P	Y	I	E	G	D	G	I	G	V	D	V	T	P	A	M	L	K	V	V	D	A	A	V	E	K	A	Y	K	G	E	R	K	I	S	W	M	E	I	Y	T	G	E	K	S	T	Q	V	Y	G	Q	D	V	W	L	P	A	E	T	L	D
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template Sequence		D	Q	R	I	K	V	A	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	V	E	M	D	G	D	E	M	T	R	I	I	W	Q	F	I	K	E	K	L	I	L	P	.	.	.	.	.	.	.	H	V	D	V	Q	L	K	Y	F	D	L	G	L	P	N	R	D	Q	T	N	D	.	.	Q	V	T	I	D	S	A	L
Template Known Secondary structure								S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	T											S							T	T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.																						.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.										10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.								.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.			.	.	.	.	60	.	.	.
		91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.										.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	I	R	E	Y	R	V	A	I	K	G	P	L	T	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	G	G	I	R	S	L	N	V	A	L	R	Q	E	L	D	L	Y	I	C	L	R	P	V	R	Y	Y	Q	G	T	P	S	P	V	K	H	P	E	L	T	D	M	V	I	F	R	E	N	S	E	D	I	Y	A
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																				.	.
Template Conservation																																																														.	.
Template Sequence		A	T	Q	K	Y	S	V	A	V	K	C	A	T	I	T	P	D	E	A	R	V	E	E	F	K	L	K	K	M	W	K	S	P	N	G	T	I	R	N	I	L	G	G	T	V	F	R	E	P	I	I	C	K	N	I	P	R	L	V	P	.	.	G	W	T	K	P	I	T	I	G	R	H	A	H	G	D	Q	Y	K
Template Known Secondary structure							S																			T		S	S															S										T	T	S			S	S	T	.	.	T			S									S	S	G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																														.	.
Template SS confidence
		64	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.			.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.				.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.
Query Sequence		G	I	E	W	K	A	D	S	A	D	A	E	K	V	I	.	.	.	K	F	L	R	E	E	M	G	V	K	K	I	R	F	P	E	H	C	G	I	G	I	K	P	C	S	E	E	G	T	K	R	L	V	R	A	A	I	E	Y	A	I	A	N	D	R	D	S	V	T	L	V	H	K	G	N	I	M	K	F	T	E
Query Conservation																	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.																																																.
Template Conservation																																																																			.
Template Sequence		A	T	D	F	V	V	D	R	A	G	T	F	K	I	V	F	T	P	K	D	G	S	S	A	K	Q	W	E	V	Y	N	F	P	A	G	G	V	G	M	G	M	Y	N	T	D	E	S	I	S	G	F	A	H	S	C	F	Q	Y	A	I	Q	K	K	W	P	.	L	Y	M	S	T	K	N	T	I	L	K	A	Y	D
Template Known Secondary structure									S	S										T	T													S	S																													T			.							T	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																			.
Template SS confidence
		142	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.		.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.		.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.							.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
Predicted Secondary structure												.																											.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.																											.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	A	F	K	D	W	G	Y	Q	L	.	A	R	E	E	F	G	G	E	L	I	D	G	G	P	W	L	K	V	K	N	P	N	T	G	K	E	.	.	.	.	.	.	I	V	I	K	D	V	I	A	D	A	F	L	Q	Q	I	L	L	R	P	A	E	Y	D	V	I	A	C	M	N	L	N	G	D	Y	I	S	D
Query Conservation												.																											.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.	.	.	.	.																							.
Template Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template Sequence		G	R	F	K	D	I	F	Q	E	I	F	E	K	H	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	D	F	D	K	Y	K	I	W	Y	E	H	R	L	I	D	D	M	V	A	Q	V	L	K	S	S	G	G	F	.	V	W	A	C	K	N	Y	D	G	D	V	Q	S	D
Template Known Secondary structure																T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T																		S					.
Template Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.
Template SS confidence
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.		.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.			.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.							.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.								.	370	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.																	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.																	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	L	A	A	Q	V	G	G	I	G	I	A	P	G	A	N	I	G	D	E	C	.	.	A	L	F	E	A	T	H	G	T	A	P	K	Y	A	G	Q	.	.	.	.	.	.	D	K	V	N	P	G	S	I	I	L	S	A	E	M	M	L	R	H	M	G	.	.	.	.	.	.	.	W	T	E	A	A	D	L	I
Query Conservation																							.	.																	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.																	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	L	A	Q	G	F	G	S	L	G	L	M	T	S	V	L	V	C	P	D	G	K	T	I	E	A	E	A	A	H	G	T	V	T	R	H	Y	R	E	H	Q	K	G	R	P	T	S	T	N	P	I	A	S	I	F	A	W	T	R	G	L	E	H	R	G	K	L	D	G	N	Q	D	L	I	R	F	A	Q	T	L
Template Known Secondary structure								T		T	T	S								T	T	S	S								S												T	T																										T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.														.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	K	G	M	E	G	A	I	N	A	K	T	V	T	Y	D	F	E	R	L	M	D	G	A	K	L	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	C	S	E	F	G	D	A	I	I	E	N	M
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	K	V	C	V	E	T	V	E	S	G	A	M	T	K	D	L	.	.	.	.	.	.	A	G	C	I	H	G	L	S	N	V	K	L	N	E	H	F	L	N	T	S	D	F	L	D	T	I	K	S	N	L
Template Known Secondary structure											T	T							.	.	.	.	.	.							T	T	S			B	T	T	T	B
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.							.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.