Job Description P15877 Confidence 23.81% Date Thu Jan 5 11:34:57 GMT 2012 Rank 122 Aligned Residues 405 % Identity 12% Template c1k32E_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: E: PDB Molecule:tricorn protease; PDBTitle: crystal structure of the tricorn protease Resolution 2.00 Å

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		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	W	V	F	R	T	G	D	V	K	Q	P	N	D	P	G	E	I	T	N	E	V	T	P	I	K	V	G	D	T	L	Y	L	C	T	A	H	Q	R	L	F	A	L	D	A	A	S	G	K	E	K	W	H	Y	D	P	E	L	K	T	N	E	S	F	Q	H	V	T	C	R	G	V	S	Y	H	E	A	K	A	E
Query Conservation
Alig confidence																																																																																	.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		I	Y	S	T	D	L	D	G	K	D	L	R	K	H	T	S	F	T	D	Y	Y	P	R	H	L	N	T	D	G	R	R	I	L	F	S	K	G	G	S	I	Y	I	F	N	P	D	T	E	K	I	E	K	I	E	I	G	D	L	E	S	P	E	D	R	I	I	S	I	P	S	K	F	A	E	D	F	S	P	L	.
Template Known Secondary structure							T	T	S		S									S	S								S	S	S							T	T							T	T	T	T															S						G	G	G	G								.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		254	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.
		277	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	A	S	P	E	V	M	A	D	C	P	R	R	I	I	L	P	V	N	D	G	R	L	I	A	I	N	A	E	N	G	K	L	C	E	T	F	A	N	K	G	V	L	N	L	Q	S	N	M	P	D	T	K	P	G	L	Y	E	P	T	S	P	P	I	I	T	D	K	T	I	V	M	A	G	S	V	T	D	N	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	G	D	L	I	A	F	V	S	R	G	Q	A	F	I	Q	D	V	S	G	T	Y	V	L	K	V	P	E	P	L	R	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Y	V	R	R	G	G	D	T	K	V	A	F	I	H	G	T	R	E	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G							T	T							T	T	S	S	S								S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							S	S	S									S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.
Template SS confidence
												333	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.
		357	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	T	R	E	T	S	G	V	I	R	G	F	D	V	N	T	G	E	L	L	W	A	F	D	P	G	A	K	D	P	N	A	I	P	S	D	E	H	T	F	T	F	N	S	P	N	S	W	A	P	A	A	Y	D	A	K	L	D	L	V	Y	L	P	M	G	V	T	T	P	D	I	W	G	G	N	R	T	P	E	Q
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	G	D	F	L	G	I	Y	D	Y	R	T	G	K	A	E	K	F	E	E	N	L	G	N	V	F	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	G	V	D	R	N	G	K	F	A	V	V	A	N	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.									T	T	T												S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					T	T	S	S							T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
							384	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.		470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		E	R	Y	A	S	S	I	L	A	L	N	A	T	T	G	K	L	A	W	S	Y	Q	T	V	H	H	D	L	W	D	M	D	L	.	P	A	Q	P	T	L	A	D	I	T	V	N	G	Q	K	V	P	V	I	Y	A	P	A	K	T	G	N	I	F	V	L	D	R	R	N	G	E	L	V	V	P	A	P	E	K	P
Query Conservation																																			.
Alig confidence		.	.	.	.																														.																.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																														.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	F	E	I	M	T	V	D	L	E	T	G	K	P	T	V	I	E	R	S	R	E	A	M	I	T	D	F	T	I	S	D	N	S	R	F	I	A	Y	G	F	P	L	K	H	G	.	.	.	E	T	D	G	Y	V	M	Q	A	I	H	V	Y	D	M	E	G	R	K	I	F	A	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	S							T	T	T										S	S	S									T	T	S											S	S	.	.	.	T	T		S	S										T	T	T	T					.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																														.	.	.																							.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						426	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470				.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.
		516	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	P	Q	G	A	A	K	G	D	Y	V	T	P	T	Q	P	F	S	E	L	S	F	R	P	T	K	D	L	S	G	A	D	M	W	G	A	T	M	F	D	Q	L	V	C	R	V	M	F	H	Q	M	R	Y	E	G	I	F	T	P	P	S	E	Q	G	T	L	V	F	P	G	N	L	G	M	F	E	W	G	G	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T	T	E	N	S	H	D	Y	A	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S		S	S	S	B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																							493	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.
		596	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.						.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.
Query Sequence		S	V	D	P	N	R	E	V	A	I	A	N	P	M	A	L	.	.	.	.	.	P	F	V	S	K	L	I	P	R	G	P	G	N	P	M	E	Q	P	K	D	A	K	G	T	G	T	E	S	G	I	Q	P	Q	Y	G	V	P	Y	G	V	T	L	N	P	F	L	S	P	F	G	L	P	C	K	Q	P	A	W	G
Query Conservation																		.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	F	D	A	D	S	K	N	L	Y	Y	L	S	Y	R	S	L	D	P	S	P	D	R	V	V	L	N	F	S	F	E	V	V	S	K	P	F	V	I	P	L	I	P	G	S	P	N	P	T	K	L	V	P	R	S	M	T	S	E	A	G	E	Y	D	L	N	D	M	Y	K	R	S	S	P	I	N	V	D	P	G
Template Known Secondary structure					T	T	S	S							S									S	S	S	S						S		B							S	S	T	T				G	G	G				G	G	G	S									T	T	G	G	G	G					S				B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		504	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.
		671	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	I	S	A	L	D	L	K	T	N	E	V	V	W	K	K	R	I	G	T	P	Q	D	S	M	P	F	P	M	P	V	P	V	P	F	N	M	G	M	P	M	L	G	G	P	I	S	T	A	G	N	V	L	F	I	A	A	T	A	D	N	Y	L	R	A	Y	N	M	S	N	G	E	K	L	W	Q	G	R	L	P
Query Conservation
Alig confidence																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Conservation																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template Sequence		D	Y	R	M	I	I	P	L	E	S	S	I	L	I	Y	S	V	P	V	H	G	E	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	Y	Y	Q	G	A	P	E	K	G	V	L	L	K	Y	D	V	K	T	R	K	V	T	E	V	K	N	.	.
Template Known Secondary structure										S	S												S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		T	T	T	T								.	.
Template Predicted Secondary structure																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.
Template SS confidence
		584	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.
		751	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	G	G	Q	A	T	P	M	T	Y	E	V	N	G	K	Q	Y	V	V	I	S	A	G	G	H	G	S	F	G	T	K	M	G	D	Y	I	V	A	Y	A	L	P	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	N	L	T	D	L	R	L	S	A	D	R	K	T	V	M	V	R	K	D	D	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	Y	T	F	P	L	E	K
Template Known Secondary structure		.	.	.									T	T	S								T	T	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					635	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.											.	.	.	660	.	.	.	.