Job Description P0ADG7 Confidence 99.70% Date Thu Jan 5 11:20:59 GMT 2012 Rank 80 Aligned Residues 272 % Identity 20% Template c3oixA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:putative dihydroorotate dehydrogenase; dihydroorotate PDBTitle: crystal structure of the putative dihydroorotate dehydrogenase from2 streptococcus mutans Resolution 2.40 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	L	S	T	Q	L	T	K	T	I	R	L	N	I	P	M	L	S	A	A	M	D	T	V	T	E	A	R	L	A	I	A	L	A	Q	E	G	G	I	G	F	I	H	K	N	M	S	I	E	R	Q	A	E	E	V	R	R	V	K	K	H	E	S	G	V	V	T	D	P	Q	T	V	L	P	T	T	T	L	R
Query Conservation
Alig confidence									.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	S	T	H	T	T	I	.	G	S	F	D	F	D	N	C	L	M	N	A	A	G	V	Y	C	M	T	R	E	E	L	A	A	I	D	H	S	E	A	G	S	F	V	T	T	G	T	L	E	E	R	A	G	N	P	Q	P	R	Y	A	D	T	K	L	G	S	I	N	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									.	T	T				S		S					T	T	S	S		S	S									T	S	S		S	B		B			B		S	S		B			S		S							S	S						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.																																																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.		.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	K	E	L	T	E	R	N	G	F	A	G	Y	P	V	V	T	E	E	N	E	L	V	G	I	I	T	G	R	D	V	R	F	V	T	D	L	N	Q	P	V	S	V	Y	M	T	P	K	E	R	L	V	T	V	R	E	G	E	A	R	E	V	V	L	A	K	M	H	E	K	R	V	E	K	A	L	V	V	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	G	L	P	N	L	G	I	N	Y	Y	L	D	Y	V	T	E	L	Q	K	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.					B	S															.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																							71	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.										.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	E	F	H	L	I	G	M	I	T	V	K	D	F	Q	K	A	E	R	K	P	N	A	C	K	D	E	Q	G	R	L	R	V	G	A	A	V	G	A	G	A	G	N	E	E	R	V	D	A	L	V	A	A	G	V	D	V	L	L	I	D	S	S	H	G	H	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	G	V	L
Query Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	P	D	S	K	N	H	F	L	S	L	V	G	M	S	P	E	E	T	H	T	I	L	M	V	E	A	S	K	Y	Q	G	L	V	E	L	N	L	S	C	P	N	V	P	G	P	Q	I	A	Y	D	F	E	T	T	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	T											S	S										T	T	T	S	S			S							S				S					G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										91	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
		259	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.						.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.												.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	R	I	R	E	T	R	A	K	Y	P	D	L	Q	I	I	G	G	.	.	.	.	.	N	V	A	T	A	A	G	A	R	A	L	A	E	A	G	C	S	A	V	K	V	G	I	G	P	G	S	I	C	T	T	R	I	V	T	G	V	G	V	P	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	T	A	V	A
Query Conservation																				.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.								.	.	.	.	.																																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.
Template Sequence		Q	I	L	S	E	V	F	T	Y	F	.	T	K	P	L	G	I	K	L	P	P	Y	F	D	I	V	H	F	D	Q	A	A	A	I	F	N	Y	P	L	T	F	V	N	C	I	N	S	I	G	N	G	L	V	I	E	D	E	T	V	V	I	P	K	N	G	F	G	G	I	G	G	D	Y	V	K	P	T	A	L	A
Template Known Secondary structure								T	T	T		.		S																											S																T	T						G	G	G							G	G	G
Template Predicted Secondary structure												.
Template SS confidence
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.		.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.			.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
Predicted Secondary structure												.	.
Query SS confidence												.	.
Query Sequence		D	A	V	E	A	L	E	G	T	G	.	.	I	P	V	I	A	D	G	G	I	R	F	S	G	D	I	A	K	A	I	A	A	G	A	S	A	V	M	V	G	S	M	L	A	G	T	E	E	S	P	G	E	I	E	L	Y	Q	G	R	S	Y	K	S	Y	R	G	M	G	S	L	G	A	M	S	K	G	S	S	D
Query Conservation												.	.
Alig confidence												.	.										.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	V	H	A	F	Y	K	R	L	N	P	S	I	Q	I	I	G	T	G	G	V	.	T	G	R	D	A	F	E	H	I	L	C	G	A	S	M	V	Q	I	G	T	A	L	H	Q	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								T	T	S		T	T	S						S			.												T		S					S							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250		.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	Y	F	Q	S	D	N	A	A	D	K	L	V	P	E	G	I	E	G	R	V	A	Y	K	G	R	L	K	E	I	I	H	Q	Q	M	G	G	L	R	S	C	M	G	L	T	G	C	G	T	I	D	E	L	R	T	K	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.												.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.												.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	.	.	Q	I	F	K	R	I	T	K	E	L	A	.	I	M	T	E	K	G	Y	E	T	L	E	D	F	R	G	K	L
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	.	.												.						T			S	G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.												.
Template SS confidence
																										277	.			.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.