Job Description P0ADG7 Confidence 99.63% Date Thu Jan 5 11:20:59 GMT 2012 Rank 99 Aligned Residues 276 % Identity 22% Template c3gyeA_ PDB info PDB header:oxidoreductase Chain: A: PDB Molecule:dihydroorotate dehydrogenase, putative; PDBTitle: didydroorotate dehydrogenase from leishmania major Resolution 2.00 Å

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		28	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	L	S	T	Q	L	T	K	T	I	R	L	N	I	P	M	L	S	A	A	M	D	T	V	T	E	A	R	L	A	I	A	L	A	Q	E	G	G	I	G	F	I	H	K	N	M	S	I	E	R	Q	A	E	E	V	R	R	V	K	K	H	E	S	G	V	V	T	D	P	Q	T	V	L	P	T	T	T	L	R
Query Conservation
Alig confidence									.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	S	L	Q	V	N	L	.	L	N	N	T	F	A	N	P	F	M	N	A	A	G	V	M	C	T	T	T	E	E	L	V	A	M	T	E	S	A	S	G	S	L	V	S	K	S	C	T	P	A	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure									.	T	T				S	S	S					T	T	S	S		S	S										S	S		S									S	S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.		.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50
		108	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	V	K	E	L	T	E	R	N	G	F	A	G	Y	P	V	V	T	E	E	N	E	L	V	G	I	I	T	G	R	D	V	R	F	V	T	D	L	N	Q	P	V	S	V	Y	M	T	P	K	E	R	L	V	T	V	R	E	G	E	A	R	E	V	V	L	A	K	M	H	E	K	R	V	E	K	A	L	V	V	D
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	E	G	N	P	T	P	R	Y	Q	A	L	P	L	G	S	I	N	S	M	G	L	P	N	N	G	F	D	F	Y	L	A	Y	A	A	E	Q	H	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	B			S		S							T	T										B													T		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																				51	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
		188	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	E	F	H	L	I	G	M	I	T	V	K	D	F	Q	K	A	E	R	K	P	N	A	C	K	D	E	Q	G	R	L	R	V	G	A	A	V	G	A	G	A	G	N	E	E	R	V	D	A	L	V	A	A	G	V	D	V	L	L	I	D	S	S	H	G	H	S	E	G	V	L	Q	R	I	R	E	T	R	A	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	Y	G	K	K	P	L	F	L	S	M	S	G	L	S	M	R	E	N	V	E	M	C	K	R	L	A	A	V	A	T	E	K	G	V	I	L	E	L	N	L	D	F	D	A	M	R	Q	C	L	T	A	V	S	E	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	T	T										S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																										89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.							.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.														.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	P	D	L	Q	I	I	G	G	N	V	A	T	A	A	G	.	.	.	.	.	.	A	R	A	L	A	E	A	G	C	S	A	V	K	V	G	I	G	P	G	S	I	C	T	T	R	I	V	T	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	G	V	P	Q	I	T	A	V	A	D	A	V	E	A	L
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Y	P	H	S	F	G	V	K	M	P	P	Y	F	D	F	A	H	F	D	A	A	A	E	I	L	N	E	F	P	K	V	Q	F	I	T	C	I	N	S	I	G	N	G	L	V	I	D	A	E	T	E	S	V	V	I	K	P	K	Q	G	F	G	G	L	G	G	R	Y	V	L	P	T	A	L	A	N	I	N	A	F
Template Known Secondary structure				S											S													T		T	T																		T	T	T	T			S		S	G	G	G	G						G	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		158	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
		329	330	.			.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.
Query SS confidence					.	.
Query Sequence		E	G	T	.	.	G	I	P	V	I	A	D	G	G	I	R	F	S	G	D	I	A	K	A	I	A	A	G	A	S	A	V	M	V	G	S	M	L	A	G	T	E	E	S	P	G	E	I	E	L	Y	Q	G	R	S	Y	K	S	Y	R	G	M	G	S	L	G	A	M	S	K	G	S	S	D	R	Y	F	Q	S	D
Query Conservation					.	.
Alig confidence					.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	R	R	C	P	G	K	L	I	F	G	C	G	G	V	Y	T	G	E	D	A	F	L	H	V	L	A	G	A	S	M	V	Q	V	G	T	A	L	Q	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						T	T	S						S	S			S											T														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.
		407	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	A	A	D	K	L	V	P	E	G	I	E	G	R	V	A	Y	K	G	R	L	K	E	I	I	H	Q	Q	M	G	G	L	R	S	C	M	G	L	T	G	C	G	T	I	D	E	L	R	T	K	A	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	P	.	.	S	I	F	E	R	L	T	S	E	L	L	G	V	M	A	K	K	R	Y	Q	T	L	D	E	F	R	G	K	V	R
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		T	.	.	T																T	T			S	G	G	G	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			.	.
Template SS confidence
																				279	280			.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310