Job Description P25549 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:42:06 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 379 % Identity 17% Template c2w5tA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:processed glycerol phosphate lipoteichoic acid PDBTitle: structure-based mechanism of lipoteichoic acid synthesis by2 staphylococcus aureus ltas. Resolution 1.60 Å

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		69	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.				.	.	.	.	.	130	.	.	.		.	.	.	.	.	.	140	.			.
Predicted Secondary structure																																																										.	.	.										.									.	.
Query SS confidence																																																										.	.	.										.									.	.
Query Sequence		K	E	T	Q	Q	K	L	A	E	L	E	K	K	T	G	K	K	P	N	V	V	V	F	L	L	D	D	V	G	W	M	D	V	G	F	N	G	G	G	V	A	V	G	N	P	T	P	D	I	D	A	V	A	S	Q	G	.	.	.	L	I	L	T	S	A	Y	S	Q	.	P	S	S	S	P	T	R	A	.	.	T
Query Conservation																																																										.	.	.										.									.	.
Alig confidence																																											.	.	.													.	.	.										.									.	.
Template Conservation																																											.	.	.
Template Sequence		K	Q	R	Q	T	E	P	N	P	E	Y	Y	G	V	A	K	K	K	N	I	I	K	I	H	L	E	S	F	Q	T	F	L	I	N	K	K	V	N	G	K	E	.	.	.	V	T	P	F	L	N	K	L	S	S	G	K	E	Q	F	T	Y	F	P	N	F	F	H	Q	T	G	Q	G	K	T	S	D	S	E	F	T
Template Known Secondary structure		S	T	T						T	T	T	T	T	T	T	T	T									T	T			G	G	G	T	T				T	T			.	.	.	S	S								T	T		S	S					T	T							T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270				.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.
		143	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.		.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
Predicted Secondary structure																																				.																	.
Query SS confidence																																				.																	.
Query Sequence		I	L	T	G	Q	Y	S	I	H	H	G	I	L	M	P	P	M	Y	G	Q	P	G	G	L	Q	G	L	T	T	L	P	Q	L	L	.	H	D	Q	G	Y	V	T	Q	A	I	G	K	W	H	M	G	.	E	N	K	E	S	Q	P	Q	N	V	G	F	D	D	F	R	G	F	N	S	V	S	D	M	Y	T	E	W
Query Conservation																																				.																	.
Alig confidence																.	.	.	.	.																.																	.
Template Conservation																.	.	.	.	.
Template Sequence		M	D	N	S	L	Y	G	L	P	Q	G	S	A	F	.	.	.	.	.	S	L	K	G	D	N	T	Y	Q	S	L	P	A	I	L	D	Q	K	Q	G	Y	K	S	D	V	M	H	G	D	Y	K	T	F	W	N	R	D	Q	V	Y	K	H	F	G	I	D	K	F	Y	D	A	T	Y	Y	D	M	S	D	K	N	V
Template Known Secondary structure					S					S	S	S				.	.	.	.	.			S	T	T	S																						S	S		T	T	G	G	G									T							G	G	G	S				G	G	G
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320						.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	D	V	H	V	N	P	E	V	A	L	S	P	D	R	S	E	Y	I	K	Q	L	P	F	S	K	D	D	V	H	A	V	R	G	G	E	Q	Q	A	I	A	D	I	T	P	K	Y	M	E	D	L	D	Q	R	W	M	D	Y	G	V	K	F	L	D	K	M	A	K	S	D	K	P	F	F	L	Y	Y	G	T	R
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Template Sequence		V	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	K	D	K	I	F	F	K	D	S	A	N	Y	Q	A	.	.	.	K	M	K	S	P	F	Y	S	H	L	I	T	L
Template Known Secondary structure			T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	T	S		S	S
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.
Template SS confidence
		382	.	.																																														.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400				.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
		301	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.							.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure															.	.	.	.	.	.																																																													.
Query SS confidence															.	.	.	.	.	.																																																													.
Query Sequence		G	C	H	F	D	N	Y	P	N	A	K	Y	A	.	.	.	.	.	.	G	S	S	P	A	R	T	S	Y	G	D	C	M	V	E	M	N	D	V	F	A	N	L	Y	K	T	L	E	K	N	G	Q	L	D	N	T	L	I	V	F	T	S	D	N	G	P	E	A	E	V	P	P	H	G	R	T	P	F	R	G	.
Query Conservation															.	.	.	.	.	.																																																													.
Alig confidence															.	.	.	.	.	.																																																													.
Template Conservation
Template Sequence		T	N	H	Y	P	F	T	L	D	E	K	D	A	T	I	E	K	S	N	T	G	D	A	T	V	D	G	Y	I	Q	T	A	R	Y	L	D	E	A	L	E	E	Y	I	N	D	L	K	K	K	G	L	Y	D	N	S	V	I	M	I	Y	G	D	H	Y	G	I	S	E	N	H	N	N	A	M	E	K	L	L	G	E
Template Known Secondary structure		S	S		T	T					G	G	G			S					S	S																													T		S	T	T	S								S		S	S		G	G	G									T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		414	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
			374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	A	K	G	S	T	W	E	G	G	V	R	V	P	T	F	V	Y	W	K	G	M	I	Q	P	R	K	S	D	G	I	V	D	L	A	D	L	F	P	T	A	L	D	L	A	G	H	P	G	A	K	V	A	N	L	V	P	K	T	T	F	I	D	G	V	D	Q	T	S	F	F	L	G	T	N	G	Q	S	N	R
Query Conservation		.
Alig confidence		.																						.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	I	T	P	A	K	F	T	D	L	N	R	T	G	F	W	I	K	I	P	G	K	.	S	G	G	I	N	N	E	Y	A	G	Q	V	D	V	M	P	T	I	L	H	L	A	G	I	D	T	K	N	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	M	F	G	T	D	L	F	S	K	G	H	N	Q	V	V	P	F	R	N
Template Known Secondary structure											T	T	B								T	T		.											G	G	G										T				T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.		S				T	T	S	T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure																								.																															.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		494	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.		.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.									.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.
		453	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	A	E	H	Y	F	L	N	G	K	L	A	A	V	R	M	D	E	F	K	Y	H	V	L	I	Q	Q	P	Y	A	Y	T	Q	S	G	Y	Q	G	G	F	T	G	T	V	M	Q	T	A	G	S	S	V	F	N	L	Y	T	D	P	Q	E	S	D	S	I	G	V	R	H	I	P
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	I	T	K	D	Y	K	Y	V	N	G	K	I	Y	S	N	K	N	N	E	L	I	T	T	Q	P	A	D	F	E	K	N	K	K	Q	V	E	K	D	L	E	M	S	D	N	V	L	N	G	D	L	F	R	F	Y	K	N	P
Template Known Secondary structure		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S					T	T					T	T	T			B			S			T	T																						T	G	G	G	G				T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		565	.												.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.