Job Description P25549 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:06 GMT 2012 Rank 12 Aligned Residues 264 % Identity 18% Template c2zktB_ PDB info PDB header:isomerase Chain: B: PDB Molecule:2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate PDBTitle: structure of ph0037 protein from pyrococcus horikoshii Resolution 2.40 Å

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		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.					.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.													.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	P	N	V	V	V	F	L	L	D	D	V	G	W	M	D	V	G	F	N	G	G	G	.	.	.	.	V	A	V	G	N	P	T	P	D	I	D	A	V	A	S	Q	G	L	I	L	T	S	A	Y	S	Q	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	S	P	T	R	A	T	I	L	T	G	Q	Y
Query Conservation																									.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.			.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																															.	.	.
Template Sequence		K	R	K	G	L	L	I	I	L	D	G	L	G	D	R	P	I	K	E	L	N	G	L	T	P	L	E	Y	A	.	.	.	N	T	P	N	M	D	K	L	A	E	I	G	I	L	G	Q	Q	D	P	I	K	P	G	Q	P	A	G	S	D	T	A	H	L	S	I	F	G	Y	D	P	Y	E	T	Y	R	G	R	G
Template Known Secondary structure											T	T	B	B				B	G	G	G	T	T	B						S	.	.	.												S							S	S	S	T	T													T	T										S
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.				.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		149	150	.	.	.	.	.	.															.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	I	H	H	G	I	L	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	P	M	Y	G	Q	P	G	G	L	Q	G	L	T	T	L	P	Q	L	L	H	D	Q	G	Y	V	T	Q	A	I	G	K	W	H	M	G	E	N	K	E	S	Q	P	Q	N	V	G	F	D	D	F	R	G	F	N	S	V	S
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	F	E	A	L	G	V	G	L	D	L	S	K	D	D	L	A	F	R	V	N	F	A	T	L	E	N	A	R	A	I	Q	E	E	V	D	I	G	V	D	F	I	F	K	T	G	H	R	A	V	L	V	L	K	G	M	S	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T					T	T																																		S	S								S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.							.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	M	Y	T	E	W	R	D	V	H	V	N	P	E	V	A	L	S	P	D	R	S	E	Y	I	K	Q	L	P	F	S	K	D	D	V	H	A	V	R	G	G	E	Q	Q	A	I	A	D	I	T	P	K	Y	M	E	D	L	D	Q	R	W	M	D	Y	G	V	K	F	L	D	K	M	.	.	.	.	.	.	A	K
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	K	V	G	D	N	D	P	H	E	A	G	K	P	P	S	K	K	V	A	E	I	L	E	E	F	V	K	K	A	Q	E	V	L	E	K	H	P	I	N	E	R	R	R	K
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T		G	G	G																							T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																					161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.
		289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	D	K	P	F	F	L	Y	Y	G	T	R	G	C	H	F	D	N	Y	P	N	A	K	Y	A	G	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	G	K	P	I	A	N	Y	L	L	I	R	G	A	G	T	Y	P	N	I	P	M	K	F	T	E	Q	W	K	V	K	A	A	G	V	I	A	V	A	L	V	K	G	V	A	R	A	V	G	F	D	V	Y	T	P	E	G	A	T	G	E	Y	N	T	N	E	M	A	K	A	K	K	A	V	E	L	L	K	D	Y
Template Known Secondary structure		T	T															S				S	S							T									S										T	T							T	T			S	S	T	T															T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		215	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.
																	316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	P	A	R	T	S	Y	G	D	C	M	V	E	M	N	D	V	F	A	N	L	Y	K	T	L	E	K	N	G	Q	L	D	N	T	L	I	V	F	T	S	D	N	G	P	E	A	E	V	P	P	H	G	R	T	P	F	R	G	A	K	G	S	T	W	E
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	F	V	F	L	H	F	K	P	T	D	A	A	G	H	D	N	K	P	K	L	K	A	E	L	I	E	R	A	D	R	M	I	G	Y	I	L	D	H	V	D	.	.	.	.	L	E	E	V	V	I	A	I	T	G	D	H	S	T	P	C	E	V	M	N	H	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S															T	T																					T	T			.	.	.	.	T	T	T								S	S	B			T	T	T	T	S		B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		295	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.					.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
		381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.												.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	V	R	V	P	T	F	V	Y	W	K	G	M	I	Q	P	R	K	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	I	V	D	L	A	D	L	F	P	T	A	L	D	L	A	G	H	P	G	A	K	V	A
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.
Template Sequence		.	G	D	P	V	P	L	L	I	A	G	G	G	V	R	T	D	D	T	K	R	F	G	E	R	E	A	M	K	G	G	L	G	R	I	R	G	H	D	I	V	P	I	M	M	D	L	M	N	R	S	E	K	F	G	A
Template Known Secondary structure		.										S	T	T					S			S		S					T	T		T	T					G	G	G									T	T
Template Predicted Secondary structure		.
Template SS confidence
			358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.