Job Description P15877 Confidence 94.24% Date Thu Jan 5 11:34:57 GMT 2012 Rank 48 Aligned Residues 280 % Identity 14% Template c3dm0A_ PDB info PDB header:sugar binding protein,signaling protein Chain: A: PDB Molecule:maltose-binding periplasmic protein fused with PDBTitle: maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana Resolution 2.40 Å

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		286	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		C	P	R	R	I	I	L	P	V	N	D	G	R	L	I	A	I	N	A	E	N	G	K	L	C	E	T	F	A	N	K	G	V	L	N	L	Q	S	N	M	P	D	T	K	P	G	L	Y	E	P	T	S	P	P	I	I	T	D	K	T	I	V	M	A	G	S	V	T	D	N	F	S	T	R	E	T	S	G	V	I
Query Conservation
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.																				.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																														.	.	.	.	.	.	.																				.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	A	D	I	I	V	S	A	S	R	D	K	S	I	I	L	W	K	L	T	K	D	D	K	A	Y	G	V	.	.	.	.	.	.	.	A	Q	R	R	L	T	G	H	S	H	F	V	E	D	V	V	L	S	S	.	.	D	G	Q	F	A	L	S	G	S	W	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	E	L
Template Known Secondary structure				S							T	T	S										S	T	T		S			.	.	.	.	.	.	.									S	S									T	.	.	T	S	S							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S
Template Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.																				.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1027	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.								.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.			.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.											.	.	.	.
		366	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	G	F	D	V	N	T	G	E	L	L	W	A	F	D	P	G	A	K	D	P	N	A	I	P	S	D	E	H	T	F	T	F	N	S	P	N	S	W	A	P	A	A	Y	D	A	K	L	D	L	V	Y	L	P	M	G	V	T	T	P	D	I	W	G	G	N	R	T	P	E	Q	E	R	Y	A	S	S	I	L	A
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	L	W	D	L	A	A	G	V	S	T	R	R	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	H	T	K	D	V	L	S	V	A	F	S	L	D	N	R	Q	I	V	S	A	S	R	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	T	I	K	L
Template Known Secondary structure						T	T	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				S	S									T	T	S	S							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1088	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.																			.	.	.	1130	.
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Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	N	A	T	T	G	K	L	A	W	S	Y	Q	T	V	H	H	D	L	W	D	M	D	L	P	A	Q	P	T	L	A	D	I	T	V	N	G	Q	K	V	P	V	I	Y	A	P	A	K	T	G	N	I	F	V	L	D	R	R	N	G	E	L	V	V	P	A	P	E	K	P	V	P	Q	G	A	A	K	G	D	Y
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		W	N	T	L	G	E	C	K	Y	T	I	S	E	G	G	E	.	.	.	.	.	.	.	G	H	R	D	W	V	S	C	V	R	F	S	P	N	T	L	Q	P	T	I	V	S	A	S	W	D	K	T	V	K	V	W	N	L	S	N	C	K	L	R	S	T	L	A	G	H	T	G	Y	V	S	T	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				T	T	S								S	S	T	T	.	.	.	.	.	.	.	S		S	S									S		S	S	S								T	T	S							T	T	T											S	S					.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.																																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1132	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.								.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	T	P	T	Q	P	F	S	E	L	S	F	R	P	T	K	D	L	S	G	A	D	M	W	G	A	T	M	F	D	Q	L	V	C	R	V	M	F	H	Q	M	R	Y	E	G	I	F	T	P	P	S	E	Q	G	T	L	V	F	P	G	N	L	G	M	F	E	W	G	G	I	S	V	D	P	N	R	E	V	A	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	A	V	S	P	D	G	S	L	C	A
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																							1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	N	P	M	A	L	P	F	V	S	K	L	I	P	R	G	P	G	N	P	M	E	Q	P	K	D	A	K	G	T	G	T	E	S	G	I	Q	P	Q	Y	G	V	P	Y	G	V	T	L	N	P	F	L	S	P	F	G	L	P	C	K	Q	P	A	W	G	Y	I	S	A	L	D	L	K	T	N	E	V	V	W	K
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	G	K	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	V	L	L	W	D	L	A	E	G	K	K	L	Y	S
Template Known Secondary structure					T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	B						T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1211	.	.	.	.																																																												.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.
		686	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.			.	.	760	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.
Query SS confidence																																																																										.	.
Query Sequence		K	R	I	G	T	P	Q	D	S	M	P	F	P	M	P	V	P	V	P	F	N	M	G	M	P	M	L	G	G	P	I	S	T	A	G	N	V	L	F	I	A	A	T	A	D	N	Y	L	R	A	Y	N	M	S	N	G	E	K	L	W	Q	G	R	L	P	A	G	G	Q	A	T	P	.	.	M	T	Y	E	V	N
Query Conservation																																																																										.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.																																	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Sequence		L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	N	S	V	I	H	A	L	C	F	S	P	N	R	Y	W	L	.	C	A	A	T	E	H	G	I	K	I	W	D	L	E	S	K	S	I	V	E	D	L	K	V	D	L	K	K	V	I	Y	C	T	S	L	N	W	S	A	D
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B		S	S									S	S	S	S			.					T	T							T	T	T	T																							T	T
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.
Template SS confidence
		1232																					.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290
		764	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	K	Q	Y	V	V	I	S	A	G	G	H	G	S	F	G	T	K	M	G	D	Y	I	V	A	Y	A	L
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		G	S	T	L	F	S	G	Y	T	D	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	I	R	V	W	G	I
Template Known Secondary structure		S	S							T	T	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1307	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.											.	.	1320	.	.	.	.