Job Description P25549 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:06 GMT 2012 Rank 10 Aligned Residues 371 % Identity 17% Template c2w8dB_ PDB info PDB header:transferase Chain: B: PDB Molecule:processed glycerol phosphate lipoteichoic acid synthase 2; PDBTitle: distinct and essential morphogenic functions for wall- and2 lipo-teichoic acids in bacillus subtilis Resolution 2.35 Å

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		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.			.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.			.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																								.	.												.	.
Query SS confidence																																																								.	.												.	.
Query Sequence		K	E	T	Q	Q	K	L	A	E	L	E	K	K	T	G	K	K	P	N	V	V	V	F	L	L	D	D	V	G	W	M	D	V	G	F	N	G	G	G	V	A	V	G	N	P	T	P	D	I	D	A	V	A	S	.	.	Q	G	L	I	L	T	S	A	Y	S	Q	.	.	P	S	S	S	P	T	R	A	T	I	L
Query Conservation																																																								.	.												.	.
Alig confidence																																											.	.	.											.	.												.	.
Template Conservation																																											.	.	.
Template Sequence		K	A	N	Y	D	V	P	N	N	V	Y	F	G	K	A	E	G	K	N	V	I	Y	V	S	L	E	S	L	Q	S	F	I	I	D	Y	K	I	D	G	K	E	.	.	.	V	T	P	F	L	N	K	L	A	H	D	N	E	T	F	Y	F	D	N	F	F	H	Q	T	G	Q	G	K	S	D	A	E	F	X	X	E
Template Known Secondary structure				T						T	T	T	T	T	T	T	T	T									T	T			G	G	G	T	T				T	T			.	.	.	S	S									S	S	S	S				S	S							T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.
Template SS confidence
		228	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.				.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.		.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.
Query SS confidence																																																					.
Query Sequence		T	G	Q	Y	S	I	H	H	G	I	L	M	P	P	M	Y	G	Q	P	G	G	L	Q	G	L	T	T	L	P	Q	L	L	H	D	Q	G	Y	V	T	Q	A	I	G	K	W	H	M	G	E	N	K	.	E	S	Q	P	Q	N	V	G	F	D	D	F	R	G	F	N	S	V	S	D	M	Y	T	E	W	R	D	V
Query Conservation																																																					.
Alig confidence														.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation														.	.	.	.	.
Template Sequence		N	S	L	Y	P	L	A	Q	G	S	V	F	.	.	.	.	.	V	N	K	A	Q	N	T	L	Q	S	V	P	A	I	L	K	S	K	N	Y	T	S	A	T	F	H	G	N	T	Q	T	F	W	N	R	N	E	X	Y	K	A	E	G	I	D	K	F	F	D	S	A	Y	Y	D	X	N	E	E	N	T	K	N	Y
Template Known Secondary structure								S	S	S				.	.	.	.	.				T	T	S									G	G	G	G	T								S	S		T	T	G	G	G									T							G	G	G	S				T	T	T	B		S	S
Template Predicted Secondary structure														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		306	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.						.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	V	N	P	E	V	A	L	S	P	D	R	S	E	Y	I	K	Q	L	P	F	S	K	D	D	V	H	A	V	R	G	G	E	Q	Q	A	I	A	D	I	T	P	K	Y	M	E	D	L	D	Q	R	W	M	D	Y	G	V	K	F	L	D	K	M	A	K	S	D	K	P	F	F	L	Y	Y	G	T	R	G	C	H
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	X	K	D	K	P	F	F	K	E	S	X	P	L	L	E	.	.	.	S	L	P	Q	P	F	Y	T	K	F	I	T	L	S	N	H
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B															.	.	.	T	S		S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Template SS confidence
																																															381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.				.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
		304	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.							.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.				.	.	370	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.
Query SS confidence													.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.
Query Sequence		F	D	N	Y	P	N	A	K	Y	A	G	.	.	.	.	.	.	S	S	P	A	R	T	S	Y	G	D	C	M	V	E	M	N	D	V	F	A	N	L	Y	K	T	L	E	K	N	G	Q	L	D	N	T	L	I	V	F	T	S	D	N	G	P	E	A	E	V	P	P	H	G	.	.	.	R	T	P	F	R	G	A
Query Conservation													.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	P	F	G	X	D	E	G	D	T	D	F	P	A	G	D	F	G	D	S	V	V	D	N	Y	F	Q	S	A	H	Y	L	D	Q	S	I	E	Q	F	F	N	D	L	K	K	D	G	L	Y	D	K	S	I	I	V	X	Y	G	D	H	Y	G	I	S	E	N	H	N	K	A	X	A	K	V	L	G	K	D	E	I
Template Known Secondary structure		T	T					B	T	T	B							S	S																												T	S		G	G	G									S		S	S		G	G	G								T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
		375	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	G	S	T	W	E	G	G	V	R	V	P	T	F	V	Y	W	K	G	M	I	Q	P	R	K	S	D	G	I	V	D	L	A	D	L	F	P	T	A	L	D	L	A	G	H	P	G	A	K	V	A	N	L	V	P	K	T	T	F	I	D	G	V	D	Q	T	S	F	F	L	G	T	N	G	Q	S	N	R	K	A
Query Conservation
Alig confidence																					.																																.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.																																.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	D	Y	D	N	A	Q	L	Q	R	V	P	L	F	I	H	A	A	G	.	V	K	G	E	K	V	H	K	Y	A	G	D	V	D	V	A	P	T	I	L	H	L	L	G	V	D	T	K	D	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	X	S	G	S	D	I	L	S	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T	B								T	T	.	S							S				G	G	G									T	T				T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.						T	T	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																					.																																.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.		.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.									.	.	.	.	.	.	.	550	.
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	H	Y	F	L	N	G	K	L	A	A	V	R	M	D	E	F	K	Y	H	V	L	I	Q	Q	P	Y	A	Y	T	Q	S	G	Y	Q	G	G	F	T	G	T	V	M	Q	T	A	G	S	S	V	F	N	L	Y	T	D	P	Q	E	S	D	S	I	G	V	R	H	I	P	M	G	V	P	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	E	H	R	E	V	I	P	F	R	N	G	D	F	I	S	P	K	Y	T	K	I	S	G	K	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	T	K	T	G	K	E	L	D	E	S	E	V	D	K	S	E	D	S	L	V	K	K	E	L	E	X	S	D	K	I	I	N	G	D	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	T								T	T	S					S	S					T	T			.	.	.	.	.	.	.	.			T	T	T			B			T	T	T	S		T																				T	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.									.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.