Job Description P25549 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:06 GMT 2012 Rank 14 Aligned Residues 347 % Identity 20% Template c3q3qA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alkaline phosphatase; PDBTitle: crystal structure of spap: an novel alkaline phosphatase from2 bacterium sphingomonas sp. strain bsar-1 Resolution 1.95 Å

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		78	.	80	.	.	.	.	.	.	.		.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.				.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																																																.	.	.
Query SS confidence												.																																																.	.	.
Query Sequence		L	E	K	K	T	G	K	K	P	N	.	V	V	V	F	L	L	D	D	V	G	W	M	D	V	G	F	N	G	G	G	V	A	V	G	N	P	T	P	D	I	D	A	V	A	S	Q	G	L	I	L	T	S	A	Y	S	Q	P	.	.	.	S	S	S	P	T	R	A	T	I	L	T	G	Q	Y	S	I	H	H	G
Query Conservation												.																																																.	.	.
Alig confidence												.																						.	.	.	.	.																						.	.	.
Template Conservation																																		.	.	.	.	.
Template Sequence		A	R	S	I	A	A	T	P	P	K	L	I	V	A	I	S	V	D	Q	F	S	A	D	L	F	S	E	Y	R	Q	Y	Y	.	.	.	.	.	T	G	G	L	K	R	L	T	S	E	G	A	V	F	P	R	G	Y	Q	S	H	A	A	T	E	T	C	P	G	H	S	T	I	L	T	G	S	R	P	S	R	T	G
Template Known Secondary structure					T	T	S	S			S								T	T										G	G	G		.	.	.	.	.		S									S										S	S			S									T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.
Template SS confidence
		32	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.						.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.
		154	.	.	.	.																												.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	L	M	P	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Y	G	Q	P	G	G	L	Q	G	L	T	T	L	P	Q	L	L	H	D	Q	G	Y	V	T	Q	A	I	G	K	W	H	M	G	E	N	K	E	S	Q	P	Q	N	V	G	F	D	D
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.
Template Conservation																																																																		.
Template Sequence		I	I	A	N	N	W	F	D	L	D	A	K	R	E	D	K	N	L	Y	C	A	E	D	E	S	Q	P	G	S	S	S	D	K	Y	E	A	S	P	L	H	L	K	V	P	T	L	G	G	R	M	K	A	A	N	P	A	T	R	V	V	S	V	A	G	.	K	D	R	A	A	I	M	M	G	G	A	T	A	D	Q
Template Known Secondary structure				S	S					T	T		S	S	S						T	T	B		T	T	S	T	T		B	T	T	B			B		S	T	T			S												T	T								S	.	S										T	T		S
Template Predicted Secondary structure																																																																		.
Template SS confidence
		107	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170		.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.
		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	R	G	F	N	S	V	S	D	M	Y	T	E	W	R	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	V	N	P	E	V	A	L	S	P	D	R	S	E	Y	I	K	Q	L	P	F	S	K	D	D	V	H	A	V	R	G	G	E	Q	Q	A	I	A	D	I	T	P	K	Y	M	E	D
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	W	W	L	G	G	P	Q	G	Y	V	S	Y	K	G	V	A	P	T	P	L	V	T	Q	V	N	Q	A	F	A	Q	R	L	A	Q	P	N	P	G	F	E	L	P	A	Q	C	V	S	K	D	F	P	V	Q	A	G	N	R	T	V	G	T	G	R	F	A	R	D	A	G	D	Y	K	G	F	R	I	S	P	E
Template Known Secondary structure							S	T	T					S	T	T																			T	S		B							G	G	G	G	G	G							T	T				S						B		T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		271	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.			.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.
Query SS confidence																	.	.
Query Sequence		L	D	Q	R	W	M	D	Y	G	V	K	F	L	D	K	.	.	M	A	K	S	D	K	P	F	F	L	Y	Y	G	T	R	G	C	H	F	D	N	Y	P	N	A	K	Y	A	G	S	S	P	A	R	T	S	Y	G	D	C	M	V	E	M	N	D	V	F	A	N	L	Y	K	T	L	E	K	N	G	Q	L	D	N
Query Conservation																	.	.
Alig confidence																	.	.																				.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template Sequence		Q	D	A	M	T	L	A	F	A	A	A	A	I	E	N	M	Q	L	G	K	Q	A	Q	T	D	I	I	S	I	G	L	S	A	T	D	Y	.	.	.	.	.	.	V	G	H	T	F	G	T	E	G	T	E	S	C	I	Q	V	D	R	L	D	T	E	L	G	A	F	F	D	K	L	D	K	D	G	.	.	I	D
Template Known Secondary structure																	T	T	T	T	S	S	S	S														.	.	.	.	.	.							S	S	S																								T	T	.	.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.																																			.	.
Template SS confidence
		266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.							.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.			.	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	L	I	V	F	T	S	D	N	G	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	V	V	V	L	T	A	D	H	G	G	H	D	L	P	E	R	H	R	M	N	A	M	P	M	E	Q	R	V	D	M	A	L	T	P	K	A	L	N	A	T	I	A	E	K	A	G	L	P	G	K	K	V	I	W	S	D	G	P	S	G	D	I	Y	Y	D	K	G	L	T	A	A	Q	R	A	R	V	E	T	E
Template Known Secondary structure									S											T	T	T	T		T	T						G	G	G	S													T		T	T	S						S	S	S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		338	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.
																																																												360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	E	V	P	P	H	G	R	T	P	F	R	G	A	K	G	S	T	W	E	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	K	Y	L	R	A	H	P	Q	V	Q	T	V	F	T	K	A	E	I	A	A	T	P	S	P	S	G	P	P	E	S	W	S	L	I	Q	E	A	R	A	S	F	Y	P	S	R	S	G	D	L	L	L	L	L	K	P	R	V	M	S	I	P	E	Q	A	V	M	G	S	V	A	T	H	G	S	P	W	D	T
Template Known Secondary structure									S	T	T												T	S					S		G	G	G										T			T	T	T	S		S							T	T			S	S				S	S		S								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		418	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	R	V	P	T	F	V	Y	W	K	G	M	I	Q	P	R	K	S	D	G	I	V	D	L	A	D	L	F	P	T	A	L	D	L	A	G	H	P	G	A	K	V	A	N	L	V	P	K	T	T	F	I	D	G	V	D	Q	T	S	F	F	L	G	T	N
Query Conservation
Alig confidence														.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation														.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	R	R	V	P	I	L	F	W	R	K	G	.	M	Q	H	F	E	Q	P	L	G	V	E	T	V	D	I	L	P	S	L	A	A	L	I	K	L	P	V	P	K	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	G	R	C	L	D	L	V	A	G	K	D	D
Template Known Secondary structure												T	T	.								S				G	G	G									T	T					G	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.		S							S		S	S
Template Predicted Secondary structure														.																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		498	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.		510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540									.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.