Job Description P32138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 8 Aligned Residues 586 % Identity 18% Template c2x2iB_ PDB info PDB header:lyase Chain: B: PDB Molecule:alpha-1,4-glucan lyase isozyme 1; PDBTitle: crystal structure of the gracilariopsis lemaneiformis alpha-2 1,4-glucan lyase with acarbose Resolution 2.60 Å

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		65	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		I	A	L	T	D	A	I	V	S	Q	S	P	D	G	W	L	I	H	F	S	R	G	S	D	I	S	A	T	L	N	I	S	A	D	D	Q	G	R	L	L	L	E	L	Q	N	D	N	L	N	H	N	R	I	W	L	R	L	A	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.																																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																							.	.	.	.
Template Sequence		T	F	T	S	E	G	F	L	T	F	E	T	K	D	L	S	V	I	I	Y	G	.	.	.	.	N	F	K	T	R	V	T	R	K	S	D	G	K	V	I	M	E	N	D	E	V	G	T	A	S	S	G	N	K	C	R	G	L	M	F	V	D	R	L	Y	G	N	A	I	A	S	V	N	K	N	F	R	N	D	A
Template Known Secondary structure					T	T								T	T							T	.	.	.	.	T								T	T	T	T						B						S	S	S												T	T	T												T	T	S	T
Template Predicted Secondary structure																							.	.	.	.
Template SS confidence
		129	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.					150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.
		124	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.							.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	P	E	D	H	I	Y	G	C	G	E	Q	F	S	Y	.	.	.	.	.	.	F	D	L	R	G	K	P	F	P	L	W	T	S	E	Q	G	V	G	R	N	K	Q	T	Y	V	T	W	Q	A	D	C	K	E	N	A	G	G	D	Y	Y	W	T	F	F	P	Q	P	T	F	V	S	T	Q	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.																																																						.	.	.	.	.	.
Alig confidence																	.	.	.	.	.	.																			.	.																																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																									.	.
Template Sequence		V	K	Q	E	G	F	Y	G	A	G	E	V	N	C	K	Y	Q	D	T	Y	I	L	E	R	T	G	I	A	M	T	N	Y	N	Y	D	N	L	N	Y	.	.	N	Q	W	D	L	R	P	P	H	H	D	G	A	L	N	P	D	Y	Y	I	P	M	Y	Y	A	A	P	W	L	I	V	N	G	C	A	G	T	S	E
Template Known Secondary structure		T	T								T	T						T	T				S				S											G	G	G	.	.			G	G	G	S		T	T			S						T	T	S			S											S	T	T	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.	.
Template SS confidence
		205	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.			.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
				192	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.								.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230		.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.											.	.	.	.	.	250	.
Predicted Secondary structure		.	.																		.	.	.	.	.	.	.																							.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.																		.	.	.	.	.	.	.																							.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	K	Y	Y	C	H	V	D	N	S	C	Y	M	N	F	D	F	S	.	.	.	.	.	.	.	A	P	E	Y	H	E	L	A	L	W	E	D	K	A	T	L	R	F	E	C	A	D	.	T	Y	I	S	L	L	E	K	L	T	A	L	L	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	Q	P	E	L	P	D
Query Conservation		.	.																		.	.	.	.	.	.	.																							.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.																		.	.	.	.	.	.	.																							.															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	Y	S	Y	G	W	F	M	D	N	V	S	Q	S	Y	M	N	T	G	D	T	T	W	N	S	G	Q	E	D	L	A	Y	M	G	A	Q	Y	G	P	F	D	Q	H	F	V	Y	G	A	G	G	G	M	E	V	V	T	A	F	S	L	L	Q	G	K	E	F	E	N	Q	V	L	N	K	R	S	V	M	P	P	K
Template Known Secondary structure													S						S	S			G	G	G				T	T							S	S											S	S	S	S											T			G	G	G	T		S	S		S	S	S					G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.												.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.
Predicted Secondary structure												.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																										.	.	.	.	.
Query SS confidence												.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																										.	.	.	.	.
Query Sequence		W	I	Y	D	G	V	T	L	G	I	.	Q	G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y	.	.	.	.	.
Query Conservation												.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.																										.	.	.	.	.
Alig confidence												.				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																									.								.	.	.	.	.	.	.	.	.										.	.	.	.	.
