Job Description P24181 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:40:58 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 675 % Identity 17% Template c3aqpB_ PDB info PDB header:membrane protein Chain: B: PDB Molecule:probable secdf protein-export membrane protein; PDBTitle: crystal structure of secdf, a translocon-associated membrane protein,2 from thermus thrmophilus Resolution 3.30 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160			.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																													.	.
Query SS confidence																																																																													.	.
Query Sequence		G	S	V	T	I	T	L	T	F	Q	S	G	T	D	P	D	I	A	Q	V	Q	V	Q	N	K	L	Q	L	A	T	P	L	L	P	Q	E	V	Q	Q	Q	G	I	S	V	E	K	S	S	S	S	Y	L	M	V	A	G	F	V	S	D	N	P	G	T	T	Q	D	D	I	S	D	Y	V	A	S	.	.	N	V	K
Query Conservation																																																																													.	.
Alig confidence																																	.	.																												.	.	.	.												.	.
Template Conservation																																	.	.																												.	.	.	.
Template Sequence		G	G	L	R	I	V	L	E	A	D	V	E	N	P	T	L	D	D	L	E	K	A	R	T	V	L	E	N	R	I	N	.	.	A	L	G	V	A	E	P	L	I	Q	I	Q	G	Q	K	R	I	V	V	E	L	P	G	L	S	Q	A	.	.	.	.	D	Q	D	R	A	L	K	L	I	G	Q	R	A	V	L	E
Template Known Secondary structure												S	S	S																			.	.					S	S							T	T	T													.	.	.	.											S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.																												.	.	.	.
Template SS confidence
		41	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.			.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.					.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
Predicted Secondary structure																			.
Query SS confidence																			.
Query Sequence		D	T	L	S	R	L	N	G	V	G	D	V	Q	L	F	G	A	.	Q	Y	A	M	R	I	W	L	D	A	D	L	L	N	K	Y	K	L	T	P	V	D	V	I	N	Q	L	K	V	Q	N	D	Q	I	A	A	G	Q	L	G	G	T	P	A	L	P	G	Q	Q	L	N	A	S	I	I	A	Q	T	R	F	K	N
Query Conservation																			.
Alig confidence																			.																																													.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	R	I	V	K	E	G	A	T	G	T	T	V	A	Q	I	N	Q	A	L	R	E	N	P	R	L	N	R	E	E	L	E	K	D	L	I	K	P	E	D	L	G	P	P	L	L	T	G	A	D	L	A	D	A	R	A	V	F	D	Q	F	G	.	.	.	.	.	.	R	P	Q	V	S	L	T	F	T	P	E	G
Template Known Secondary structure									T	T		B												S	S											B				S	S					S			S												T	T	T	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		115	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.							.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	E	E	F	G	K	V	T	L	R	V	N	S	D	G	S	V	V	R	L	K	D	V	A	R	V	E	L	G	G	E	N	Y	N	V	I	A	R	I	N	G	K	P	A	A	G	L	G	I	K	L	A	T	G	A	N	A	L	D	T	A	K	A	I	K	A	K	L	A	E	L	Q	P	F	F	P	Q	G	M	K
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation																								.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Sequence		A	K	K	F	E	E	V	T	R	Q	N	I	G	K	R	L	A	I	V	L	D	G	.	.	.	.	R	V	Y	T	A	P	V	I	R	Q	A	I	T	G	G	Q	A	V	I	.	.	.	.	.	.	.	E	G	L	S	S	V	E	E	A	S	E	I	A	L	V	L	R	.	.	S	G	S	L	P	V	P	L	K
Template Known Secondary structure												T	T	T	S							T	T	.	.	.	.									S	S				S	S					.	.	.	.	.	.	.						S	S											.	.				S
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template SS confidence
		189	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210					.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.								230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.			.	.	.	250	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.		.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure													.
Query SS confidence													.
Query Sequence		V	L	Y	P	Y	D	T	T	P	F	V	.	Q	L	S	I	H	E	V	V	K	T	L	F	E	A	I	M	L	V	F	L	V	M	Y	L	F	L	Q	N	M	R	A	T	L	I	P	T	I	A	V	P	V	V	L	L	G	T	F	A	I	L	A	A	F	G	Y	S	I	N	T	L	T	M	F	G	M	V	L	A
Query Conservation													.
Alig confidence													.																												.
Template Conservation																																									.
Template Sequence		V	A	E	I	R	A	I	G	P	T	L	G	Q	D	A	I	Q	A	G	I	R	S	A	L	I	G	T	L	A	I	F	L	L	I	F	A	Y	Y	G	.	P	H	L	G	L	V	A	S	L	G	L	L	Y	T	S	A	L	I	L	G	L	L	S	G	L	G	A	T	L	T	L	P	G	I	A	G	L	V	L	T
Template Known Secondary structure																																								T	.
Template Predicted Secondary structure																																									.
Template SS confidence
		256	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.		.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	G	L	L	V	D	D	A	I	V	V	V	E	N	V	E	R	V	M	M	E	D	K	L	P	P	K	E	A	T	E	K	S	M	S	Q	I	Q	G	A	L	V	G	I	A	M	V	L	S	A	V	F	I	P	M	A	F	F	G	G	S	T	G	A	I	Y	R	Q	F	S	I	T	I	V	S	A	M	A	L	S
Query Conservation
Alig confidence																.																																																.	.	.
Template Conservation																.																																																.	.	.
Template Sequence		L	G	A	A	V	D	G	N	V	L	S	F	E	R	.	I	K	E	E	L	R	A	G	K	K	L	R	Q	A	I	P	E	G	F	R	H	S	T	L	T	I	M	D	V	N	I	A	H	L	L	A	A	A	A	L	Y	Q	Y	A	T	G	P	.	.	.	V	R	G	F	A	V	I	L	A	I	G	V	V	A	S
Template Known Secondary structure																.							T	T																																			T			T		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																.																																																.	.	.
