Job Description P77202 Confidence 55.85% Date Thu Jan 5 12:26:16 GMT 2012
Rank 313 Aligned Residues 105
% Identity 15% Template c3gknA_
PDB info
PDB header: oxidoreductaseChain: A: PDB Molecule: bacterioferritin comigratory protein;
PDBTitle: insights into the alkyl peroxide reduction activity of xanthomonas2 campestris bacterioferritin comigratory protein from the trapped3 intermediate/ligand complex structures
Resolution 1.47 Å
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112 . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 .
. . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . .
Predicted Secondary structure  
. . .
Query SS confidence  
.
.
.
Query Sequence  
K D A P V I V Y V F A D P F C P Y C K Q F W Q Q A R P W V D .
.
.
S G K V Q L R T L L V G V I K P E S P A T A A A I L A S K D P A K T W Q Q Y E A S G G K L K L
Query Conservation  
                                    . . .                                                                        
Alig confidence  
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Template Conservation  
                                                                    . . . . . . . . . . . . . . . . .                                        
Template Sequence  
A G H W L V I Y F Y P K D S T P G A T T E G L D F N A L L P E F D K A G A K I L G V S .
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R D S V K S H D N F C A K Q G F A F P L
Template Known Secondary structure  
T T S S T T S T T . . . . . . . . . . . . . . . . . S S S S
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . . . . . .
Template SS confidence  
   
31 . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60 . . . . . . . . . 70 . . .
. . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . .
 
   
189 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . .
. . . . 220 . . . . . . . . . 230 . .
. . . . . . . 240 . . . . .
Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . .
Query SS confidence  
.
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Query Sequence  
N V P A N V S T E Q M K V L S D N E K L M D D L G A N .
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.
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V T P A I Y Y M S K E N T L Q Q A .
V G L P D Q K T L N I I M
Query Conservation  
                                            . . . . . . . . . . . .                 .                  
Alig confidence  
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Template Conservation  
  . . . . . . . . . . . .                                                                                                
Template Sequence  
V .
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S D G D E A L C R A F D V I K E K N M Y G K Q V L G I E R S T F L L S P E G Q V V Q A W R K V K V A G H A D A V L
Template Known Secondary structure  
. . . . . . . . . . . . T T T T T T T T S S S T T
Template Predicted Secondary structure  
. . . . . . . . . . . .
Template SS confidence  
   
94
. . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]