Template Conservation																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	V	F	G	F	F	Q	G	V	F	G	T	S	S	L	L	R	A	H	M	P	A	G	E	N	N	I	S	V	E	E	I	V	E	G	Y	Q	N	N	N	F	P	F	E	G	L	A	V	D	V	D	M	Q	D	N	L	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	F	T	T	K	G	E	F	W	T	A	N	R	V
Template Known Secondary structure		G	G	G	S											S	S	G	G	G					T	T													T	T	T										G	G	G	S	B	T	T	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				G	G	G	B	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420										.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
							314	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.						.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.														360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	Y	V	A	S	D	.	.	.	.	.	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F
Query Conservation		.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																													.	.	.	.	.																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	T	G	G	D	P	N	N	R	S	V	F	E	W	A	H	D	K	G	L	V	C	Q	T	N	I	T	C	F	L	R	N	D	N	E	G	Q	D	Y	E	V	N	Q	T	L	R	E	R	Q	L	Y	T	K	N	D	S	L	T	G	T	D	F	G	M	T	D	D	G	P	S	D	A	Y	I	G	H	L	D	Y	G
Template Known Secondary structure				S			T	T	S		B							T	T	T									S							T	T												T	T		B					B	T	T								S	S	S		T	T	S								S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
							371	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	Y	L	P	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.																																											.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.																					.																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																											.
Template Sequence		G	G	V	E	C	D	A	L	F	P	D	W	G	R	P	D	V	A	E	W	W	G	N	N	Y	.	K	K	L	F	S	I	G	L	D	F	V	W	Q	D	M	T	V	P	A	M	M	P	H	K	I	G	D	D	I	N	V	K	P	D	G	N	W	P	N	A	D	D	P	S	N	G	Q	Y	N	W	K	T	Y	H
Template Known Secondary structure		T	T								B		T	T	S	T	T									T	.					T	T	T								S	T	T	T						B	T	T	S		T	T					T	T		S		S	S	S			T	T		B		S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																											.
Template SS confidence
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.		540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.
										413	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.						.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	.	.	.	.	.	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.																														.	.	.	.	.																										.
Template Conservation																																																																					.
Template Sequence		P	Q	V	L	V	T	D	M	R	Y	E	N	H	G	R	E	P	M	V	T	Q	R	N	I	H	A	Y	T	L	C	E	S	T	R	K	E	G	I	V	E	N	A	D	T	L	T	K	F	R	R	S	Y	I	I	S	R	G	G	Y	I	G	N	Q	H	F	G	G	.	M	W	V	G	D	N	S	T	T	S	N	Y
Template Known Secondary structure		T	T	B					S	S	S	T	T	S					G	G	G	S	G	G	G												T	T	T	T	T	T	G	G	G			S		S							S				T	T	G	G	G	S			.					S		B	S	S
Template Predicted Secondary structure																																																																					.
Template SS confidence
		594	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.
		480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.					.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.							.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																					.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T	L	F	E	M	.	.	.	.	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C	D	F	S	A	F	T	P	M	M	R	T	H	.	.	.	.	.	.	E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	D
Query Conservation																																					.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.																																	.	.	.	.																								.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	I	Q	M	M	I	A	N	N	I	N	M	N	M	S	C	L	P	L	V	G	S	D	I	G	G	F	T	S	Y	D	N	E	N	Q	R	T	P	C	T	G	D	L	M	V	R	Y	V	Q	A	G	C	L	L	P	W	F	R	N	H	Y	D	R	W	I	E	S	K	D	H	G	K	D	Y	Q	E	L	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.														T	T			S				B	T	T		S	B				S	S		T	T																T	T	S	S								B		B	T	T	B			S	B	S				G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					673	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.					.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.
Query Sequence		G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D	.	.	.	.	I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D
Query Conservation																																																																	.	.	.	.
Alig confidence																																																																	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		M	Y	P	N	E	M	D	T	L	R	K	F	V	E	F	R	Y	R	W	Q	E	V	L	Y	T	A	M	Y	Q	N	A	A	F	G	K	P	I	I	K	A	A	S	M	Y	N	N	D	S	N	V	R	R	A	Q	N	D	H	F	L	L	G	G	H	D	G	Y	R	I	L	C	A	P	V	V	W	E	N	S	T	E
Template Known Secondary structure		G		S	T	T														T																		S	S			G	G	G	S	T	T		S	S					T	T	T						T	T	T	S		S								S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		626	.	.	.	630	.		.	.	.	.	.	.	.	.	640									.	.	.	.	.	.	.	.		.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
Predicted Secondary structure								.										.	.	.	.	.	.	.	.									.
Query SS confidence								.										.	.	.	.	.	.	.	.									.
Query Sequence		W	T	L	Y	L	P	.	E	D	N	W	V	H	A	W	T	.	.	.	.	.	.	.	.	G	E	A	F	R	G	G	E	.	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F	Y	R	A	D	S	E	W	A	A
Query Conservation								.										.	.	.	.	.	.	.	.									.
Alig confidence								.										.	.	.	.	.	.	.	.									.
Template Conservation
Template Sequence		R	E	L	Y	L	P	V	L	T	Q	W	Y	K	F	G	P	D	F	D	T	K	P	L	E	G	A	M	N	G	G	D	R	I	Y	N	Y	P	V	P	Q	S	E	S	P	I	F	V	R	E	G	A	I	L	P	T
Template Known Secondary structure								S	S	S						S	G	G	G	G	S	S								T	T										T	T								S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.