Job Description P15877 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:57 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 512 % Identity 30% Template d2ad6a1 SCOP info 8-bladed beta-propeller Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like Quinoprotein alcohol dehydrogenase-like Resolution 1.50

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.		.	.	.	.	.	.	240	.
Predicted Secondary structure																																																																									.
Query SS confidence																																																																									.
Query Sequence		V	A	D	Q	D	W	P	A	Y	G	R	N	Q	E	G	Q	R	F	S	P	L	K	Q	I	N	A	D	N	V	H	N	L	K	E	A	W	V	F	R	T	G	D	V	K	Q	P	N	D	P	G	E	I	T	N	E	V	T	P	I	K	V	G	D	T	L	Y	L	C	T	A	H	.	Q	R	L	F	A	L	D	A
Query Conservation																																																																									.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.																						.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	T	A	G	A	W	P	I	A	T	G	G	Y	Y	S	Q	H	N	S	P	L	A	Q	I	N	K	S	N	V	K	N	V	K	A	A	W	S	F	S	T	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	L	N	G	H	E	G	A	P	L	V	I	G	D	M	M	Y	V	H	S	A	F	P	N	N	T	Y	A	L	N	L
Template Known Secondary structure		T	S	T	T		B		S	T	T	S	S	T	T									S	S		T	T	T	G	G	G										S		.	.	.	.	.	.	.	.		S				S						T	T							S	T	T	T							T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50									.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		242	.		.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260				.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.																		.	.	.
Query SS confidence				.																		.	.	.
Query Sequence		A	S	.	G	K	E	K	W	H	Y	D	P	E	L	K	T	N	E	S	F	.	.	.	Q	H	V	T	C	R	G	V	S	Y	H	E	A	K	A	E	T	A	S	P	E	V	M	A	D	C	P	R	R	I	I	L	P	V	N	D	G	R	L	I	A	I	N	A	E	N	G	K	L	C	E	T	F	A	N	K	G
Query Conservation				.																		.	.	.
Alig confidence				.																		.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Sequence		N	D	P	G	K	I	V	W	Q	H	K	P	K	Q	D	A	S	T	K	A	V	M	C	C	D	V	V	D	R	G	L	A	Y	G	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	V	K	K	Q	A	N	G	H	L	L	A	L	D	A	K	T	G	K	I	N	W	E	V	E	V	C	.
Template Known Secondary structure		T		T	T	S											G	G	G	G	G	G		T	T		S									T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	S							T	T	T											.
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.																.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	N	L	Q	S	N	M	P	D	T	K	P	G	L	Y	E	P	T	S	P	P	I	I	T	D	K	T	I	V	M	A	G	S	V	T	D	N	F	S	T	R	E	T	S	G	V	I	R	G	F	D	V	N	T	G	E	L	L	W	A	F	D	P	G	A	K	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	K	V	G	S	T	L	T	Q	A	P	F	V	A	K	D	T	V	L	M	G	C	S	G	A	E	L	G	V	.	.	.	.	R	G	A	V	N	A	F	D	L	K	T	G	E	L	K	W	R	A	F	A	T	G	S	D	D	S	V	R	L	A	K	D	F	N	S	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		G	G	G	T		B			S						T	T							B		G	G	G	T		.	.	.	.									T	T	T									S	S	S						T	B		T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template SS confidence
												145	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.					.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
											387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	I	P	S	D	E	H	T	F	T	F	N	S	P	N	S	W	A	P	A	A	Y	D	A	K	L	D	L	V	Y	L	P	M	G	V	T	T	P	D	I	W	G	G	N	R	T	P	E	Q	E	R	Y	A	S	S	I	L	A	L	N	A	T	T	G	K	L	A	W	S	Y
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.																																								.	.
Template Conservation																																																		.	.
Template Sequence		N	P	H	Y	G	Q	F	G	L	G	T	K	T	W	E	G	D	A	W	K	I	G	G	G	T	N	W	G	W	Y	A	Y	D	P	K	L	N	L	F	Y	Y	G	S	G	N	P	A	P	.	.	W	N	E	T	M	R	P	G	D	N	K	W	T	M	T	I	W	G	R	D	L	D	T	G	M	A	K	W	G	Y
Template Known Secondary structure			G	G	G			S	S					T	S	S	T	T	G	G	G	G							S						T	T	T	T										S		.	.	S		G	G	G	S		S			T	T	T	T							T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																		.	.
