Job Description P16694 Confidence 98.98% Date Thu Jan 5 11:35:44 GMT 2012 Rank 75 Aligned Residues 267 % Identity 15% Template d2qm8a1 SCOP info P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases Nitrogenase iron protein-like Resolution 1.70

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		25	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.		.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90							.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.																																														.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.																																														.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	L	L	E	K	M	P	L	S	V	P	G	D	D	A	P	Q	L	A	L	P	.	W	S	Q	P	N	I	A	E	R	H	A	M	L	N	N	E	L	R	K	I	S	R	L	E	M	V	L	A	I	V	G	T	M	K	A	G	K	S	T	T	I	N	A	I	V	.	.	.	.	.	.	G	T	E	V	L	P	N
Query Conservation																							.																																														.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.																																														.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	L	R	E	R	L	L	A	G	D	R	A	A	L	A	R	A	I	T	L	A	E	S	R	R	A	D	H	R	A	A	V	R	D	L	I	D	A	V	L	P	Q	T	G	R	A	I	R	V	G	I	T	G	V	P	G	V	G	K	S	T	T	I	D	A	L	G	S	L	L	T	A	A	G	H	K	V	A	V	L
Template Known Secondary structure									T	T													T		S	S															G	G	G				S									T	T	S																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		98	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	R	P	M	T	A	L	P	T	L	I	R	H	T	P	G	Q	K	E	P	V	L	H	F	S	H	V	A	P	I	D	C	L	I	Q	Q	L	Q	Q	R	L	R	D	C	D	I	K	H	L	T	D	V	L	E	I	D	K	D	M	R	A	L	M	Q	R	I	E	N	G	V	A	F	E	K	Y	Y	L	G	A
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	V	D	P	S	S	T	R	T	G	G	S	I	L	G	D	K	T	R	X	A	R	L	A	I	D	R	N	A	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure					G	G	G	G	S	S				S	S			G	G	G	S	T	T	G	G	G		T	T			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		178	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	P	I	F	H	C	L	K	S	L	N	D	L	V	R	L	A	K	A	L	D	V	D	F	P	F	S	A	Y	A	A	I	E	H	I	P	V	I	E	V	E	F	V	H	L	A	G	L	E	S	Y	P	G	Q	L	T	L	L	D	T	P	G	P	N	E	A	G	Q	P	H	L	Q	K	M	L	N	Q	Q	L	A
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	R	P	S	P	S	S	G	T	L	G	G	V	A	A	K	T	R	E	T	.	X	L	L	C	E
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								S	S												.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					.
Template SS confidence
																																																								120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.		140	.	.	.	.
		258	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.													.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	A	S	A	V	L	A	V	L	D	Y	T	Q	L	K	S	I	S	D	E	E	V	R	E	A	I	L	A	V	G	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	V	P	L	Y	V	L	V	N	K	F	D	Q	Q	D	R	N	S	D	D	A	D	Q	V	R	A	L	I	S	G	T	L	M	K	G	C	I
Query Conservation																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation												.																																													.
Template Sequence		A	A	G	F	D	V	I	L	V	E	.	T	V	G	V	G	Q	S	E	T	A	V	A	D	L	T	D	F	F	L	V	L	X	L	P	G	A	I	K	K	G	I	F	E	L	A	D	X	I	A	V	N	K	A	D	.	D	G	D	G	E	R	R	A	S	A	A	A	S	E	Y	R	A	A	L	H	I	L	T	P
Template Known Secondary structure			T	T								.			S	S	S	S							T	T	S	S								S					T	T						S								S	.	T	T																		T	T	S
Template Predicted Secondary structure												.																																													.
Template SS confidence
		145	.	.	.	.	150	.	.	.	.		.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.		.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.
		326	.					.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.
Query Sequence		T	P	.	.	.	.	Q	Q	I	F	P	V	S	S	M	W	G	Y	L	A	N	R	A	R	Y	E	L	A	N	N	G	K	L	P	P	P	E	Q	Q	R	W	V	E	D	F	A	H	A	A	L	G	R	R	W	R	H	A	D	L	A	D	L	E	H	I	R	H	A	A	D	Q	L	W	E	D	S	L	F	A	Q
Query Conservation				.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	S	A	T	W	T	P	P	V	V	T	I	S	G	L	H	G	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	D	S
Template Known Secondary structure		S	B	T	T	B								B	T	T	T	T	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S
Template Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		229	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.																																																											.	.	.	250
		402	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.						.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.	.	.	.
Query SS confidence																												.	.	.	.	.
Query Sequence		P	I	Q	A	L	L	H	A	A	Y	A	N	A	S	L	Y	A	L	R	S	A	A	H	K	L	L	.	.	.	.	.	N	Y	A	Q	Q	A	R	E	Y	L	D	F	R	A	H	G	L	N	V	A	C	E	Q	L	R	Q	N	I	H
Query Conservation																												.	.	.	.	.
Alig confidence																												.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	W	S	R	I	E	D	H	R	S	K	L	T	A	T	G	E	I	A	G	K	R	R	E	Q	D	V	K	W	X	W	A	L	V	H	E	R	L	H	Q	R	L	V	G	S	A	E	V	R	Q	A	T	A	E	A	E	R	A	V	A
Template Known Secondary structure																T	T																											T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		251	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310