Job Description P32138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 3 Aligned Residues 579 % Identity 20% Template c3topA_ PDB info PDB header:hydrolase/hydrolase inhibitor Chain: A: PDB Molecule:maltase-glucoamylase, intestinal; PDBTitle: crystral structure of the c-terminal subunit of human maltase-2 glucoamylase in complex with acarbose Resolution 2.88 Å

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		54	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.					.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.		.	.	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.																																																					.
Query SS confidence																					.	.	.	.																																																					.
Query Sequence		N	F	S	I	K	D	K	L	Q	E	K	I	A	L	T	D	A	I	V	.	.	.	.	S	Q	S	P	D	G	W	L	I	H	F	S	R	G	S	D	I	S	A	T	L	N	I	S	A	D	D	Q	G	R	L	L	L	E	L	Q	N	D	N	L	N	H	N	R	I	W	L	R	L	A	A	Q	.	P	E	D	H
Query Conservation																					.	.	.	.																																																					.
Alig confidence																					.	.	.	.																																																					.
Template Conservation
Template Sequence		Q	F	K	I	Y	D	P	N	K	N	R	Y	E	V	P	V	P	L	N	I	P	S	M	P	S	S	T	P	E	G	Q	L	Y	D	V	L	I	K	K	N	P	F	G	I	E	I	R	R	K	S	T	G	T	I	I	W	D	S	Q	L	L	G	F	T	F	S	D	M	F	I	R	I	S	T	R	L	P	S	K	Y
Template Known Secondary structure								S	S	S													S	S					T	T	T									T	T	T	T							T	T	S									S	S						T	T									S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1051	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.				.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.					.	.	.	.	.	.	.	200	.
Predicted Secondary structure												.	.	.																																																							.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.																																																							.	.	.	.
Query Sequence		I	Y	G	C	G	E	Q	F	S	Y	.	.	.	F	D	L	R	G	K	P	F	P	L	W	T	S	E	Q	G	V	G	R	N	K	Q	T	Y	V	T	W	Q	A	D	C	K	E	N	A	G	G	D	Y	Y	W	T	F	F	P	Q	P	T	F	V	S	T	Q	K	.	.	.	.	Y	Y	C	H	V	D	N	S	C
Query Conservation												.	.	.																																																							.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	Y	G	F	G	E	T	E	H	R	S	Y	R	R	D	L	E	W	H	T	W	G	M	F	S	R	D	Q	P	P	G	Y	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	S	Y	G	V	H	P	Y	Y	M	G	L	E	E	D	G	S	A	H	G	V	L	L	L	N	S	N
Template Known Secondary structure						S	S	S			S	S	S	B				S	S						S						S		T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S											S	S	S											S
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1131	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.
		202	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280
Predicted Secondary structure																																																														.
Query SS confidence																																																														.
Query Sequence		Y	M	N	F	D	F	S	A	P	E	Y	H	E	L	A	L	W	E	D	K	A	T	L	R	F	E	C	A	D	T	Y	I	S	L	L	E	K	L	T	A	L	L	G	R	Q	P	E	L	P	D	W	I	Y	D	G	V	T	L	G	I	.	Q	G	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V
Query Conservation																																																														.
Alig confidence																																																														.
Template Conservation
Template Sequence		A	M	D	V	T	F	Q	P	L	P	A	L	T	Y	R	T	T	G	G	V	L	D	F	Y	V	F	L	G	P	T	P	E	L	V	T	Q	Q	Y	T	E	L	I	G	R	P	V	M	V	P	Y	W	S	L	G	F	Q	L	C	R	Y	G	Y	Q	N	D	S	E	I	A	S	L	Y	D	E	M	V	A	A	Q	I
Template Known Secondary structure		S							T	T	T							S	S	S										S	S																				G	G	G	G	S						T	T			S															T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1192	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.
		281	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.					.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure										.																																																						.	.	.	.
Query SS confidence										.																																																						.	.	.	.
Query Sequence		K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y	P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	Y	V	A	S	D	.	.	.	.	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A
Query Conservation										.																																																						.	.	.	.
Alig confidence										.								.	.	.	.	.	.	.	.	.							.																															.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template Sequence		P	Y	D	V	Q	Y	S	D	I	D	Y	M	E	R	Q	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	T	L	S	P	.	K	F	A	G	F	P	A	L	I	N	R	M	K	A	D	G	M	R	V	I	L	I	L	D	P	A	I	S	G	N	E	T	Q	P	Y	P	A	F	T	R	G	V	E	D	D	V	F	I
Template Known Secondary structure										G	G	G	S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				G	.	G	G	T	T												T									S								S												T		B
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.							.
