Job Description P32138 Confidence 99.97% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 11 Aligned Residues 554 % Identity 12% Template c2yfnA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-galactosidase-sucrose kinase agask; PDBTitle: galactosidase domain of alpha-galactosidase-sucrose kinase,2 agask Resolution 1.45 Å

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		16	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	N	D	S	F	T	L	H	F	Q	Q	R	L	I	L	T	H	S	K	D	N	P	C	L	W	I	G	S	G	I	A	D	I	D	M	F	R	G	N	F	S	I	K	D	K	L	Q	E	K	I	A	L	T	D	A	I	V	S	Q	S	P	D	G	W	L	I	H	F	S	R	G	S	D	I	S	A	T	L	N	I
Query Conservation
Alig confidence																									.
Template Conservation																									.
Template Sequence		R	N	I	A	L	N	I	K	N	E	K	G	V	E	S	A	D	L	L	F	K	S	Y	.	E	I	R	N	G	K	Y	R	L	Q	G	L	P	A	V	W	A	D	E	K	E	A	Q	T	L	E	I	V	L	A	D	E	N	A	Q	V	E	V	H	L	L	Y	G	V	L	E	E	N	D	V	I	T	R	S	V	R
Template Known Secondary structure		S			S						T	T	S		B										.					S				B	T	T	B							T	T	T											T	T	T	T											T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																									.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.		.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
		96	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.		.	120	.	.	.	.	.	.					.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170
Predicted Secondary structure																									.									.	.	.	.
Query SS confidence																									.									.	.	.	.
Query Sequence		S	A	D	D	Q	G	R	L	L	L	E	L	Q	N	D	N	L	N	H	N	R	I	W	.	L	R	L	A	A	Q	P	E	.	.	.	.	D	H	I	Y	G	C	G	E	Q	F	S	Y	F	D	L	R	G	K	P	F	P	L	W	T	S	E	Q	G	V	G	R	N	K	Q	T	Y	V	T	W	Q	A	D	C	K
Query Conservation																									.									.	.	.	.
Alig confidence											.	.	.	.	.	.	.	.							.									.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation											.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	K	N	T	G	T	G	Q	I	.	.	.	.	.	.	.	.	T	I	E	K	A	A	A	A	C	L	D	F	V	Q	G	E	F	D	V	L	R	F	Y	G	K	H	A	M	E	R	N	L	E	R	T	P	L	G	H	G	T	I	A	F	G	S	R	R	G	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						S	S	S			.	.	.	.	.	.	.	.													S	S												T	T												B									S	S	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure											.	.	.	.	.	.	.	.																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		165	.	.	.	.	170	.	.	.									.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
		171	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.										.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.																			.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		E	N	A	G	G	D	Y	Y	W	T	F	F	P	Q	P	T	F	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	T	Q	K	Y	Y	C	H	V	D	N	S	C	Y	M	N	F	D	F	S	A	P	E	Y	H	E	L	A	L	W	E	D	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	T
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	S	S	H	Q	Y	N	P	A	V	I	L	A	E	K	G	T	T	E	T	A	G	S	C	Y	G	M	L	F	V	Y	S	G	N	F	S	C	E	A	E	K	D	Q	F	N	Q	T	R	L	L	L	G	L	N	E	E	L	F	S	Y	P	L	A	S	G	E	T	F	T	V	P	E	V
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	S		S	S	B		S							T	T			S	S	S	B										S	S										T	T	S										S	T	T							T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
										224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.								.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.	.	.	.	.	.									.
Query SS confidence																																.	.	.	.	.	.	.									.
Query Sequence		L	R	F	E	C	A	D	T	Y	I	S	L	L	E	K	L	T	A	L	L	G	R	Q	P	E	L	P	D	W	I	.	.	.	.	.	.	.	Y	D	G	V	T	L	G	I	.	Q	G	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	D	W	S	G	I	R	M
Query Conservation																																.	.	.	.	.	.	.									.
Alig confidence																																.	.	.	.	.	.	.									.																			.	.
Template Conservation																																																																		.	.
