Job Description P32138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 5 Aligned Residues 617 % Identity 23% Template c2xvgA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha xylosidase; PDBTitle: crystal structure of alpha-xylosidase (gh31) from2 cellvibrio japonicus Resolution 2.60 Å

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		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.					.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.
Query Sequence		Q	F	H	Q	N	N	D	S	F	T	L	H	F	Q	Q	R	.	.	.	.	L	I	L	T	H	S	K	D	N	P	C	L	W	I	G	S	G	I	A	D	I	D	M	F	R	G	N	F	S	I	K	D	K	L	Q	E	K	I	A	L	T	D	A	I	V	S	Q	S	P	D	G	W	L	I	H	F	S	R	G	S
Query Conservation																		.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.																																										.	.	.	.	.
Template Conservation																																																															.	.	.	.	.
Template Sequence		Q	V	E	R	T	A	E	G	V	V	L	T	L	P	E	G	T	V	K	K	L	R	L	Q	V	M	G	E	R	I	I	R	V	T	A	L	P	G	T	D	F	G	I	V	P	E	S	I	Q	V	V	A	K	P	A	T	N	V	P	F	S	.	.	.	.	.	V	D	Q	A	G	E	K	L	V	L	K	T	S	Q
Template Known Secondary structure							S	S							S	S	S	S											T	T								S	S	S		G	G	G	S				S	S							S	S					.	.	.	.	.					T	T							S	S
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.
Template SS confidence
		48	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.						.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.
								88	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.													.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.		.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	D	I	S	A	T	L	N	I	S	A	D	D	Q	G	R	L	L	L	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	Q	N	D	N	L	N	H	N	R	I	W	L	R	L	A	A	Q	P	E	D	H	I	Y	G	C	G	E	.	Q	F	S	Y	F	D	L	R	G	K	P	F	P	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													.
Template Conservation
Template Sequence		V	S	A	E	V	S	L	L	D	G	T	V	S	F	R	D	A	K	G	N	V	L	L	Q	E	E	N	R	G	T	F	S	P	V	I	H	D	P	D	P	V	D	A	D	S	Y	A	L	R	Q	E	F	N	R	G	S	D	E	G	F	F	G	L	G	Q	H	Q	N	G	Q	V	N	Y	A	G	E	N	V	E	L
Template Known Secondary structure								T	T	T								T	T	S						B		S	S				B				S		S	S				T	T		B	B							T	T												S	S			S	S		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		123	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		W	T	S	E	Q	G	V	G	R	N	K	Q	T	Y	V	T	W	Q	A	D	C	K	E	N	A	G	G	D	Y	Y	W	T	F	F	P	Q	P	T	F	V	S	T	Q	K	Y	Y	C	H	V	D	N	S	C	Y	M	N	F	D	F	S	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	T	Y	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	V	I	S	I	P	F	L	V	S	S	R	N	Y	G	L	L	W	D	N	N	S	I	T	R	F	G	D	P	R	E	A	Q	P	L	N	Q	S	L	K	L	Y	D	A	E	G	K	E	G
Template Known Secondary structure					S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S										S	S	S									S					S	S	S	S					G	G	G	S						S	S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		203	.	.	.																												.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	T	V	R	Y	F	V	G	D	E	L	K	L	T	R	V	E	A	D	F	N	H	Q	F	Y	K	Q	G	N	E	L	E	N	P	F	P	E	E	V	A	G	A	Y	K	N	N	T	L	R	I	E	L	E	G	S	I	E	A	Q	A	T	G	K	H	Q	F	K	M	Y	N	S	G	Y	A	Q	L	S	L	D	G
Template Known Secondary structure									T	T									S	S						B	S	S	S	S		B	S	S				G	G	G							T													S	S											S								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		257	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.
																																																								210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	E	Y	H	E	L	A	L	W	E	D	K	A	T	L	R	F	E	C	A	D	T	Y	I	S	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	V	V	L	D	R	W	R	M	N	W	N	P	W	Y	H	N	F	Y	R	E	L	N	A	G	D	K	H	K	L	K	V	S	W	K	P	D	G	G	F	F	H	L	R	H	L	D	P	L	P	A	N	E	Q	H	E	L	S	L	A	S	E	T	G	K	A	I	D	Y	Y	F	V	A	G	D	T	K	D	D	I
Template Known Secondary structure		S									T	T	S												T	T												T	T													T	T	T	T	T	S						S	S	B	S	S									S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		337	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.
		236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.																												.
Query SS confidence																												.																												.
Query Sequence		L	E	K	L	T	A	L	L	G	R	Q	P	E	L	P	D	W	I	Y	D	G	V	T	L	G	I	.	Q	G	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y
Query Conservation																												.																												.
