Job Description P15877 Confidence 98.70% Date Thu Jan 5 11:34:57 GMT 2012 Rank 26 Aligned Residues 340 % Identity 15% Template d2bbkh_ SCOP info 7-bladed beta-propeller YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase Methylamine dehydrogenase, H-chain Resolution 1.75

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		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.						.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.					.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.
Query Sequence		A	S	P	E	V	M	A	D	C	P	R	R	I	I	L	P	.	.	.	.	.	V	N	D	G	R	L	I	A	I	N	A	E	N	G	K	L	C	E	T	F	A	N	K	G	V	L	N	L	Q	S	N	M	P	D	T	K	P	G	L	Y	E	P	T	S	P	P	I	I	T	.	.	.	.	D	K	T	I	V	M
Query Conservation																		.	.	.	.	.																																																		.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	I	L	E	A	P	A	P	D	A	R	R	V	Y	V	N	D	P	A	H	F	A	A	V	T	Q	Q	F	V	I	D	G	E	A	G	R	V	I	G	M	I	D	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	L	P	N	P	V	V	A	D	D	G	S	F	I	A	H
Template Known Secondary structure											T	T								G	G	G		S	S								T	T	T	T										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S							T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		22	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	S	V	T	D	N	F	S	T	R	E	T	S	G	V	I	R	G	F	D	V	N	T	G	E	L	L	W	A	F	D	P	G	A	K	D	P	N	A	I	P	S	D	E	H	T	F	T	F	N	S	P	N	S	W	A	P	A	A	Y	D	A	K	L	D	L	V	Y	L	P	M	G	V	T	T	P	D	I	W
Query Conservation
Alig confidence																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	S	T	V	F	S	R	I	A	R	G	E	R	T	D	Y	V	E	V	F	D	P	V	T	L	L	P	T	A	D	I	E	L	P	D	A	P	R	F	L	V	G	T	Y	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	M	T	S	L	T	P	D	G	K	T	L	L	F	Y	Q	F	S	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									T	T													T	T	T										T	T							S			G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G					T	T	S	S								S	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.												.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	G	N	R	T	P	E	Q	E	R	Y	A	S	S	I	L	A	L	N	A	T	T	G	K	L	A	W	S	Y	Q	T	V	H	H	D	L	W	D	M	D	L	P	A	Q	P	T	L	A	D	I	T	V	N	G	Q	K	V	P	V	I	Y	A	P	A	K	T	G	N	I	F	V	L	D	R	R	N	G	E	L	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.																								.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.																								.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	P	A	V	G	V	V	D	L	E	G	K	A	F	K	R	M	L	D	V	P	D	C	Y	H	I	F	P	T	A	P	D	T	F	F	M	H	C	R	D	G	.	.	.	.	S	L	A	K	V	A	F	G	T	E	G	T	P	E	I	T	H	T	E	V	F	H	P	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S								T	T	T	T										S									T	T							T	T	S	.	.	.	.									S	S	S											S		.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																											.	.	.	.																								.
Template SS confidence
												145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.					.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	A	P	E	K	P	V	P	Q	G	A	A	K	G	D	Y	V	T	P	T	Q	P	F	S	E	L	S	F	R	P	T	K	D	L	S	G	A	D	M	W	G	A	T	M	F	D	Q	L	V	C	R	V	M	F	H	Q	M	R	Y	E	G	I	F	T	P	P	S	E	Q	G	T	L	V	F	P	G	N	L	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	D	E	F	L	I	N	H	P	A	Y	S
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		B		S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																						210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	F	E	W	G	G	I	S	V	D	P	N	R	E	V	A	I	A	N	P	M	A	L	P	F	V	S	K	L	I	P	R	G	P	G	N	P	M	E	Q	P	K	D	A	K	G	T	G	T	E	S	G	I	Q	P	Q	Y	G	V	P	Y	G	V	T	L	N	P	F	L	S	P	F	G	L	P	C	K	Q	P	A
Query Conservation
Alig confidence																																																																														.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		Q	K	A	G	R	L	V	W	P	T	Y	T	G	K	I	H	Q	I	D	L	S	S	G	D	A	K	F	L	P	A	V	E	A	L	T	E	A	E	R	A	D	G	W	R	P	G	G	W	Q	Q	V	A	Y	H	R	A	L	D	R	I	Y	L	L	V	D	Q	R	D	E	W	R	H	K	T	A	S	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T	T	T						B	T	T	S								T	T	S	S									S	S							T	T					S	S	S						T	T	T	T											T	T		T	T	S			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		222	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		669	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.			.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																							.	.
Query SS confidence																																																							.	.
Query Sequence		W	G	Y	I	S	A	L	D	L	K	T	N	E	V	V	W	K	K	R	I	G	T	P	Q	D	S	M	P	F	P	M	P	V	P	V	P	F	N	M	G	M	P	M	L	G	G	P	I	S	T	A	G	N	.	.	V	L	F	I	A	A	T	A	D	N	Y	L	R	A	Y	N	M	S	N	G	E	K	L	W	Q
Query Conservation																																																							.	.
Alig confidence		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.
Template Conservation		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	R	F	V	V	V	L	D	A	K	T	G	E	R	L	A	K	F	E	M	G	H	E	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	I	N	V	S	Q	D	E	K	P	L	L	Y	A	L	S	T	G	D	K	T	L	Y	I	H	D	A	E	S	G	E	E	L	R	S
Template Known Secondary structure		.								T	T	T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S	S								T	T	T	T							T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
		747	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	R	L	P	A	G	G	Q	A	T	P	M	T	Y	E	V	N	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.
Template Conservation		.	.
Template Sequence		.	.	V	N	Q	L	G	H	G	P	Q	V	I	T	T	A	D	M
Template Known Secondary structure		.	.						S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.
Template SS confidence
				357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.