Template Sequence		I	L	S	Y	S	A	E	G	L	S	A	L	S	Q	Q	Y	H	N	C	I	R	N	H	V	C	R	S	K	Y	V	H	M	Q	R	P	V	L	I	N	S	W	E	A	A	Y	F	D	F	T	G	D	T	I	V	D	L	A	K	E	A	A	S	L	G	.	.	I	D	M	V	V	M	D	D	G	W	F	G	K	R
Template Known Secondary structure							S	B																	T				G	G	G	G	S													T	T																T	T	T	.	.								S	S	S	B	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																		.	.
Template SS confidence
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.			360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
		296	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.		.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.																						.
Query SS confidence																						.																						.
Query Sequence		T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y	P	Q	.	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	.	Y	V	A	S	D	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G
Query Conservation																						.																						.
Alig confidence				.																		.																						.																										.	.	.	.	.	.
Template Conservation				.																																																																		.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	D	.	D	N	S	S	L	G	D	W	Q	V	N	E	T	K	L	G	G	S	L	A	E	L	I	T	R	V	H	E	Q	G	M	K	F	G	I	W	I	E	P	E	M	I	N	E	D	S	D	L	Y	R	A	H	P	D	W	A	I	R	I	Q	G	K	K	P	V	.	.	.	.	.	.	R	S	R	N	Q	L
Template Known Secondary structure		S	S	.	T	T	S		T	T			S	B						T	S												T	T									T	T				S	S	S							G	G	G	B				T	T	S				.	.	.	.	.	.		B	T	T	B
Template Predicted Secondary structure				.																																																																		.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		374	.		.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440							.	.	.	.	.	.
		374	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	Y	L	P	T	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F
Query Conservation
Alig confidence																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Sequence		L	L	D	F	S	R	K	E	V	R	D	C	V	F	D	Q	I	C	V	V	L	D	Q	G	K	I	D	Y	V	K	W	D	M	N	R	S	M	A	D	V	Y	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	N	L	S	Y	D	Y	V	L	G	V	Y	D	F	M	E	R	L	C	.	S	R	Y	P	D	L	L
Template Known Secondary structure			B		T	T																	T	T	S											S				S			S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T																		.				T	T
Template Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template SS confidence
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.												.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.		.	.	510	.	.	.	.
		454	.	.	.	.	.	460	.	.	.								.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence												.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	.	.	.	.	.	.	.	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T	L	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C	D
Query Conservation												.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence												.	.	.	.	.	.	.															.	.	.	.	.																			.							.
Template Conservation																																	.	.	.	.	.																			.							.
Template Sequence		L	E	G	C	S	G	G	G	G	R	F	D	A	G	M	L	Y	Y	S	P	Q	I	W	C	S	D	N	T	D	A	I	.	.	.	.	.	N	R	T	R	I	Q	Y	G	T	S	F	F	Y	P	V	S	A	M	.	G	A	H	V	S	A	.	V	P	N	H	Q	T	G	R	V	T	S	F	H	T	R	G	V	T
Template Known Secondary structure						B	T	B	B	T	T		S					T	T		S					B	S						.	.	.	.	.										T	T	T	S		G	G	G		.							.	S	S		T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.	.																			.							.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.						.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.		.	.	.	.	.	.		570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.
		527	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																															.	.	.
Query SS confidence																																																																															.	.	.
Query Sequence		F	S	A	F	T	P	M	M	R	T	H	E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	D	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	.	.	.
Query Conservation																																																																															.	.	.
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	M	A	G	T	F	G	Y	E	L	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	A	L	L	S	D	E	E	K	Q	Q	I	R	E	Q	I	K	T	Y	K	K	Y	E	T	L	I	N	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	T	Y	W	R	L	S	D	P	F	T	D	E	I	A	A	W	M	S	V	S	E
Template Known Secondary structure			T	T	T	T					S		.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	G	S																									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S						S		T	T	T	S	S									T
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		588	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.										.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.											.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
			604	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630		.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.																												.
Query SS confidence		.																												.
Query Sequence		.	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D	I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	.	P	E	D	N	W	V	H	A	W	T	G	E	A	F	R	G
Query Conservation		.																												.
Alig confidence		.																												.
Template Conservation
Template Sequence		E	Q	D	H	A	L	V	S	V	V	R	L	M	A	E	A	N	Q	A	T	V	Y	V	R	L	R	G	L	K	P	D	A	V	Y	L	E	E	Q	S	G	R	Q	Y	S	G
Template Known Secondary structure		T	S	S													S	S										S	S		T	T						T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		649	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.