Job Description P17169 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:36:02 GMT 2012 Rank 28 Aligned Residues 234 % Identity 23% Template d1ea0a3 SCOP info Ntn hydrolase-like N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) Class II glutamine amidotransferases Resolution 3.0

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		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.						.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.									.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	G	I	V	G	A	I	A	Q	R	.	.	.	.	.	D	V	A	E	I	L	L	E	G	L	R	R	L	E	Y	R	G	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	S	A	G	L	A	V	V	D	A	E	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation												.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		C	G	V	G	F	I	A	A	I	D	G	K	P	R	R	S	V	V	E	K	G	I	E	A	L	K	A	V	W	H	R	G	A	V	D	A	D	G	K	T	G	D	G	A	G	I	H	V	A	V	P	Q	K	F	F	K	D	H	V	K	V	I	G	H	R	A	P	D	N	K	L	A	V	G	Q	V	F	L	P	R
Template Known Secondary structure										T	T				B												T	S		G	G	G	S				T	T	S	S			S		B																		T	T					S	S											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	S	L	D	A	Q	E	A	C	R	C	I	V	E	T	E	I	L	A	F	G	Y	Y	I	Y	G	W	R	Q	V	P	I	N	V	D	I	I	G	E	K	A	N	A	T	R	P	E	I	E	Q	I	I	V	G	N	N	K	G	V	S	D	E	Q	F	E	L	D	L	Y	I	I	R	R	R	I	E	K	A	V	K
Template Known Secondary structure		S																			T	T													G	G	G	S																			T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160
																42	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.				60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	M	T	R	L	R	R	L	G	K	V	Q	M	L	A	Q	A	A	.	.	.	E	E	H	P	L	H	G	G	T	G	I	A	H	T	R	W	A	T	H	G	E	P	S	E	V	N	A	H	P	H	V	S	E	H	I	V	V	V	H	N	G	I	I	E	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.																																	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.
Template Sequence		G	E	Q	I	N	D	F	Y	I	C	S	L	S	A	R	S	I	I	Y	K	G	M	F	L	A	E	Q	L	T	T	F	Y	P	D	L	L	D	E	R	F	E	S	D	F	A	I	Y	H	Q	R	Y	S	T	N	T	F	P	T	W	P	L	A	Q	P	F	R	M	.	.	.	.	L	A	H	N	G	E	I	N	T
Template Known Secondary structure				T			S								S	S						B	S	S		G	G	G						G	G	G	G	S	T	T			B	S										S		S				S	T	T	S	S			S	S	.	.	.	.								T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.
Template SS confidence
		161	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.					.	.	230	.	.	.	.	.	.
		105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		H	E	P	L	R	E	E	L	K	A	R	G	Y	T	F	V	S	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	D	T	E	V	I	A	H	L	V	N	W	E	L	K	Q	G	G	T	L	R	E	A	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	K	G	N	V	N	W	M	K	A	H	E	T	R	M	E	H	P	A	F	G	T	H	M	Q	D	L	K	P	V	I	G	V	G	L	S	D	S	G	S	L	D	T	V	F	E	V	M	V	R	A	G	R	T	A	P	M	V	K	M	M	L	V	P	Q	A	L	T	T	T	P	D	N	H	K	A	L	I	Q	Y
Template Known Secondary structure													G	G	G				S	T	T	G	G	G							S	S		T	T																	T	T											S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		237	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.
			147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.				.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190		.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.				.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																															.	.	.															.																	.	.	.
Query SS confidence		.																															.	.	.															.																	.	.	.
Query Sequence		.	L	R	A	I	P	Q	L	R	G	A	Y	G	T	V	I	M	D	S	R	H	P	D	T	L	L	A	A	R	S	G	.	.	.	S	P	L	V	I	G	L	G	M	G	E	N	F	I	.	A	S	D	Q	L	A	L	L	P	V	T	R	R	F	I	F	.	.	.	L	E	E	G	D	I	A	E	I	T	R	R
Query Conservation		.																															.	.	.															.																	.	.	.
Alig confidence		.																			.	.	.										.	.	.															.																	.	.	.
Template Conservation																					.	.	.
Template Sequence		C	N	S	V	M	E	P	W	D	G	P	A	A	L	A	M	T	D	G	.	.	.	R	W	V	V	G	G	M	D	R	N	G	L	R	P	M	R	Y	T	I	T	T	D	G	L	I	I	G	G	S	E	T	G	M	V	K	I	D	E	T	Q	V	I	E	K	G	R	L	G	P	G	E	M	I	A	V	D	L	Q
Template Known Secondary structure											S	S							S	S	.	.	.	S								T	T			S								T	T	S						S	S	S	T	T	S				G	G	G									T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure																					.	.	.
Template SS confidence
		320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.				.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	V	N	I	F	D	K	T	G	A	E	V	K	R	Q	D	I	E	S	N	L	Q	Y	D	A	G	D	K	G	I	Y	R	H	Y	M
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	K	L	Y	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	R	E	L	K	D	H	L	A	T	L	K	P	W	D	K	W	V
Template Known Secondary structure		T	T					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	T
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		397	.	.	400	.	.												.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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