Job Description P17169 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:36:02 GMT 2012 Rank 27 Aligned Residues 237 % Identity 22% Template d1ofda3 SCOP info Ntn hydrolase-like N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) Class II glutamine amidotransferases Resolution 2.00

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.						.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.									30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	G	I	V	G	A	I	A	Q	R	.	.	.	.	.	D	V	A	E	I	L	L	E	G	L	R	R	L	E	Y	R	G	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	D	S	A	G	L	A	V	V	D	A	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	G	V	G	F	I	A	N	L	R	G	K	P	D	H	T	L	V	E	Q	A	L	K	A	L	G	C	M	E	H	R	G	G	C	S	A	D	N	D	S	G	D	G	A	G	V	M	T	A	I	P	R	E	L	L	A	Q	W	F	N	T	R	N	L	P	M	P	D	G	D	R	L	G	V	G	M	V	F	L	P
Template Known Secondary structure										S	S	S			B	S													T	G	G	G	S		B		T	T	S	S	S	B	S																				T	T						G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	E	P	S	A	R	E	V	A	R	A	Y	V	E	E	V	V	R	L	E	K	L	T	V	L	G	W	R	E	V	P	V	N	S	D	V	L	G	I	Q	A	K	N	N	Q	P	H	I	E	Q	I	L	V	T	C	P	E	G	C	A	G	D	E	L	D	R	R	L	Y	I	A	R	S	I	I	G	K	K	L	A
Template Known Secondary structure		S	S																		T	T											B		G	G	G	S																			T	T																			G	G	G		B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
												42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.				.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	M	T	R	L	R	R	L	G	K	V	Q	M	L	.	.	.	A	Q	A	A	E	E	H	P	L	H	G	G	T	G	I	A	H	T	R	W	A	T	H	G	E	P	S	E	V	N	A	H	P	H	V	S	E	H	I	V	V	V	H	N	G	I	I	E	N	H	E	P	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.																																			.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.
Template Sequence		E	D	F	Y	V	C	S	F	S	C	R	T	I	V	Y	K	G	M	V	R	S	I	I	L	G	E	F	Y	L	D	L	K	N	P	G	Y	T	S	N	F	A	V	Y	H	R	R	F	S	T	N	T	M	P	K	W	P	L	A	Q	P	M	.	.	.	.	R	L	L	G	H	N	G	E	I	N	T	L	L	G	N
Template Known Secondary structure		T	T	B							S	S							S	S									B						T	T			B	S										S	S	S				G	G	G	S	S			.	.	.	.	S	S								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.					.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.
		109	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150
Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		R	E	E	L	K	A	R	G	Y	T	F	V	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	T	E	V	I	A	H	L	V	N	W	E	L	K	Q	G	G	T	L	R	E	A	V	L	R	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	N	W	M	A	A	R	E	K	E	L	E	V	S	G	W	T	K	A	E	L	E	A	L	T	P	I	V	N	Q	A	N	S	D	S	Y	N	L	D	S	A	L	E	L	L	V	R	T	G	R	S	P	L	E	A	A	M	I	L	V	P	E	A	Y	K	N	Q	P	A	L	K	D	Y	P	E	I	S	D	F	H
Template Known Secondary structure									G	G	G				T	T												S			T	T	S																T	T											S					T	T		G	G	G	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
									151	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.				.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.				.	.	.	210	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.															.																	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.															.																	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	P	Q	L	R	G	A	Y	G	T	V	I	M	D	S	R	H	P	D	T	L	L	A	A	R	S	G	.	.	.	S	P	L	V	I	G	L	G	M	G	E	N	F	I	.	A	S	D	Q	L	A	L	L	P	V	T	R	R	F	I	F	.	.	.	L	E	E	G	D	I	A	E	I	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.															.																	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.															.	.	.										.	.	.															.																	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.
Template Sequence		D	Y	Y	S	G	L	Q	E	P	W	D	G	P	A	L	L	V	F	S	D	G	.	.	.	K	I	V	G	A	G	L	D	R	N	G	L	R	P	A	R	Y	C	I	T	K	D	D	Y	I	V	L	G	S	E	A	G	V	V	D	L	P	E	V	D	I	V	E	K	G	R	L	A	P	G	Q	M	I	A	V	D
Template Known Secondary structure					T	T	T						S	S								S	.	.	.	S								T	T			S								T	T							S	S	T	T		S				G	G	G									T	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.
Template SS confidence
		317	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.				.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
		217	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	R	S	V	N	I	F	D	K	T	G	A	E	V	K	R	Q	D	I	E	S	N	L	Q	Y	D	A	G	D	K	G	I	Y	R	H	Y	M	Q	K	E
Query Conservation
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	A	E	Q	K	I	L	K	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	I	K	Q	Q	A	A	Q	K	Y	P	Y	G	E	W	I	K	I	Q
Template Known Secondary structure		T	T	T	T							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.								T	T	S
Template Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		394	.	.	.	.	.	400	.	.	.												.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.

No model constructed - rank, confidence too low

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Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
© Structural Bioinformatics Group, Imperial College, London Lawrence Kelley, Benjamin Jefferys   Disclaimer Terms and Conditions