Job Description P32138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 1 Aligned Residues 622 % Identity 18% Template c3lppA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:sucrase-isomaltase; PDBTitle: crystal complex of n-terminal sucrase-isomaltase with kotalanol Resolution 2.15 Å

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		7	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.				.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.				.	80
Predicted Secondary structure																																																		.	.	.																									.	.	.
Query SS confidence																																																		.	.	.																									.	.	.
Query Sequence		Q	L	L	D	F	Q	F	H	Q	N	N	D	S	F	T	L	H	F	Q	Q	R	L	I	L	T	H	S	K	D	N	P	C	L	W	I	G	S	G	I	A	D	I	D	M	F	R	G	N	.	.	.	F	S	I	K	D	K	L	Q	E	K	I	A	L	T	D	A	I	V	S	Q	S	P	D	G	.	.	.	W	L
Query Conservation																																																		.	.	.																									.	.	.
Alig confidence																								.													.	.	.	.	.									.	.	.																									.	.	.
Template Conservation																								.													.	.	.	.	.
Template Sequence		N	V	Q	D	M	T	T	T	S	I	G	V	E	A	K	L	N	R	I	P	S	P	.	T	L	F	G	N	D	I	N	S	V	L	F	.	.	.	.	.	T	T	Q	N	Q	T	P	N	R	F	R	F	K	I	T	D	P	N	N	R	R	Y	E	V	P	H	Q	Y	V	K	E	F	T	G	P	T	V	S	D	T
Template Known Secondary structure										S	S	S												.		S	S	S		B		S					.	.	.	.	.							T	T									T	T	S								S	S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure																								.													.	.	.	.	.
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.		.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.						.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.
		81	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.		.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.				.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																														.															.	.	.
Query SS confidence																																														.															.	.	.
Query Sequence		I	H	F	S	R	G	S	D	I	S	A	T	L	N	I	S	A	D	D	Q	G	R	L	L	L	E	L	Q	N	D	N	L	N	H	N	R	I	W	L	R	L	A	A	Q	.	P	E	D	H	I	Y	G	C	G	E	Q	F	S	Y	.	.	.	F	D	L	R	G	K	P	F	P	L	W	T	S	E	Q	G	V	G
Query Conservation																																														.															.	.	.
Alig confidence																																														.															.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	Y	D	V	K	V	A	Q	N	P	F	S	I	Q	V	I	R	K	S	N	G	K	T	L	F	D	T	S	I	G	P	L	V	Y	S	D	Q	Y	L	Q	I	S	A	R	L	P	S	D	Y	I	Y	G	I	G	E	Q	V	H	K	R	F	R	H	D	L	S	W	K	T	W	P	I	F	T	R	D	Q	L	P	G
Template Known Secondary structure		S								T	T								T	T	T	T						G	G	G	S						T	T									S	S	S							S	S			S	S	S	S				S	S						S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		156	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
		157	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.						.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.
Predicted Secondary structure																																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																																		.	.	.	.	.
Query Sequence		R	N	K	Q	T	Y	V	T	W	Q	A	D	C	K	E	N	A	G	G	D	Y	Y	W	T	F	F	P	Q	P	T	F	V	.	.	.	.	.	S	T	Q	K	Y	Y	C	H	V	D	N	S	C	Y	M	N	F	D	F	S	A	P	E	Y	H	E	L	A	L	W	E	D	K	A	T	L	R	F	E	C	A	D	T
Query Conservation																																		.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		D	N	N	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	Y	G	H	Q	T	F	F	M	C	I	E	D	T	S	G	K	S	F	G	V	F	L	M	N	S	N	A	M	E	I	F	I	Q	P	T	P	I	V	T	Y	R	V	T	G	G	I	L	D	F	Y	I	L	L	G	D	T
Template Known Secondary structure		S	S			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S											S	T	T												S								T	T	T							S	S	S										S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		236	.	.	.																			240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		232	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.																												.
Query SS confidence																																.																												.
Query Sequence		Y	I	S	L	L	E	K	L	T	A	L	L	G	R	Q	P	E	L	P	D	W	I	Y	D	G	V	T	L	G	I	.	Q	G	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N
Query Conservation																																.																												.
Alig confidence																																.																												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	E	Q	V	V	Q	Q	Y	Q	Q	L	V	G	L	P	A	M	P	A	Y	W	N	L	G	F	Q	L	S	R	W	N	Y	K	S	L	D	V	V	K	E	V	V	R	R	N	R	E	A	G	I	P	F	D	T	Q	V	T	D	I	D	Y	M	E	D	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	T	Y	D
Template Known Secondary structure																					G	G	G	G	S						S				S														T	T										G	G	G	S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.										.	.	.	.	.
		310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.								.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.		.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.	.	.	.																			.