Template SS confidence
		335	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.		.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.				.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410
		482	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	L	V	A	L	I	L	T	P	A	L	C	A	T	L	L	K	P	V	S	A	E	H	H	E	N	K	G	G	F	F	G	W	F	N	T	T	F	D	H	S	V	N	H	Y	T	N	S	V	G	K	I	L	G	S	T	G	R	Y	L	L	I	Y	A	L	I	V	A	G	M	V	V	L	F	L	R	L	P	S	S
Query Conservation
Alig confidence																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		V	F	S	N	L	V	F	S	R	H	L	L	E	R	L	A	D	R	G	E	I	R	P	P	M	W	L	V	D	P	R	F	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	M	G	P	A	R	Y	V	T	A	A	T	L	L	L	A	A	L	A	A	G	V	V	F	A	K	G	F	N
Template Known Secondary structure																				T														S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T																							T
Template Predicted Secondary structure																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		411	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
		562	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	L	P	E	E	D	Q	G	V	F	L	T	M	I	Q	L	P	A	G	A	T	Q	E	R	T	Q	K	V	L	D	Q	V	T	D	Y	Y	L	K	N	E	K	A	N	V	E	S	V	F	T	V	N	G	F	S	F	S	G	Q	A	Q	N	A	G	M	A	F	V	S	L	K	P	W	E	E	R	N	G	D	E	N
Query Conservation
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	S	I	D	F	T	G	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		473	.	.	.	.	.	.	480	.
		642	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	A	E	A	V	I	H	R	A	K	M	E	L	G	K	I	R	D	G	F	V	I	P	F	N	M	P	A	I	V	E	L	G	T	A	T	G	F	D	F	E	L	I	D	Q	A	G	L	G	H	D	A	L	T	Q	A	R	N	Q	L	L	G	M	A	A	Q	H	P	A	S	L	V	S	V	R	P	N	G	L	E
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		722	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	T	A	Q	F	K	L	E	V	D	Q	E	K	A	Q	A	L	G	V	S	L	S	D	I	N	Q	T	I	S	T	A	L	G	G	T	Y	V	N	D	F	I	D	R	G	R	V	K	K	L	Y	V	Q	A	D	A	K	F	R	M	L	P	E	D	V	D	K	L	Y	V	R	S	A	N	G	E	M	V	P	F	S
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.								.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.								.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	A	Y	T	L	R	A	E	.	.	.	.	.	.	P	N	V	E	V	E	T	L	R	R	F	L	E	E	K	G	F	P	G	K	E	A	V	I	T	Q	V	Y	R	E	F	L	V	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.								.	.	.	.	.	.	T	T												T	T	T	S		S	S	S														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.								.	.	.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
					482	.	.	.	.	.	.							.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.
		802	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	F	T	T	S	H	W	V	Y	G	S	P	R	L	E	R	Y	N	G	L	P	S	M	E	I	Q	G	E	A	A	P	G	T	S	S	G	D	A	M	A	L	M	E	N	L	A	S	K	L	P	A	G	I	G	Y	D	W	T	G	M	S	Y	Q	E	R	L	S	G	N	Q	A	P	A	L	V	A	I	S	F	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	P	L	S	D	E	R	R	L	E	L	E	R	L	F	A	S	E	L	K	A	T	V	L	A	S	E	T	V	G	P	A	I	G	E	E	L	R	R	N	A	V	M	A	V	L	V	G	L	G
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		S																		S	S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																															529	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		882	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.		.	.	.	.	.	960
Predicted Secondary structure																																																																											.
Query SS confidence																																																																											.
Query Sequence		V	V	F	L	C	L	A	A	L	Y	E	S	W	S	I	P	V	S	V	M	L	V	V	P	L	G	I	V	G	V	L	L	A	A	T	L	F	N	Q	K	N	D	V	Y	F	M	V	G	L	L	T	T	I	G	L	S	A	K	N	A	I	L	I	V	E	F	A	K	D	L	M	E	K	.	E	G	K	G	V	V
Query Conservation																																																																											.
Alig confidence												.																																																															.
Template Conservation												.
Template Sequence		L	I	L	L	Y	V	A	F	R	F	.	D	W	T	F	G	V	A	S	I	L	A	V	A	H	D	V	A	I	V	A	G	M	Y	S	L	L	G	L	E	F	S	I	P	T	I	A	A	L	L	T	I	V	G	Y	S	I	N	D	S	I	V	V	S	D	R	I	R	E	N	Q	K	L	L	R	H	L	P	Y	A
Template Known Secondary structure											S	.																											T																																					S	S	S
Template Predicted Secondary structure												.
Template SS confidence
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.		590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.
		961	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	A	T	L	M	A	V	R	M	R	L	R	P	I	L	M	T	S	L	A	F	I	L	G	V	L	P	L	A	I	S	N	G	A	G	S	G	A	Q	N	A	V	G	I	G	V	M	G	G	M	V	S	A	T	L	L	A	I	F	F	V	P	V	F	F	V	V	I	R	R	C
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.
Template Sequence		E	L	V	N	R	S	I	N	Q	T	L	S	R	T	V	M	T	S	L	T	T	L	L	P	I	L	A	L	L	F	L	G	G	S	V	.	.	.	L	R	D	F	A	L	A	I	F	V	G	I	F	V	G	T	Y	S	S	I	Y	V	V	S	A	L	V	V	A	W	K	N	R
Template Known Secondary structure																																					.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.
Template SS confidence
		659	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.				.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.