Job Description P0ADG7 Confidence 99.92% Date Thu Jan 5 11:20:59 GMT 2012 Rank 25 Aligned Residues 279 % Identity 25% Template d1tb3a1 SCOP info TIM beta/alpha-barrel FMN-linked oxidoreductases FMN-linked oxidoreductases Resolution 2.30

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		11	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.							.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70			.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
Predicted Secondary structure																																													.	.	.	.	.	.																		.	.
Query SS confidence																																													.	.	.	.	.	.																		.	.
Query Sequence		F	D	D	V	L	L	V	P	A	H	S	T	V	L	P	N	T	A	D	L	S	T	Q	L	T	K	T	I	R	L	N	I	P	M	L	S	A	A	M	D	T	V	T	.	.	.	.	.	.	E	A	R	L	A	I	A	L	A	Q	E	G	G	I	G	F	I	.	.	H	K	N	M	S	I	E	R	Q	A	E	E
Query Conservation																																													.	.	.	.	.	.																		.	.
Alig confidence										.																.																			.	.	.	.	.	.																		.	.												.
Template Conservation										.																.																																																							.
Template Sequence		F	K	R	I	R	L	R	P	.	R	Y	L	R	D	M	S	K	V	D	T	R	T	T	I	.	Q	G	Q	E	I	S	A	P	I	C	I	S	P	T	A	F	H	S	I	A	W	P	D	G	E	K	S	T	A	R	A	A	Q	E	A	N	I	C	Y	V	I	S	S	Y	A	S	Y	S	L	E	D	I	V	A	.
Template Known Secondary structure							B			.			S	S			S	S		B						.	T	T				S	S	S							S		G	G	G	T		T	T	T												T							T	T		S	S								.
Template Predicted Secondary structure										.																.																																																							.
Template SS confidence
		41	.	.	.	.	.	.	.		.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.		.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	R	R	V	K	K	H	E	S	G	V	V	T	D	P	Q	T	V	L	P	T	T	T	L	R	E	V	K	E	L	T	E	R	N	G	F	A	G	Y	P	V	V	T	E	E	N	E	L	V	G	I	I	T	G	R	D	V	R	F	V	T	D	L	N	Q	P	V	S	V	Y	M	T	P	K	E	R	L	V	T	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	A	A	P	E	G	F	R	W	F	Q	L	Y	M	K	S	D	W	D	F	N	K	Q	M	V	Q	R	A	E	A	L	G	F	K	A	L	V	I	T	I	D	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	V	L	G	N	R	R	R	D	K	R	N	Q	L	N	L	E	A	K	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.		S	T	T											S		T	T													T									S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
						118	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.																.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	E	G	E	A	R	E	V	V	L	A	K	M	H	E	K	R	V	E	K	A	L	V	V	D	D	E	F	H	L	I	G	M	I	T	V	K	D	F	Q	K	A	E	R	K	P	N	A	C	K	D	E	Q	G	R	L	R	V	G	A	A	V	G	A	G	A	G	N	E	E	R	V	D	A	L	V	A	A	G	V
Query Conservation
Alig confidence					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	R	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		183	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	V	L	L	I	D	S	S	H	G	H	S	E	G	V	L	Q	R	I	R	E	T	R	A	K	Y	P	D	L	Q	I	I	G	G	N	V	A	T	A	A	G	A	R	A	L	A	E	A	G	C	S	A	V	K	V	G	I	G	P	G	S	I	C	T	T	R	I	V	T	G	V	G	V	P	Q	I	T	A	V	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																			.																																					.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																			.																																					.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	L	K	E	A	S	F	C	W	N	D	L	S	L	L	Q	S	I	T	.	R	L	P	I	I	L	K	G	I	L	T	K	E	D	A	E	L	A	M	K	H	N	V	Q	G	I	V	V	S	N	H	G	G	R	Q	L	.	.	.	.	.	.	D	E	V	S	A	S	I	D	A	L	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																T	T		.		S									S										T	T		S							G	G	G	T	S	S	.	.	.	.	.	.		S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																			.																																					.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										186	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.		.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.							240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	A	V	E	A	L	E	G	T	G	I	P	V	I	A	D	G	G	I	R	F	S	G	D	I	A	K	A	I	A	A	G	A	S	A	V	M	V	G	S	M	L	A	G	T	E	E	S	P	G	E	I	E	L	Y	Q	G	R	S	Y	K	S	Y	R	G	M	G	S	L	G	A	M	S	K	G	S	S	D	R	Y
Query Conservation
Alig confidence										.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	V	V	A	A	V	K	G	.	K	I	E	V	Y	M	D	G	G	V	R	T	G	T	D	V	L	K	A	L	A	L	G	A	R	C	I	F	L	G	R	P	I	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	W	G	L	A	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T	.	S	S						S	S			S										T	T		S					S					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		264	.	.	.	.	.	270	.		.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	310
		403	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	Q	S	D	N	A	A	D	K	L	V	P	E	G	I	E	G	R	V	A	Y	K	G	R	L	K	E	I	I	H	Q	Q	M	G	G	L	R	S	C	M	G	L	T	G	C	G	T	I	D	E	L	R	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G	E	D	G	.	.	.	.	.	.	.	V	K	E	V	L	D	I	L	T	A	E	L	H	R	C	M	T	L	S	G	C	Q	S	V	A	E	I	S	P
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.																				T		S	B	G	G	G			G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
														311	.	.	.	.								.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.