Job Description P25549 Confidence 99.00% Date Thu Jan 5 11:42:06 GMT 2012 Rank 32 Aligned Residues 311 % Identity 19% Template c2w0yB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:alkaline phosphatase; PDBTitle: h.salinarum alkaline phosphatase Resolution 1.7 Å

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		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.														.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.					.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.
Query Sequence		T	G	K	K	P	N	V	V	V	F	L	L	D	D	V	G	W	M	D	V	G	F	N	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	V	A	V	G	N	P	T	P	D	I	D	A	V	A	S	Q	G	L	I	L	T	S	A	Y	S	.	.	.	.	Q	P	S	S	S	P	T	R	A	T	I	L
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	S	P	A	A	N	A	I	A	Y	I	V	D	G	M	G	Q	T	Q	I	S	A	A	R	Y	L	N	A	Y	K	T	A	P	E	R	F	P	L	N	V	S	P	A	E	T	P	T	G	F	D	A	F	S	S	R	G	S	M	T	T	F	P	D	D	P	Y	E	T	T	T	D	S	A	A	A	A	T	A	F	A
Template Known Secondary structure				S		S								T	T																			T	T	T	T	T	G	G	G	S	T	T	T	S			T	G	G	G	S	S												S	S		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		44	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.				.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	200	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	G	Q	Y	S	I	H	H	G	I	L	M	P	P	M	Y	G	Q	P	G	G	L	.	.	.	Q	G	L	T	T	L	P	Q	L	L	H	D	Q	G	Y	V	T	Q	A	I	G	K	W	H	M	G	E	N	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	S	Q	P	Q	N	V	G
Query Conservation																								.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.																.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	.	.	.	.	.	V	K	T	Y	N	G	A	I	G	G	V	Q	T	S	G	G	G	F	Q	R	V	D	T	V	L	E	R	A	S	A	Q	G	Y	A	T	G	L	I	T	T	T	E	A	T	H	A	T	P	A	A	F	A	A	H	V	E	D	R	G	N	Q	T	E	I	A	R	Q	Y	I	E	E	T	Q
Template Known Secondary structure			S	.	.	.	.	.					T	T		B	S					T	T	T																T											T	T	S										B	S	S	T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.
Template SS confidence
		124	.						.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.
		204	.	.	.	.	.						210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.		.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.																																											.
Query SS confidence								.	.	.	.	.																																											.
Query Sequence		F	D	D	F	R	G	.	.	.	.	.	F	N	S	V	S	D	M	Y	T	E	W	R	D	V	H	V	N	P	E	V	A	L	S	P	D	R	S	E	Y	I	K	Q	L	P	F	S	K	D	D	V	H	A	.	V	R	G	G	E	Q	Q	A	I	A	D	I	T	P	K	Y	M	E	D	L	D	Q	R	W	M	D
Query Conservation								.	.	.	.	.																																											.
Alig confidence								.	.	.	.	.																																											.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	V	I	L	G	G	Q	R	R	D	F	E	A	D	A	S	N	G	G	T	L	V	D	A	A	R	D	N	G	Y	T	I	A	E	T	A	A	E	L	D	A	V	D	D	P	P	V	L	G	L	F	S	Q	E	S	H	L	D	Y	Y	L	D	R	K	N	D	P	E	N	T	Q	P	N	L	D	A	M	V	D
Template Known Secondary structure			S							G	G	G	G	G	S	B		T	T	S	S	B								T	T						S									S	S								S	S	S												T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		199	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	G	V	K	F	L	D	K	M	A	K	S	D	K	P	F	F	L	Y	Y	G	T	R	G	C	H	F	D	N	Y	P	N	A	K	Y	A	G	S	S	P	A	R	T	S	Y	G	D	C	M	V	E	M	N	D	V	F	A	N	L	Y	K	T	L	E	K	N	G	Q	L	D	N	T	L	I	V	F	T	S	D	N
Query Conservation
Alig confidence								.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.																	.																		.	.
Template Conservation								.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.																	.																		.	.
Template Sequence		A	G	V	D	L	L	.	.	S	G	D	P	D	K	G	F	F	L	L	V	E	S	G	R	V	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	A	G	H	A	N	Y	P	A	Q	V	A	E	Q	Y	.	E	A	T	Q	V	A	G	Q	L	V	E	Y	A	E	T	T	A	.	.	E	P	T	F	L	V	S	T	G	D	H
Template Known Secondary structure								.	.				S	S													.	.	.	.	.	.	.	.							T		T	T							.																	S	.	.	S									S	S
Template Predicted Secondary structure								.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.																	.																		.	.
Template SS confidence
		279	280	.	.	.	.			.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.									.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.		.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.			.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
		358	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	P	E	A	E	V	P	P	H	G	R	T	P	F	R	G	A	K	G	S	T	W	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	.	.	.	.	.	.	.	C	G	G	L	T	L	G	R	D	S	P	Y	E	V	E	Y	D	V	L	A	A	Q	K	A	T	T	S	R	L	R	D	L	L	A	G	V	R	S	A	D	E	L	E	S	I	V	A	A	H	T	G	I	T	A	L	T	D	R	E	V	A	K	L	R	D	A	P	G	S	I	S	T
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.		S			B	S	S		S	S		S									T			S										T	T															S	S																G	G	G
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		348								.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
																	381	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	V	R	V	P	T	F	V	Y	W	K	G	M	I	Q	P	R	K	S	D	G	I	V	D	L	A	D	L	F	P	T	A	L	D	L	A	G	H	P
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.
Template Conservation																														.	.	.
Template Sequence		I	L	A	E	R	A	G	I	A	F	T	T	D	G	H	T	G	T	D	V	P	V	F	A	H	G	P	N	.	.	.	A	A	R	F	D	A	A	R	D	N	T	A	V	A	D	A	L	A	A	A	L	G	V	S
Template Known Secondary structure								T		B				S	S												S	T	T	.	.	.	G	G	G	G	S	S				T	T											T
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.
Template SS confidence
		421	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.				.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.