Job Description P15877 Confidence 35.80% Date Thu Jan 5 11:34:57 GMT 2012 Rank 99 Aligned Residues 377 % Identity 12% Template d1orva1 SCOP info 8-bladed beta-propeller DPP6 N-terminal domain-like DPP6 N-terminal domain-like Resolution 1.80

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		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		T	P	I	K	V	G	D	T	L	Y	L	C	T	A	H	Q	R	L	F	A	L	D	A	A	S	G	K	E	K	W	H	Y	D	P	E	L	K	T	N	E	S	F	Q	H	V	T	C	R	G	V	S	Y	H	E	A	K	A	E	T	A	S	P	E	V	M	A	D	C	P	R	R	I	I	L	P	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.
Template Conservation																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	L	Q	W	I	S	D	H	E	Y	L	Y	K	Q	E	N	N	I	L	L	F	N	A	E	Y	G	N	S	S	I	F	L	E	N	S	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	D	E	L	G	Y	S	T	N	D	Y	S	V	S	P	D	R	Q	F	I	L	F	E	Y	N	Y	V	K
Template Known Secondary structure							S	S	S							T	T							T	T	T									T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					S	S									T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		59	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
						294	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	V	N	D	G	R	L	I	A	I	N	A	E	N	G	K	L	C	E	T	F	A	N	K	G	V	L	N	L	Q	S	N	M	P	D	T	K	P	G	L	Y	E	P	T	S	P	P	I	I	T	D	K	T	I	V	M	A	G	S	V	T	D	N	F	S	T	R	E	T	S	G	V	I	R	G	F	D
Query Conservation		.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	W	R	H	S	Y	T	A	S	Y	D	I	Y	D	L	N	K	R	Q	L	I	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	E	R	I	P	N	N	T	Q	W	I	T	W	S	P	.	.	.	V	G	H	K	L	A	Y	V	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	N	D	I	Y	V	K	N
Template Known Secondary structure			S	S	S											T	T	T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S				T	T	B	S						S	.	.	.	S	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T						S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.														.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.				160	.	.	.	.	.	.	.	.											.	170	.	.	.	.	.	.
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.														.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.
Query Sequence		V	N	T	G	E	L	L	W	A	F	D	P	G	A	K	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	I	P	S	D	E	H	T	F	T	F	N	S	P	N	S	W	A	P	A	A	Y	D	A	K	L	D	L	V	Y	L	P	M	G	V	T	T	P	D	I	W	G	G	N	R	.	.	.	.
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																															.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	P	N	L	S	S	Q	R	I	T	W	T	G	K	E	N	V	I	Y	N	G	V	T	D	W	V	Y	E	E	E	V	F	S	A	Y	S	A	L	W	W	S	P	N	G	T	F	L	A	Y	A	Q	F	N	D	T	E	V	P	L	I	E	Y	S	F	Y	S	D	E	S	L	Q	Y	P	K	T	V	R	I	P	Y
Template Known Secondary structure		S	T	T	S							S			B	T	T	T				S	B									T	T	S	S	S	B						T	T	S	S										T	T	S										S	T	T		S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
			433	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.				.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																																																																.	.	.
Query SS confidence		.																																																																.	.	.
Query Sequence		.	T	P	E	Q	E	R	Y	A	S	S	I	L	A	L	N	A	T	T	G	K	L	A	W	S	Y	Q	T	V	H	H	D	L	W	D	M	D	L	P	A	Q	P	T	L	A	D	I	T	V	N	G	Q	K	V	P	V	I	Y	A	P	A	K	T	G	.	.	.	N	I	F	V	L	D	R	R	N	G	E	L	V
Query Conservation		.																																																																.	.	.
Alig confidence		.																																																																.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	K	A	G	A	E	N	P	T	V	K	F	F	V	V	D	T	R	T	L	S	P	N	A	S	V	T	S	Y	Q	I	V	P	P	A	S	V	L	I	G	D	H	Y	L	C	G	V	T	W	V	T	E	E	R	I	S	L	Q	W	I	R	R	A	Q	N	Y	S	I	I	D	I	C	D	Y	D	E	S	T	G	R
Template Known Secondary structure				T	T	S												G	G	G			T	T	S															T	S												T	T									T	T	S	S											T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
		509	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	A	P	E	K	P	V	P	Q	G	A	A	K	G	D	Y	V	T	P	T	Q	P	F	S	E	L	S	F	R	P	T	K	D	L	S	G	A	D	M	W	G	A	T	M	F	D	Q	L	V	C	R	V	M	F	H	Q	M	R	Y	E	G	I	F	T	P	P	S	E	Q	G	T	L	V	F	P	G	N	L	G
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		W	I	S	S	V	A	R	Q	H	I	E	I	S	T	T	G	W	V	G	R	F	R	P	A	E	P	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						G	G	G							S	S	S		S	S	S	S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	F	E	W	G	G	I	S	V	D	P	N	R	E	V	A	I	A	N	P	M	A	L	P	F	V	S	K	L	I	P	R	G	P	G	N	P	M	E	Q	P	K	D	A	K	G	T	G	T	E	S	G	I	Q	P	Q	Y	G	V	P	Y	G	V	T	L	N	P	F	L	S	P	F	G	L	P	C	K	Q	P	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	F	T	S	D	G	N	S	F	Y	K	I	I	S	N	E	E	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.			T	T	S	S									T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
								364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
		669	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.							.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	G	Y	I	S	A	L	D	L	K	T	N	E	V	V	W	K	K	R	I	G	T	P	Q	D	S	M	P	F	P	M	P	V	P	V	P	F	N	M	G	M	P	M	L	G	G	P	I	S	T	A	G	N	V	L	F	I	A	A	T	A	D	N	.	.	.	.	.	.	Y	L	R	A	Y	N	M	S	N	G	E
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	K	H	I	C	H	F	Q	T	D	K	S	N	C	T	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	K	G	A	W	E	V	I	G	I	E	A	L	T	S	D	Y	L	Y	Y	I	S	N	E	H	K	G	M	P	G	G	R	N	L	Y	R	I	Q	L	N	D	Y	T
Template Known Secondary structure		.								T	T		S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S	S	S										S	S							S		G	G	G		T	T		B							T	T
Template Predicted Secondary structure		.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
			382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
		743	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.				.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.
Query Sequence		K	L	W	Q	G	R	L	P	A	G	G	Q	A	T	P	.	.	.	M	T	Y	E	V	N	G	K	Q	Y	V	V	I	S	A	G
Query Conservation																	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	V	T	C	L	S	C	E	L	N	P	E	R	C	Q	Y	Y	S	A	S	F	S	N	K	A	K	Y	Y	Q	L	R	C	F	G
Template Known Secondary structure						S	S	T	T	T	S	T	T	T	B		B							T	T	S	S								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		441	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.