Job Description P32138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 7 Aligned Residues 521 % Identity 21% Template c3ffjA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycosyl hydrolase (family 31); PDBTitle: the crystal structure of the glycosyl hydrolase (family 31) from2 ruminococcus obeum atcc 29174 Resolution 1.94 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		113	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.			.	190
Predicted Secondary structure																																																																														.	.
Query SS confidence																																																																														.	.
Query Sequence		N	H	N	R	I	W	L	R	L	A	A	Q	P	E	D	H	I	Y	G	C	G	E	Q	F	S	Y	F	D	L	R	G	K	P	F	P	L	W	T	S	E	Q	G	V	G	R	N	K	Q	T	Y	V	T	W	Q	A	D	C	K	E	N	A	G	G	D	Y	Y	W	T	F	F	P	Q	P	T	F	V	.	.	S	T
Query Conservation																																																																														.	.
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	K	E	G	F	A	F	T	Y	I	X	D	E	D	D	I	V	Y	G	L	G	E	S	N	R	G	I	N	K	R	G	Y	C	Y	I	S	N	C	T	D	D	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	I	H	T	E	D	K	R	S	L	Y	G	A	H	N	F	I	I	V	S	G	K
Template Known Secondary structure			T	T	S									T	T							S	S		S	S		S	S		T	T												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S		G	G	G		S			S										S	S
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		34	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.
		191	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210			.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.																																																				.
Query SS confidence																						.	.																																																				.
Query Sequence		Q	K	Y	Y	C	H	V	D	N	S	C	Y	M	N	F	D	F	S	A	P	.	.	E	Y	H	E	L	A	L	W	E	D	K	A	T	L	R	F	E	C	A	D	T	Y	I	S	L	L	E	K	L	T	A	L	L	G	R	Q	P	E	L	P	D	W	I	Y	D	G	V	T	L	G	I	.	Q	G	G	T	E	V
Query Conservation																						.	.																																																				.
Alig confidence																						.	.																																																				.
Template Conservation
Template Sequence		T	T	F	G	L	F	F	D	Y	P	S	K	L	T	F	D	I	G	Y	T	R	X	D	T	L	K	V	S	C	E	N	A	D	L	D	I	Y	V	I	E	G	E	N	A	Y	D	I	V	K	Q	F	R	R	V	I	G	R	S	Y	I	P	P	K	F	A	F	G	F	G	Q	S	R	W	G	Y	T	T	K	E	D
Template Known Secondary structure		S									S	S							S	S	S	S	T	T							S	S											S	S																				G	G	G	G	S						T	T			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		97	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.
		268	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.			.	.
Predicted Secondary structure																							.																																																							.	.
Query SS confidence																							.																																																							.	.
Query Sequence		C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y	P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	Y	V	A	S	D	K	.	.	D	L
Query Conservation																							.																																																							.	.
Alig confidence																							.								.	.	.	.	.	.	.	.	.																																							.	.
Template Conservation																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	R	A	V	A	K	G	Y	R	E	N	H	I	P	I	D	X	I	Y	X	D	I	D	Y	X	Q	D	F	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	T	V	N	E	K	N	F	P	D	F	P	E	F	V	K	E	X	K	D	Q	E	L	R	L	I	P	I	I	D	A	G	V	K	V	E	K	G	Y	E	V
Template Known Secondary structure												T	T										G	G	G	S	S	T	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				T	T	T		T	T										T	T	T									S						T	T
Template Predicted Secondary structure																															.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		177	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.										.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.
		345	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																.
Template Sequence		Y	E	E	G	V	K	N	N	Y	F	C	K	R	E	D	G	S	D	F	V	A	A	V	W	P	G	D	T	H	F	P	D	X	L	N	P	E	A	R	K	W	F	G	D	K	Y	.	R	F	L	I	D	Q	G	I	E	G	F	W	N	D	X	N	E	P	A	I	F	Y	S	S	E	G	L	A	E	A	K	E	F
Template Known Secondary structure								T	T		B		B		T	T	S		B						T	T						B		T	T	S										T	T	.					T	T	T								S	T	T	T			S
Template Predicted Secondary structure																																																.
Template SS confidence
		248	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.		.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.
																																		410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	T	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	G	E	F	A	K	D	T	E	G	K	I	H	P	W	A	X	Q	A	K	X	K	D	I	V	N	S	P	E	D	Y	K	R	F	Y	H	N	V	N	G	K	K	I	R	H	D	K	V	H	N	L	F	G	Y	N	X	T	R	A	A	G	E	A	F	E	R	I	D	P	E	K	R	F	L	X	F	S	R	S	S
Template Known Secondary structure										S	S		S												T	T	T						T	S						T	T					G	G	G	G	G	G	G																		T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		327	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.
		458	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T	L	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C	D	F	S	A	F	T	P	M	M	R	T	H
Query Conservation
Alig confidence											.													.	.	.																													.	.	.	.
Template Conservation											.													.	.	.																													.	.	.	.
Template Sequence		Y	I	G	X	H	R	Y	G	G	.	I	W	X	G	D	N	K	S	W	W	S	H	.	.	.	I	L	L	N	L	K	X	L	P	S	L	N	X	C	G	F	X	Y	T	G	A	D	L	G	G	F	G	D	.	.	.	.	D	T	T	R	D	L	L	L	R	F	L	A	L	G	V	F	T	P	L	X	R	D	H
Template Known Secondary structure			T	T	G	G	G	T			.							T	T		T			.	.	.														T	T			S										T	.	.	.	.															T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure											.													.	.	.																													.	.	.	.
Template SS confidence
		407	.	.	410	.	.	.	.	.		.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.				.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.					.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.
		538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	D	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D	I	L	V	A	P
Query Conservation
Alig confidence															.	.
Template Conservation															.	.
Template Sequence		A	A	E	G	T	R	E	Q	E	C	Y	Q	F	.	.	E	N	I	E	D	F	R	S	V	I	N	A	R	Y	R	L	V	P	Y	L	Y	S	E	Y	X	K	A	A	L	N	D	D	X	Y	F	K	P	L	G	F	V	Y	P	D	D	K	X	A	I	R	V	E	D	Q	L	X	L	G	N	E	I	X	I	A	P
Template Known Secondary structure			S				S			S	T	T	S	S	.	.	S																													T	T			S									T	T		T	T	G	G	G			S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure															.	.
Template SS confidence
		479	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.			.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.
		618	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.						640	.	.	.	.	.	.	.	.		.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.										.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.										.
Query Sequence		V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	E	D	N	W	V	H	A	W	.	.	.	.	.	T	G	E	A	F	R	G	G	E	.	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F	Y	R	A	D	S	E	W	A	A
Query Conservation																								.	.	.	.	.										.
Alig confidence																								.	.	.	.	.										.
Template Conservation
Template Sequence		V	Y	E	Q	N	A	R	G	R	Y	V	Y	L	P	E	E	X	K	F	I	K	F	X	P	D	G	S	I	S	E	E	V	L	E	K	G	V	H	Y	V	D	V	A	L	N	E	V	P	L	F	I	R	S	G	K	C	I	P	V
Template Known Secondary structure				S	T	T		S							S	S									T	T	S									S									T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		557	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.