Template SS confidence
		1272	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.										.	.	1290	.	.	.		.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.
		356	.	.		.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.																						370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.								.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence					.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	D	A	.	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	.	.	.	.	.	.	.	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F
Query Conservation					.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence					.												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																											.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	Y	P	N	D	G	D	I	V	W	G	K	V	W	P	D	F	P	D	V	V	V	N	G	S	L	D	W	D	S	Q	V	E	L	Y	R	A	Y	V	A	F	P	D	F	F	R	N	S	T	A	K	W	W	K	R	E	I	E	E	L	Y	N	N	P	Q	N	P	E	R	S	L	K	F	D	G	M	W	I	D	M
Template Known Secondary structure		B		S	S	S			B										S	S					T	T	S									T							B		T	T	S																S		S	S		G	G	G					S						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1342	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.
		407	.																																						.	410	.	.	.	.	.	.	.					.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Query Sequence		G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	P	T	D	T	Y	L	H	.	.	.	.	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.																												.
Template Conservation																																																																																	.
Template Sequence		N	E	P	S	S	F	V	N	G	A	V	S	P	G	C	R	D	A	S	L	N	H	P	P	Y	M	P	H	L	E	S	R	D	R	G	L	S	S	K	T	L	C	M	E	S	Q	Q	I	L	P	D	G	S	L	V	Q	H	Y	N	V	H	N	L	Y	G	W	S	Q	T	R	P	T	Y	E	A	V	Q	E	V	.
Template Known Secondary structure		T	T	T			S	S	S	S	S	S	S	S					T	T	T	S	S		S	S			S		T	T	G	G	G	T	T	T	T	T	S			T	T						S	S	S									G	G	G																	.
Template Predicted Secondary structure																																																																																	.
Template SS confidence
		1422	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500
		446	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T	L	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C
Query Conservation
Alig confidence																							.													.	.	.																													.	.	.	.
Template Conservation																							.													.	.	.																													.	.	.	.
Template Sequence		T	G	Q	R	G	V	V	I	T	R	S	T	F	P	S	S	G	R	W	A	G	.	H	W	L	G	D	N	T	A	A	W	D	Q	.	.	.	L	K	K	S	I	I	G	M	M	E	F	S	L	F	G	I	S	Y	T	G	A	D	I	C	G	F	F	Q	.	.	.	.	D	A	E	Y	E	M	C	V	R	W	M
Template Known Secondary structure			S	S							S	S			T	T	G	G	G	T			.							B	S	S	T			.	.	.															T			S				B	T	T		S	B	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																							.													.	.	.																													.	.	.	.
Template SS confidence
		1501	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.		.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.				.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.					.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.
		526	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		D	F	S	A	F	T	P	M	M	R	T	H	E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	D	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Q	L	G	A	F	Y	P	F	S	R	N	H	N	T	I	G	T	R	R	Q	D	P	V	S	W	D	V	A	F	V	N	I	S	R	T	V	L	Q	T	R	Y	T	L	L	P	Y	L	Y	T	L	M	H	K	A	H	T	E	G	V	T	V	V	R	P	L	L	H	E	F	V	S	D	Q	V	T	W	D	I	D	S
Template Known Secondary structure					T	T	S	S	S							S	S	S				S	G	G	G	S																																				S				G	G	G	T		T	T		T	T	T	T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1573	.	.	.	.	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1650	.	.
		606	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.		.	.		.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
Predicted Secondary structure																																											.			.
Query SS confidence																																											.			.
Query Sequence		Q	Y	L	L	G	R	D	I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	E	D	N	W	V	H	A	W	T	G	E	A	F	R	G	.	G	E	.	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F	Y	R	A	D	S	E	W	A	A
Query Conservation																																											.			.
Alig confidence																																											.			.
Template Conservation
Template Sequence		Q	F	L	L	G	P	A	F	L	V	S	P	V	L	E	R	N	A	R	N	V	T	A	Y	F	P	R	A	R	W	Y	D	Y	Y	T	G	V	D	I	N	A	R	G	E	W	K	T	L	P	A	P	L	D	H	I	N	L	H	V	R	G	G	Y	I	L	P	W
Template Known Secondary structure		S				T	T	T								S	S	S										S	S					T	T	T			B				S	S									T	T								T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1653	.	.	.	.	.	.	1660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1710	.	.	.	.	.	.	.	.	.