Job Description P15877 Confidence 87.04% Date Thu Jan 5 11:34:57 GMT 2012 Rank 61 Aligned Residues 329 % Identity 13% Template d1mdah_ SCOP info 7-bladed beta-propeller YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase Methylamine dehydrogenase, H-chain Resolution 2.50

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		275	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.						.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.
Query SS confidence																									.	.	.	.	.
Query Sequence		A	E	T	A	S	P	E	V	M	A	D	C	P	R	R	I	I	L	P	V	N	D	G	.	.	.	.	.	R	L	I	A	I	N	A	E	N	G	K	L	C	E	T	F	A	N	K	G	V	L	N	L	Q	S	N	M	P	D	T	K	P	G	L	Y	E	P	T	S	P	P	I	I	T	D	K	T	I	V	M	A
Query Conservation																									.	.	.	.	.
Alig confidence																									.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	G	S	S	C	D	H	G	P	G	A	I	S	R	R	S	H	I	T	L	P	A	Y	F	A	G	T	T	E	N	W	V	S	C	A	G	C	G	V	T	L	G	H	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	L	G	A	F	L	S	L	A	V	A	G	H	S	G	S	D	F	A	L	A
Template Known Secondary structure														T	T								T	T	T		S	S								T	T	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T							T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		19	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	S	V	T	D	N	F	S	T	R	E	T	S	G	V	I	R	G	F	D	V	N	T	G	E	L	L	W	A	F	D	P	G	A	K	D	P	N	A	I	P	S	D	E	H	T	F	T	F	N	S	P	N	S	W	A	P	A	A	Y	D	A	K	L	D	L	V	Y	L	P	M	G	V	T	T	P	D	I	W	G
Query Conservation
Alig confidence																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	T	S	F	A	R	S	A	K	G	K	R	T	D	Y	V	E	V	F	D	P	V	T	F	L	P	I	A	D	I	E	L	P	D	A	P	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	G	P	R	V	H	I	I	G	N	C	A	S	S	A	C	L	L	F	F	L	F	G	S	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T	T	T	S	S	S										T	T	T										T	T	S		S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S			T	T	S					T	T	S	S								S	S	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120											.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.			.	.	500	.				.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.					.	.	.
Query SS confidence																																																																						.	.					.	.	.
Query Sequence		G	N	R	T	P	E	Q	E	R	Y	A	S	S	I	L	A	L	N	A	T	T	G	K	L	A	W	S	Y	Q	T	V	H	H	D	L	W	D	M	D	L	P	A	Q	P	T	L	A	D	I	T	V	N	G	Q	K	V	P	V	I	Y	A	P	A	K	T	G	N	I	.	.	F	V	L	D	.	.	.	R	R	N
Query Conservation																																																																						.	.					.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.											.	.					.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	A	A	A	G	.	L	S	V	P	G	A	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Q	L	T	K	S	A	S	C	F	H	I	H	P	G	A	A	A	T	.	.	.	.	.	H	Y	L	G	S	C	P	A	S	L	A	A	S	D	L	A	A	A	P	A	A	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S					.				T	T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S									T	T		.	.	.	.	.							T	T	S								S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.
Template SS confidence
												146	.	.	.	150		.	.	.	.	.	.	.	.											.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.						.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		505	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	E	L	V	V	P	A	P	E	K	P	V	P	Q	G	A	A	K	G	D	Y	V	T	P	T	Q	P	F	S	E	L	S	F	R	P	T	K	D	L	S	G	A	D	M	W	G	A	T	M	F	D	Q	L	V	C	R	V	M	F	H	Q	M	R	Y	E	G	I	F	T	P	P	S	E	Q	G	T	L	V	F	P
Query Conservation
Alig confidence																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	I	V	G	A	Q	C	T	G	A	Q	N	C	S	S	Q	A	A	Q	A	N	Y	P	G	M	L	V	W	A	V	A	S	S	I	L	Q	G	D	I	P	A	A	G	A	T	M	K	A	A	I	D	G	N	E	S	G	R	K	A	D	N	F	R	S	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S		T	T	S		B		S						T	T	T	T						B	S	S									S	S										S	S		T					T	T					S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.
		585	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.		.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.
Query SS confidence																								.
Query Sequence		G	N	L	G	M	F	E	W	G	G	I	S	V	D	P	N	R	E	V	A	I	A	.	N	P	M	A	L	P	F	V	S	K	L	I	P	R	G	P	G	N	P	M	E	Q	P	K	D	A	K	G	T	G	T	E	S	G	I	Q	P	Q	Y	G	V	P	Y	G	V	T	L	N	P	F	L	S	P	F	G	L	P
Query Conservation																								.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.																.								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	F	Q	M	V	A	K	L	K	N	T	D	G	I	M	I	L	T	V	E	H	S	R	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	S	S						T	T	T	T										S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
									266	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.
		664	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.			.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.
Predicted Secondary structure																																																												.	.
Query SS confidence																																																												.	.
Query Sequence		C	K	Q	P	A	W	G	Y	I	S	A	L	D	L	K	T	N	E	V	V	W	K	K	R	I	G	T	P	Q	D	S	M	P	F	P	M	P	V	P	V	P	F	N	M	G	M	P	M	L	G	G	P	I	S	T	A	G	N	.	.	V	L	F	I	A	A	T	A	D	N	Y	L	R	A	Y	N	M	S	N	G
Query Conservation																																																												.	.
Alig confidence							.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.
Template Conservation							.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		C	L	A	A	A	.	E	N	T	S	S	V	T	A	S	V	G	Q	T	S	G	P	I	S	N	G	H	D	S	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	I	A	A	Q	D	G	A	S	D	N	Y	A	N	S	A	G	T	E	V	L	D	I	Y	D	A	A	S	D
Template Known Secondary structure		T	T	S			.								S	S	S															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S	S								T	T	T	T							S	S	S
Template Predicted Secondary structure							.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		289	290	.	.	.		.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
		742	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	K	L	W	Q	G	R	L	P	A	G	G	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	D	Q	S	S	V	E	L	D	K	G	P	E
Template Known Secondary structure											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360