Alig confidence																												.																												.								.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	S	G	Y	R	Q	L	T	G	K	S	V	M	L	P	K	W	A	Y	G	F	W	Q	S	R	E	R	Y	K	S	S	D	E	I	I	Q	N	L	K	E	Y	R	D	R	K	I	P	I	D	N	I	V	L	D	W	S	Y	W	P	E	D	A	.	.	.	.	.	.	.	W	G	S	H	D	F	D	K	Q	F	F
Template Known Secondary structure																	G	G	G	G	S						T	T			S														T	T										S			S		T	T		.	.	.	.	.	.	.	T	T	S					T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		417	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.								.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370		.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.
Query SS confidence																																																											.
Query Sequence		P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	Y	V	A	S	D	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	.	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K
Query Conservation																																																											.
Alig confidence																																																											.
Template Conservation
Template Sequence		P	D	P	K	A	L	V	D	K	V	H	A	M	N	A	Q	I	M	I	S	V	W	P	K	F	Y	P	T	T	D	N	Y	K	E	L	N	A	K	G	F	M	F	N	R	N	L	D	E	K	N	L	D	W	I	G	K	G	Y	L	N	A	F	Y	D	P	F	S	P	E	A	T	A	I	F	W	K	Q	I	R	D
Template Known Secondary structure		S												T	T									S				T	T	S									T	T				T					T	T		B		S	S	T	T			B							S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		393	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.											.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	Y	L	P	T	D	T	Y	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	I	N	V	H	G	F	D	A	W	W	L	D	A	V	E	P	D	I	H	S	N	L	T	F	E	K	R	K	W	L	M	T	P	N	A	R	G	N	G	A	E	I	F	N	A	Y	A	V	P	H	A	E	G	V	Y	Q	G	E	L	A	T	D	G	D	K	R	S	F	I	L	T	R	S	G	F	G	G	I	Q
Template Known Secondary structure			T	G	G	G	T									T	T	T		S	S	T	T										T		S	B	T	T	B		S	G	G	G	T	T	T	T																	T	T	B							S				T	T	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		463	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	R
Query Conservation																																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.	.	.
Template Sequence		R	T	G	S	A	I	W	S	G	D	I	V	S	R	W	S	D	.	.	.	M	K	D	Q	I	A	A	G	I	G	T	N	L	A	G	V	T	N	W	T	F	D	I	G	G	F	T	P	E	D	R	F	R	H	G	K	K	G	F	V	G	S	W	T	A	L	D	A	E	Q	V	D	E	W	Q	E	L	N	T	R
Template Known Secondary structure		G	G	S							S		B	S					.	.	.													T	T	T								B	T		S	B									T	T					S	G	G	G	S
Template Predicted Secondary structure																			.	.	.
Template SS confidence
		650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.				.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550		.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.
Predicted Secondary structure																													.
Query SS confidence																													.
Query Sequence		W	C	D	F	S	A	F	T	P	M	M	R	T	H	E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	D	G	.	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T
Query Conservation																													.
Alig confidence																													.
Template Conservation
Template Sequence		W	Y	Q	F	G	A	F	V	P	L	Y	R	S	H	G	Q	N	P	Y	R	E	I	F	N	I	A	D	E	G	T	E	V	Y	N	A	M	V	W	Y	T	K	L	R	Y	Y	L	M	P	Y	I	Y	T	L	G	G	D	T	Y	H	K	D	G	T	I	M	R	G	L	V	M	D	F	P	N	D	R	K	A	W	D
Template Known Secondary structure							T	T	S	S	S						S	S	S			S					S		T	T	S																T														T				S									T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		727	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.
		603	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.		.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.		.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
Predicted Secondary structure																																	.																.
Query SS confidence																																	.																.
Query Sequence		L	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D	I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	E	D	.	N	W	V	H	A	W	T	G	E	A	F	R	G	G	E	.	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F	Y	R	A	D	S	E	W	A	A
Query Conservation																																	.																.
Alig confidence																																	.																.
Template Conservation
Template Sequence		I	N	T	Q	Y	M	F	G	P	A	F	L	V	N	P	V	Y	E	Y	K	A	R	S	R	D	V	Y	L	P	A	G	S	D	W	Y	N	F	Y	T	G	E	K	L	A	G	G	Q	T	I	T	A	D	A	P	L	A	R	V	P	L	F	V	K	A	G	A	I	V	P	T
Template Known Secondary structure				S					T	T	T								S	T	T										T	T	S					T	T	T						S	S									T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		807	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.