Query SS confidence																																					.	.	.	.	.	.	.																			.
Query Sequence		S	E	N	Y	P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	Y	V	A	S	D	K	D	L	.	.	.	.	.	.	.	C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	.	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E
Query Conservation																																					.	.	.	.	.	.	.																			.
Alig confidence																																					.	.	.	.	.	.	.																			.
Template Conservation
Template Sequence		Q	V	A	F	N	G	L	P	Q	F	V	Q	D	L	H	D	H	G	Q	K	Y	V	I	I	L	D	P	A	I	S	I	G	R	R	A	N	G	T	T	Y	A	T	Y	E	R	G	N	T	Q	H	V	W	I	N	E	S	D	G	S	T	P	I	I	G	E	V	W	P	G	L	T	V	Y	P	D	F	T	N	P	N
Template Known Secondary structure		T	T	T	T	T	T											T	T									S					S			T	T	S													T		B		B		T	T	S	S	S	B						T	T						B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		369	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	P	T	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation																																																																										.
Template Sequence		C	I	D	W	W	A	N	E	C	S	I	F	H	Q	E	V	Q	Y	D	G	L	W	I	D	M	N	E	V	S	S	F	I	Q	G	S	T	K	G	C	N	V	N	K	L	N	Y	P	P	F	T	P	D	I	L	D	K	L	M	Y	S	K	T	I	C	M	D	A	V	Q	N	W	G	.	K	Q	Y	D	V	H	S
Template Known Secondary structure																	S			S						S	T	T	T			S	S	S	B		T	T					S	T	T	T	S		S	S			S		G	G	G		T	T	T	T	S	B		T	T				T	T		.						G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																										.
Template SS confidence
		449	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520		.	.	.	.	.	.	.
		428	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	I	G	G
Query Conservation
Alig confidence																																									.													.	.	.
Template Conservation																																									.													.	.	.
Template Sequence		L	Y	G	Y	S	M	A	I	A	T	E	Q	A	V	Q	K	V	F	P	N	K	R	S	F	I	L	T	R	S	T	F	A	G	S	G	R	H	A	A	.	H	W	L	G	D	N	T	A	S	W	E	Q	.	.	.	M	E	W	S	I	T	G	M	L	E	F	S	L	F	G	I	P	L	V	G	A	D	I	C	G
Template Known Secondary structure		G																	S	T	T	B							S				T	T	G	G	G	T			.					S		B	S	S				.	.	.														T	T			S						T
Template Predicted Secondary structure																																									.													.	.	.
Template SS confidence
		528	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.		.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.				.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.			.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																				.	.
Query SS confidence																																				.	.
Query Sequence		Y	T	T	L	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C	D	F	S	A	F	T	P	M	M	R	T	H	E	G	N	R	.	.	P	G	D	N	W	Q	F	D	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P
Query Conservation																																				.	.
Alig confidence					.	.	.	.																												.	.
Template Conservation					.	.	.	.
Template Sequence		F	V	A	.	.	.	.	E	T	T	E	E	L	C	R	R	W	M	Q	L	G	A	F	Y	P	F	S	R	N	H	N	S	D	G	Y	E	H	Q	D	P	A	F	F	G	Q	N	S	L	L	V	K	S	S	R	Q	Y	L	T	I	R	Y	T	L	L	P	F	L	Y	T	L	F	Y	K	A	H	V	F	G	E	T
Template Known Secondary structure		S	B	S	.	.	.	.															T	T	S	S	S							T	T	S				S	G	G	G	G		T	T																	T
Template Predicted Secondary structure					.	.	.	.
Template SS confidence
		604	.	.					.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		586	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.		.	.		.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.			.
Query SS confidence																																																															.			.
Query Sequence		V	M	R	P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D	I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	E	D	N	W	V	H	A	W	T	G	E	A	F	R	G	.	G	E	.	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F	Y	R
Query Conservation																																																															.			.
Alig confidence																																																															.			.
Template Conservation
Template Sequence		V	A	R	P	V	L	H	E	F	Y	E	D	T	N	S	W	I	E	D	T	E	F	L	W	G	P	A	L	L	I	T	P	V	L	K	Q	G	A	D	T	V	S	A	Y	I	P	D	A	I	W	Y	D	Y	E	S	G	A	K	R	P	W	R	K	Q	R	V	D	M	Y	L	P	A	D	K	I	G	L	H	L	R
Template Known Secondary structure		S				T					T	T	S	G	G	G	G	G			S	S				T	T	T								S	T	T		S								S	S					T	T	T			B		S			S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		664	.	.	.	.	.	670
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	D	S	E	W	A	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		G	G	Y	I	I	P	I
Template Known Secondary structure		T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		760	.	.	.	.	.	.