Job Description P15877 Confidence 97.74% Date Thu Jan 5 11:34:57 GMT 2012 Rank 37 Aligned Residues 318 % Identity 18% Template d1fwxa2 SCOP info 7-bladed beta-propeller Nitrous oxide reductase, N-terminal domain Nitrous oxide reductase, N-terminal domain Resolution 1.60

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		226	.	.	.	230	.	.	.		.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.
Query SS confidence										.
Query Sequence		T	L	Y	L	C	T	A	H	.	Q	R	L	F	A	L	D	A	A	S	G	K	E	K	W	H	Y	D	P	E	L	K	T	N	E	S	F	Q	H	V	T	C	R	G	V	S	Y	H	E	A	K	A	E	T	A	S	P	E	V	M	A	D	C	P	R	R	I	I	L	P	V	N	D	G	R	L	I	A	I	N	A
Query Conservation										.
Alig confidence										.																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	G	F	W	S	S	G	Q	S	G	E	M	R	I	L	G	I	P	S	M	R	E	L	M	R	V	P	V	F	N	R	C	S	A	T	G	W	G	Q	T	N	E	S	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	I	H	E	R	T	M	S	E	R	T	K	K	F	L	A
Template Known Secondary structure								B	T	T									T	T									S	S	S			T	T	T		T	T	T	S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		21	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		305	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	N	G	K	L	C	E	T	F	A	N	K	G	V	L	N	L	Q	S	N	M	P	D	T	K	P	G	L	Y	E	P	T	S	P	P	I	I	T	D	K	T	I	V	M	A	G	S	V	T	D	N	F	S	T	R	E	T	S	G	V	I	R	G	F	D	V	N	T	G	E	L	L	W	A	F	D	P	G	A	K
Query Conservation
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template Sequence		A	N	G	K	R	I	H	D	N	G	D	L	H	H	V	H	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	F	T	E	G	K	Y	D	G	R	F	L	F	M	N	D	K	A	N	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	V	A	R	V	R	C	D	V	M	K	C	D	A	I	L	E	I	P	.	.
Template Known Secondary structure			T	T		S	S						B						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T												T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	T							T	T	T	T									S	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.
Template SS confidence
		868	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.															.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.									.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.
		385	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	P	N	A	I	P	S	D	E	H	T	F	T	F	N	S	P	N	S	W	A	P	A	A	Y	D	A	K	L	D	L	V	Y	L	P	M	G	V	T	T	P	D	I	W	G	G	N	R	T	P	E	Q	E	R	Y	A	S	S	I	L	A	L	N	A	T	T	G	K	L	A	W	S	Y	Q	T	V	H	H	D	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	A	K	G	I	H	G	L	R	P	Q	K	W	P	R	S	N	Y	V	F	C	N	G	E	D	E	T	P	L	V	N	D	G	T	N	M	E	D	V	A	N	Y	V	N	V	F	T	A	V	D	A	D	K	W	E	V	A	W	Q	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			S									S	S	B		S								S				S	S		S	S	S	S	T	T		G	G	G										T	T	T	T						.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.
		465	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	D	M	D	L	P	A	Q	P	T	L	A	D	I	T	V	N	G	Q	K	V	P	V	I	Y	A	P	A	K	T	G	N	I	F	V	L	D	R	R	N	G	E	L	V	V	P	A	P	E	K	P	V	P	Q	G	A	A	K	G	D	Y	V	T	P	T	Q	P	F	S	E	L	S	F	R	P	T	K	D	L	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	V	S	G	N	L	D	N	C	D	A	D	Y	E	G	K	.	W	A	F	S	T	S	Y	N	S	E	K	G	M	T	L	P	E	M	T	A	A	E	M	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S									S	S	S	S	.							S		T	T			S	S					T			S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															181	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.		.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		545	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.		.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																		.
Query SS confidence																																																		.
Query Sequence		G	A	D	M	W	G	A	T	M	F	D	Q	L	V	C	R	V	M	F	H	Q	M	R	Y	E	G	I	F	T	P	P	S	E	Q	G	T	L	V	F	P	G	N	L	G	M	F	E	W	.	G	G	I	S	V	D	P	N	R	E	V	A	I	A	N	P	M	A	L	P	F	V	S	K	L	I	P	R	G	P	G
Query Conservation																																																		.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	H	I	V	V	F	N	I	A	E	I	E	K	A	I	A	A	G	D	Y	Q	E	L	N	G	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		T		S				T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																										221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.
		624	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	P	M	E	Q	P	K	D	A	K	G	T	G	T	E	S	G	I	Q	P	Q	Y	G	V	P	Y	G	V	T	L	N	P	F	L	S	P	F	G	L	P	C	K	Q	P	A	W	G	Y	I	S	A	L	D	L	K	T	N	E	V	V	W	K	K	R	I	G	T	P	Q	D	S	M	P	F	P	M	P	V	P	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	V	D	G	R	K	E	A	S	S	L	F	T	R	Y	I	P	I	A	N	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S	G	G	G			S	S								S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																249	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.
		704	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.		.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.			.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.									.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.																									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.																									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		P	F	N	M	G	M	P	M	L	G	G	P	I	S	T	A	G	N	V	.	L	F	I	A	A	T	A	D	N	Y	L	R	A	Y	N	M	S	N	G	E	K	L	W	Q	.	.	G	R	L	P	A	G	G	Q	A	T	P	.	.	.	.	.	.	.	.	M	T	Y	E	V	N	G	K	Q	Y	V
Query Conservation																					.																									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.											.																									.	.												.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	G	C	N	M	A	P	D	K	K	H	L	C	V	A	G	K	L	S	P	T	V	T	V	L	D	V	T	R	F	D	A	V	F	Y	E	N	A	D	P	R	S	A	V	V	A	E	P	E	L	G	L	G	P	L	H	T	A	F	D	G	R	G	N	A	Y	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	S	S							T	T	S	S	B						G	G	G							S				G	G	G	G						B			S									T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
											270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.