Job Description P15877 Confidence 99.19% Date Thu Jan 5 11:34:57 GMT 2012 Rank 17 Aligned Residues 331 % Identity 11% Template d2madh_ SCOP info 7-bladed beta-propeller YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase Methylamine dehydrogenase, H-chain Resolution UNK

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		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.						.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.					.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.																																														.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.																																														.	.	.	.
Query Sequence		A	E	T	A	S	P	E	V	M	A	D	C	P	R	R	I	I	L	P	V	N	D	G	.	.	.	.	.	R	L	I	A	I	N	A	E	N	G	K	L	C	E	T	F	A	N	K	G	V	L	N	L	Q	S	N	M	P	D	T	K	P	G	L	Y	E	P	T	S	P	P	I	I	T	.	.	.	.	D	K	T
Query Conservation																									.	.	.	.	.																																														.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	P	T	N	D	E	A	P	G	A	D	G	R	R	S	Y	I	N	L	P	A	H	H	S	A	I	I	Q	Q	W	V	L	D	A	G	S	G	S	I	L	G	H	V	N	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	P	N	P	V	A	A	H	S	G	S	E
Template Known Secondary structure														T	T								G	G	G		S									T	T	T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S							T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	V	M	A	G	S	V	T	D	N	F	S	T	R	E	T	S	G	V	I	R	G	F	D	V	N	T	G	E	L	L	W	A	F	D	P	G	A	K	D	P	N	A	I	P	S	D	E	H	T	F	T	F	N	S	P	N	S	W	A	P	A	A	Y	D	A	K	L	D	L	V	Y	L	P	M	G	V	T	T	P
Query Conservation
Alig confidence																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template Sequence		F	A	L	A	S	T	S	F	S	R	I	A	K	G	K	R	T	D	Y	V	E	V	F	D	P	V	T	F	L	P	I	A	D	I	E	L	P	D	A	P	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	V	G	P	Y	S	W	M	N	A	N	T	P	N	N	A	D	L	L	F	F	Q	F	A	.	.	.
Template Known Secondary structure										T	T	S	S	S	S											T	T	T				S						T	T				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S				T	T	S	S				T	T	S	S	B							S	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.
Template SS confidence
		80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120												.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	I	W	G	G	N	R	T	P	E	Q	E	R	Y	A	S	S	I	L	A	L	N	A	T	T	G	K	L	A	W	S	Y	Q	T	V	H	H	D	L	W	D	M	D	L	P	A	Q	P	T	L	A	D	I	T	V	N	G	Q	K	V	P	V	I	Y	A	P	A	K	T	G	N	I	F	V	L	D	R	R	N	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	G	P	A	V	G	L	V	V	Q	G	G	S	S	D	D	Q	L	L	S	S	P	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	Y	H	I	H	P	G	A	P	S	T	F	Y	L	L	C	A	Q	G	G	L	A	K	T	D	H	A	G	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S							B	T	T	T	T	B									S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S					B	T	T							S	S	S									T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															146	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.																.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.
		506	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	V	V	P	A	P	E	K	P	V	P	Q	G	A	A	K	G	D	Y	V	T	P	T	Q	P	F	S	E	L	S	F	R	P	T	K	D	L	S	G	A	D	M	W	G	A	T	M	F	D	Q	L	V	C	R	V	M	F	H	Q	M	R	Y	E	G	I	F	T	P	P	S	E	Q	G	T	L	V	F	P	G
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	A	G	A	G	L	V	G	A	M	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Template Known Secondary structure												S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		198	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.																																																																					.
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.					.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.
Query Sequence		N	L	G	M	F	E	W	G	G	I	S	V	D	P	N	R	E	V	A	I	A	N	P	M	A	L	P	F	V	S	K	L	.	.	.	.	I	P	R	G	P	G	N	P	M	E	Q	P	K	D	A	K	G	T	G	T	E	S	G	I	Q	P	Q	Y	G	V	P	Y	G	V	T	L	N	P	F	L	S	P	F	G
Query Conservation																																		.	.	.	.
Alig confidence																																		.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	A	Q	N	L	L	T	Q	P	A	Q	A	N	K	S	G	R	I	V	W	P	V	Y	S	G	K	I	L	Q	A	D	I	S	A	A	G	A	T	N	K	A	P	I	D	A	L	S	G	G	R	K	A	D	T	W	R	P	G	G	W	Q	Q	V	A	Y	L	K	S	S	D	G	I	Y	L	L	T	S	E	Q	S
Template Known Secondary structure		T	T	S				S						T	T	T	T							S	S	S									T	T										S	S							T	T					S	S	S						T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		662	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.			.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																														.	.
Query SS confidence																																																														.	.
Query Sequence		L	P	C	K	Q	P	A	W	G	Y	I	S	A	L	D	L	K	T	N	E	V	V	W	K	K	R	I	G	T	P	Q	D	S	M	P	F	P	M	P	V	P	V	P	F	N	M	G	M	P	M	L	G	G	P	I	S	T	A	G	N	.	.	V	L	F	I	A	A	T	A	D	N	Y	L	R	A	Y	N	M	S
Query Conservation																																																														.	.
Alig confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	W	K	L	H	A	A	A	K	E	V	T	S	V	T	G	L	V	G	Q	T	S	S	Q	I	S	L	G	H	D	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	A	I	S	V	A	Q	D	G	G	P	D	L	Y	A	L	S	A	G	T	E	V	L	H	I	Y	D	A	G
Template Known Secondary structure		T	T		T	T	S										T	T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S	S	S								T	T	T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		740	.	.	.	.	.	.	.	.		.	750	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure											.
Query SS confidence											.
Query Sequence		N	G	E	K	L	W	Q	G	R	.	L	P	A	G	G	Q	A
Query Conservation											.
Alig confidence											.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	D	Q	D	Q	S	T	V	E	L	G	S	G	P	Q	V
Template Known Secondary structure		T												S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.