Job Description P15877 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:34:57 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 519 % Identity 32% Template c1kv9A_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:type ii quinohemoprotein alcohol dehydrogenase; PDBTitle: structure at 1.9 a resolution of a quinohemoprotein alcohol2 dehydrogenase from pseudomonas putida hk5 Resolution 1.90 Å

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		159	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	I	S	P	V	A	D	Q	D	W	P	A	Y	G	R	N	Q	E	G	Q	R	F	S	P	L	K	Q	I	N	A	D	N	V	H	N	L	K	E	A	W	V	F	R	T	G	D	V	K	Q	P	N	D	P	G	E	I	T	N	E	V	T	P	I	K	V	G	D	T	L	Y	L	C	T	A	H	Q	R	L	F	A
Query Conservation
Alig confidence																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	A	T	E	Q	A	G	G	E	W	L	S	H	G	R	T	Y	A	E	Q	R	F	S	P	L	K	Q	I	D	A	S	N	V	R	S	L	G	L	A	W	Y	M	D	L	D	N	.	.	.	.	.	.	.	.	T	R	G	L	E	A	T	P	L	F	H	D	G	V	I	Y	T	S	M	S	W	S	R	V	I	A
Template Known Secondary structure				T	T	T			S		B		B	T	T	B	S	T	T									S	S		T	T	T	G	G	G										S		.	.	.	.	.	.	.	.		S										T	T							G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.									.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.				.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.
Query Sequence		L	D	A	A	S	G	K	E	K	W	H	Y	D	P	E	L	K	T	N	E	S	F	Q	H	V	T	.	.	.	C	R	G	V	S	Y	H	E	A	K	A	E	T	A	S	P	E	V	M	A	D	C	P	R	R	I	I	L	P	V	N	D	G	R	L	I	A	I	N	A	E	N	G	K	L	C	E	T	F	A	N
Query Conservation																												.	.	.
Alig confidence																												.	.	.										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	D	A	A	S	G	K	E	L	W	R	Y	D	P	E	V	A	K	V	K	A	R	T	S	C	C	D	A	V	N	R	G	V	A	L	W	G	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	V	Y	V	G	T	L	D	G	R	L	I	A	L	D	A	K	T	G	K	A	I	W	S	Q	Q	T
Template Known Secondary structure				T	T	T													G	G	G	G	G	G		T	T		S									B	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							T	T	S							T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.																.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.
		316	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	G	V	L	N	L	Q	S	N	M	P	D	T	K	P	G	L	Y	E	P	T	S	P	P	I	I	T	D	K	T	I	V	M	A	G	S	V	T	D	N	F	S	T	R	E	T	S	G	V	I	R	G	F	D	V	N	T	G	E	L	L	W	A	F	D	P	G	A	K	D	P	N	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																										.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template Sequence		T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	P	A	K	P	Y	S	I	T	G	A	P	R	V	V	K	G	K	V	I	I	G	N	G	G	A	E	Y	G	V	.	.	.	.	R	G	F	V	S	A	Y	D	A	D	T	G	K	L	A	W	R	F	Y	T	V	P	G	D	P	A	L	P	Y	E	H	P	E	L
Template Known Secondary structure		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	S	S		B			S						T	T							B		T	T	T			.	.	.	.	B								T	T	T									S	S				T	T	S			S	S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template SS confidence
		146												.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.					.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210
							388	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.		.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																							.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																							.
Query Sequence		.	.	.	.	.	A	I	P	S	D	E	H	T	F	T	F	N	S	P	N	S	W	A	P	A	A	Y	D	A	K	L	D	L	V	Y	L	P	M	G	V	T	T	P	.	D	I	W	G	G	N	R	T	P	E	Q	E	R	Y	A	S	S	I	L	A	L	N	A	T	T	G	K	L	A	W	S	Y	Q	T	V	H
Query Conservation		.	.	.	.	.																																							.
