Job Description P25549 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:06 GMT 2012 Rank 20 Aligned Residues 276 % Identity 17% Template d1ei6a_ SCOP info Alkaline phosphatase-like Alkaline phosphatase-like Phosphonoacetate hydrolase Resolution 2.10

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		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.		.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.																										.	.	.
Query SS confidence																																																					.																										.	.	.
Query Sequence		G	K	K	P	N	V	V	V	F	L	L	D	D	V	G	W	M	D	V	G	F	N	G	G	G	V	A	V	G	N	P	T	P	D	I	D	A	V	A	S	Q	G	L	I	L	T	S	A	Y	S	Q	.	P	S	S	S	P	T	R	A	T	I	L	T	G	Q	Y	S	I	H	H	G	I	L	M	P	P	.	.	.
Query Conservation																																																					.																										.	.	.
Alig confidence						.																							.	.	.	.																					.																										.	.	.
Template Conservation						.																							.	.	.	.
Template Sequence		S	S	A	P	.	T	I	V	I	C	V	D	G	C	E	Q	E	Y	I	N	Q	A	I	Q	A	G	Q	.	.	.	.	A	P	F	L	A	E	L	T	G	F	G	T	V	L	T	G	D	C	V	V	P	S	F	T	N	P	N	N	L	S	I	V	T	G	A	P	P	S	V	H	G	I	C	G	N	F	F	F	D
Template Known Secondary structure			S	S		.							T	T												T	T	S	.	.	.	.							G	G	G	T	S									S	S													T	S									S	S
Template Predicted Secondary structure						.																							.	.	.	.
Template SS confidence
		15	.	.	.		.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40					.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
								159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	M	Y	G	Q	P	G	G	L	Q	G	L	T	T	L	P	Q	L	L	H	D	Q	G	Y	V	T	Q	A	I	G	K	W	H	M	G	E	N	K	E	S	Q	P	Q	N	V	G	F	D	D	F	R	G	F	N	S	V	S	D	M	Y	T	E	W	R	D	V	H	V	N	P	E	V	A	L	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	E	T	Q	E	E	V	L	M	N	D	A	K	Y	L	R	A	P	T	I	L	A	E	M	A	K	A	G	Q	L	V	A	V	V	T	A	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	L	R	N	L	L
Template Known Secondary structure		T	T	T	T							S	G	G	G			S										T	T								S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.																																					.	.	130	.	.	.
		233	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	D	R	S	E	Y	I	K	Q	L	P	F	S	K	D	D	V	H	A	V	R	G	G	E	Q	Q	A	I	A	D	I	T	P	K	Y	M	E	D	L	D	Q	R	W	M	D	Y	G	V	K	F	L	D	K	M	A	K	S	D	K	P	F	F	L	Y	Y	G	T	R	G	C	H	F	D	N	Y	P	N	A	K	Y
Query Conservation
Alig confidence																																																																																	.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		G	H	Q	L	K	G	I	C	F	S	A	E	K	A	D	Q	V	N	L	E	E	H	G	V	E	N	I	L	A	R	V	G	M	P	V	P	S	V	Y	S	A	D	L	S	E	F	V	F	A	A	G	L	S	L	L	T	N	E	R	P	D	F	M	Y	L	S	T	T	D	Y	V	Q	H	K	H	A	P	G	T	.
Template Known Secondary structure		T	T	T			S					S	T	T		S	S							S									T						S	S	S	T																T	T			S														S		T	T	S	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		134	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.
		313	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	G	S	S	P	A	R	T	S	Y	G	D	C	M	V	E	M	N	D	V	F	A	N	L	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	P	E	A	N	A	F	Y	A	M	M	D	S	Y	F	K	R	Y	H	E	Q	G	A	I	V	A	I	T	A	D	H	G	M	N	A	K	T	D	A	I	G	R	P	N	I	L	F	L	Q	D	L	L	D	A	Q	Y	G	A	Q	R	T	R	V	L	L	P	I	T	D	P	Y	V	V	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																				T	T								S							B		T	T	S		B															T	T	S						T	T	S		T	T			B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									213	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.
																																								338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350			.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	T	L	E	K	N	G	Q	L	D	N	T	L	.	.	I	V	F	T	S	D	N	G	P	E	A	E	V	P	P	H	G	R	T	P	F	R	G	A	K	G	S
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.																	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		H	G	A	L	G	S	Y	A	T	V	Y	L	R	D	A	V	P	Q	R	D	A	I	D	F	L	A	G	I	A	G	V	E	A	V	L	T	R	S	Q	A	C	Q	R	F	E	L	P	E	D	R	I	G	D	L	V	V	L	G	E	R	L	T	V	L	G	S	A	A	D	.	.	.	.	.	.	K	H	D	L	S
Template Known Secondary structure		G	G	G		B	S								T	T	S											T	S	T	T															T			G	G	G	S		S							T	T					S		T	T	.	.	.	.	.	.	T		B	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.							.	.	.	.	.
		378	.	380	.	.	.										.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	W	E	G	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	V	P	T	F	V	Y	W	K	G	M	I	Q	P	R	K	S	D	G	I	V	D	L	A	D	L	F	P	T	A	L
Query Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																																				.
Template Sequence		G	L	T	V	P	L	R	S	H	G	G	V	S	E	Q	K	V	P	L	I	F	N	R	K	L	V	G	L	D	G	R	L	R	N	.	F	D	I	I	D	L	A	L	N	H	L
Template Known Secondary structure		G			S							S	G	G	G								S	S		B								B	G	.	G	G									B
Template Predicted Secondary structure																																				.
Template SS confidence
		360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.		.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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