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.			.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	T	V	H	H	D	L	W	D	M	D	L	P	A	Q	P	T	L	A	D	I	T	V	N	G	Q	K	V	P	V	I	Y	A	P	A	K	T	G	N	I	F	V	L	D	R	R	N	G	E	L	V	V	P	A	P	E	K	P	V	P	Q	G	A	A	K	G	D	Y	V	T	P	T	Q	P	F	S	E	L	S	F
Query Conservation
Alig confidence																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	K	T	P	H	D	E	W	D	F	A	G	V	N	Q	M	V	L	T	D	Q	P	V	N	G	K	M	T	P	L	L	S	H	I	D	R	N	G	I	L	Y	T	L	N	R	E	N	G	N	L	I	V	A	E	K	V	D	P	A	V	N	V	F	K	K	V	D	L	K	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S	S	T	T		S	S																T	T											T	T	S							T	T	T									S	S	T	T			S						T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		289	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
		538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	P	T	K	D	L	S	G	A	D	M	W	G	A	T	M	F	D	Q	L	V	C	R	V	M	F	H	Q	M	R	Y	E	G	I	F	T	P	P	S	E	Q	G	T	L	V	F	P	G	N	L	G	M	F	E	W	G	G	I	S	V	D	P	N	R	E	V	A	I	A	N	P	M	A	L	P	F	V	S	K	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	P	V	R	D	P	E	F	A	T	R	M	D	H	K	G	T	N	I	C	P	S	A	M	G	F	H	N	Q	G	V	D	S	Y	D	P	E	S	R	T	L	Y	A	G	L	N	H	I	C	M	D	W	E	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S					G	G	G				T	T							S	S		T	T		S	S		S		B					T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																											359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.
		618	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	P	R	G	P	G	N	P	M	E	Q	P	K	D	A	K	G	T	G	T	E	S	G	I	Q	P	Q	Y	G	V	P	Y	G	V	T	L	N	P	F	L	S	P	F	G	L	P	C	K	Q	P	A	W	G	Y	I	S	A	L	D	L	K	T	N	E	V	V	W	K	K	R	I	G	T	P	Q	D	S	M	P	F
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	M	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	Y	R	A	G	Q	F	F	V	G	A	T	L	A	M	Y	P	G	P	N	G	P	T	K	K	E	M	G	Q	I	R	A	F	D	L	T	T	G	K	A	K	W	T	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	S													T	T	S	T	T	S											T	T	T								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		414	.	.																							.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460
		698	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	M	P	V	P	V	P	F	N	M	G	M	P	M	L	G	G	P	I	S	T	A	G	N	V	L	F	I	A	A	T	A	D	N	Y	L	R	A	Y	N	M	S	N	G	E	K	L	W	Q	G	R	L	P	A	G	G	Q	A	T	P	M	T	Y	E	V	N	G	K	Q	Y	V	V	I	S	A	G	G	H	G	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	W	E	K	F	A	A	W	G	G	T	L	Y	T	K	G	G	L	V	W	.	Y	A	T	L	D	G	Y	L	K	A	L	D	N	K	D	G	K	E	L	W	N	F	K	M	P	S	G	G	I	G	S	P	M	T	Y	S	F	K	G	K	Q	Y	I	G	S	M	Y	G	V	G	G	W
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.			S	S				S	B					T	T	T				.				T	T	S							T	T	T										S	S				S								T	T												T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
										461	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
		778	.	780	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	790	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		F	G	T	K	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	D	Y	I	V	A	Y	A	L
Query Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	G	V	G	L	V	F	D	L	T	D	P	S	A	G	L	G	A	V	G	A	F	R	E	L	Q	N	H	T	Q	M	G	G	G	L	M	V	F	S	L
Template Known Secondary structure		T	T					T	T				T	T	G	G	G	G					T	T	T	G	G	G	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.