Alig confidence		.	.	.	.	.																																							.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	A	A	K	T	W	Q	G	D	Q	Y	W	K	L	G	G	G	G	T	V	W	D	S	M	A	Y	D	P	E	L	D	L	L	Y	V	G	T	G	N	G	S	P	W	N	R	E	V	R	S	P	G	G	G	D	N	L	Y	L	S	S	I	L	A	I	R	P	D	T	G	K	L	A	W	H	Y	Q	V	T	P
Template Known Secondary structure						T	T			S	S													S						T	T	T	T											S	S						S	T	T					T	T	T	T							T	T	T									S	S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		211	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290
		462	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	D	L	W	D	M	D	L	P	A	Q	P	T	L	A	D	I	T	V	N	G	Q	K	V	P	V	I	Y	A	P	A	K	T	G	N	I	F	V	L	D	R	R	N	G	E	L	V	V	P	A	P	E	K	P	V	P	Q	G	A	A	K	G	D	Y	V	T	P	T	Q	P	F	S	E	L	S	F	R	P	T	K
Query Conservation
Alig confidence																																																									.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template Conservation																																																									.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template Sequence		G	D	S	W	D	F	T	A	T	Q	Q	I	T	L	A	E	L	N	I	D	G	K	P	R	K	V	L	M	Q	A	P	K	N	G	F	F	Y	V	L	D	R	T	N	G	K	L	I	S	A	E	K	F	G	K	V	.	.	.	.	.	.	.	T	W	A	E	K	V	D	L	A	T	G	R	P	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T			S						S										T	T											T	T	S							T	T	T									S	S			.	.	.	.	.	.	.		S						T	T	T				.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																									.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		291	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.								.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.
		542	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	L	S	G	A	D	M	W	G	A	T	M	F	D	Q	L	V	C	R	V	M	F	H	Q	M	R	Y	E	G	I	F	T	P	P	S	E	Q	G	T	L	V	F	P	G	N	L	G	M	F	E	W	G	G	I	S	V	D	P	N	R	E	V	A	I	A	N	P	M	A	L	P	F	V	S	K	L	I	P	R	G
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	E	A	P	G	V	R	Y	E	K	E	P	I	V	M	W	P	S	P	F	G	A	H	N	W	H	S	M	S	F	N	P	G	T	G	L	V	Y	I	P	Y	Q	E	V	P	G	V	Y	R	N	E	G	K	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.				T	T	T	T		S	S	S					S	S		T	T		S	S		S	S						T	T	T	T																	G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																												359	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
		622	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	G	N	P	M	E	Q	P	K	D	A	K	G	T	G	T	E	S	G	I	Q	P	Q	Y	G	V	P	Y	G	V	T	L	N	P	F	L	S	P	F	G	L	P	C	K	Q	P	A	W	G	Y	I	S	A	L	D	L	K	T	N	E	V	V	W	K	K	R	I	G	T	P	Q	D	S	M	P	F	P	M	P	V
Query Conservation
Alig confidence							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	V	T	R	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	F	N	T	A	A	G	F	A	D	A	T	D	V	P	A	A	V	V	S	.	G	A	L	L	A	W	D	P	V	K	Q	K	A	A	W	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S				S	S		G	G	G						G	G	G			.								T	T	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		413	.	.	.	.																							.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.		.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.
		702	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																													.	.	.	.	.
Query Sequence		P	V	P	F	N	M	G	M	P	M	L	G	G	P	I	S	T	A	G	N	V	L	F	I	A	A	T	A	D	N	Y	L	R	A	Y	N	M	S	N	G	E	K	L	W	Q	G	R	L	P	A	G	G	Q	A	T	P	M	T	Y	E	V	N	G	K	Q	Y	V	V	I	S	A	G	G	H	G	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																													.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.																				.																																																				.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																				.
Template Sequence		.	.	.	.	P	Y	P	T	H	W	N	G	G	T	L	S	T	A	G	N	L	V	F	.	Q	G	T	A	A	G	Q	M	H	A	Y	S	A	D	K	G	E	A	L	W	Q	F	E	A	Q	S	G	I	V	A	A	P	M	T	F	E	L	A	G	R	Q	Y	V	A	I	M	A	G	W	G	G	V	A	T	L	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.			S	S	S									T	T	T				.				T	T	S							T	T	T										S	S				S								T	T												S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																				.
Template SS confidence
						455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.		.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.
								777	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	S	F	G	T	K	M	G	D	Y	I	V	A	Y	A	L	P	D	D	V	K
Query Conservation		.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	G	E	S	M	N	L	P	G	M	K	N	R	S	R	L	L	V	F	A	L	D	G	K	A	Q
Template Known Secondary structure				G	G	G	G	S	T	T													T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.