Job Description P18133 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:36:41 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 349 % Identity 18% Template c2e5cA_ PDB info PDB header:transferase Chain: A: PDB Molecule:nicotinamide phosphoribosyltransferase; PDBTitle: crystal structure of human nmprtase complexed with 5'-phosphoribosyl-2 1'-pyrophosphate Resolution 2.20 Å

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		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.		.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.								.	.	80
Predicted Secondary structure																																																				.																				.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																				.																				.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		L	H	S	L	L	D	T	D	A	Y	K	L	H	M	Q	Q	A	V	F	H	H	Y	Y	D	V	H	V	A	A	E	F	R	C	R	G	D	D	L	L	G	I	Y	A	D	A	I	R	E	Q	V	.	Q	A	M	Q	H	L	R	L	Q	D	D	E	Y	Q	W	L	S	A	L	.	.	.	.	.	.	.	P	F	F
Query Conservation																																																				.																				.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.																												.																				.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.
Template Sequence		F	N	I	L	L	A	T	D	S	Y	K	V	T	H	Y	K	Q	Y	P	P	N	.	.	T	S	K	V	Y	S	Y	F	E	C	R	E	K	K	Y	E	E	T	V	F	Y	G	L	Q	Y	I	L	N	K	Y	L	K	G	K	V	V	T	K	E	K	I	Q	E	A	K	D	V	Y	K	E	H	F	Q	D	D	V	F
Template Known Secondary structure				G	G	G	S	S		G	G	G	G	G	G	G	G	T	S		T	T	.	.																						S									T	S	S																				T	S			S
Template Predicted Secondary structure																							.	.
Template SS confidence
		9	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.			30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.				.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.					.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.	.																		.	.	.	.
Query SS confidence													.	.	.																		.	.	.	.
Query Sequence		K	A	D	Y	L	N	W	L	R	E	F	.	.	.	R	F	N	P	E	Q	V	T	V	S	N	D	N	G	K	L	D	.	.	.	.	I	R	L	S	G	P	W	R	E	V	I	L	W	E	V	P	L	L	A	V	I	S	E	M	V	H	R	Y	R	S	P	Q	A	D	V	A	Q	A	L	D	T	L	E	S	K
Query Conservation													.	.	.																		.	.	.	.
Alig confidence													.	.	.																		.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	E	K	G	W	N	Y	I	L	E	K	Y	D	G	H	L	P	I	E	I	K	A	V	P	E	G	F	V	I	P	R	G	N	V	L	F	T	V	E	N	T	D	P	E	C	Y	W	L	T	N	W	I	E	T	I	L	V	Q	S	W	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	I
Template Known Secondary structure														T	T											T	T					S	S	S								S	S	G	G	G	T	T					T						T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
		154	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.														.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.					.	.	.	.	.	210	.	.	.
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.										.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.										.	.	.
Query Sequence		L	V	D	F	S	A	L	T	A	G	L	D	M	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	F	H	L	M	D	F	G	T	R	R	R	F	S	R	E	V	Q	E	T	I	V	K	R	L	Q	Q	E	S	W	F	V	G	T	S	N	Y	.	.	.	.	D	L	A	R	R	L	S	L	T	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																						.	.	.	.										.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.																		.	.	.	.										.	.	.
Template Conservation																																															.	.
Template Sequence		T	V	A	T	N	S	R	E	Q	K	K	I	L	A	K	Y	L	L	E	T	S	G	N	L	D	G	L	E	Y	K	L	H	D	F	G	Y	R	G	V	S	S	Q	E	T	A	.	.	G	I	G	A	S	A	H	L	V	N	F	K	G	T	D	T	V	A	G	L	A	L	I	K	K	Y	Y	G	T	K	D	P	V
Template Known Secondary structure																							S	S		T	T	G	G	G	S						G	G	G	S	S						.	.								T	T	T			B	B	S		T										T			S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																															.	.
Template SS confidence
		160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.			.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.
					214	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.										270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.
Predicted Secondary structure		.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	P	M	G	T	Q	A	H	E	W	F	Q	A	H	Q	Q	I	S	P	D	L	A	N	S	Q	R	A	A	L	A	A	W	L	E	E	Y	P	D	Q	L	G	I	A	L	T	D	C	I	T	M	D	A	F	L	R	D	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	V	E	F	A	S	R	Y	Q	G	L	R
Query Conservation		.	.	.																																																									.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.															.	.	.	.	.	.																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	G	Y	S	V	P	A	A	E	H	S	T	I	T	A	W	G	.	.	.	.	.	.	K	D	H	E	K	D	A	F	E	H	I	V	T	Q	F	S	S	V	P	V	S	V	V	S	D	S	Y	D	I	Y	N	A	C	E	K	I	W	G	E	D	L	R	H	L	I	V	S	R	S	T	Q	A	P	L	I	I	R
Template Known Secondary structure		S		B				B								T	T		.	.	.	.	.	.	G	G	G												T	S	S	S								S	S								T						T	G	G	G	T	T	T			T	T	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		238	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.							.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.
		282	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.											.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.					.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Query Sequence		H	D	S	G	D	P	V	E	W	G	E	K	A	I	A	H	Y	E	K	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	D	P	Q	S	K	T	L	V	F	S	D	N	L	D	L	R	K	A	V	E	.	.	.	.	L	Y	R	H	F	S	S	R	V	Q	L	S	F	G	I	G	T	R	L	T	C	D	I	P
Query Conservation																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	.																						.
Template Conservation																																																																															.
Template Sequence		P	D	S	G	N	P	L	D	T	V	L	K	V	L	E	I	L	G	K	K	F	P	V	T	E	N	S	K	G	Y	K	L	L	P	P	Y	L	R	V	I	Q	G	D	G	V	D	I	N	T	L	Q	E	I	V	E	G	M	K	Q	K	M	W	S	I	E	N	I	A	F	G	S	G	G	G	L	L	Q	.	K	L
Template Known Secondary structure				S	S																	S						T	T	S						T	T							S	S																T	T	B		G	G	G						S					T	.	S
Template Predicted Secondary structure																																																																															.
Template SS confidence
		312	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.		.	390
		348	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.			.	360	.	.	.	.			.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.		.	.	.	.	380	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure													.	.							.	.							.						.
Query SS confidence													.	.							.	.							.						.
Query Sequence		Q	V	K	P	L	N	I	V	I	K	L	.	.	V	E	C	N	G	K	.	.	P	V	A	K	L	S	.	D	S	P	G	K	.	T	I	C	H	D	K	A	F	V	R
Query Conservation													.	.							.	.							.						.
Alig confidence													.	.							.	.							.						.
Template Conservation
Template Sequence		T	R	D	L	L	N	C	S	F	K	C	S	Y	V	V	T	N	G	L	G	I	N	V	F	K	D	P	V	A	D	P	N	K	R	S	K	K	G	R	L	S	L	H	R
Template Known Secondary structure			T	T	T	T	T											T	T										T	T		G	G	G					S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.