Job Description P32138 Confidence 99.24% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 21 Aligned Residues 375 % Identity 13% Template c2wskA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:glycogen debranching enzyme; PDBTitle: crystal structure of glycogen debranching enzyme glgx from2 escherichia coli k-12 Resolution 2.25 Å

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		263	.	.	.	.	.			.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.											.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.								.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure								.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence								.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	G	T	E	V	C	.	.	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y	.	.	.	.	.	.	.	P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W
Query Conservation								.	.																															.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence								.	.												.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																					.	.
Template Sequence		G	T	Y	K	A	L	G	H	P	V	M	I	N	Y	L	K	Q	L	G	.	.	I	T	A	L	E	L	L	P	V	A	Q	F	A	S	E	P	R	L	Q	R	M	G	L	S	N	Y	W	G	Y	N	P	V	A	M	F	A	L	H	P	A	Y	A	C	S	P	E	T	A	L	D	E	F	R	D	A	I	K	A	L
Template Known Secondary structure		T	S					T	S											T	.	.							S													T	T	T				S	S												G	G	G		S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure																					.	.
Template SS confidence
		174	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.			.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.		.	.	.	340	.	.	.	.						.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure															.									.	.	.	.	.
Query SS confidence															.									.	.	.	.	.
Query Sequence		N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	.	Y	V	A	S	D	K	D	L	.	.	.	.	.	C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	E	L
Query Conservation															.									.	.	.	.	.
Alig confidence															.									.	.	.	.	.																					.	.	.
Template Conservation																																																	.	.	.
Template Sequence		H	K	A	G	I	E	V	I	L	D	I	V	L	N	H	S	A	E	L	D	L	D	G	P	L	F	S	L	R	G	I	D	N	R	S	Y	Y	W	I	R	E	D	G	D	Y	H	N	.	.	.	W	T	G	C	G	N	T	L	N	L	S	H	P	A	V	V	D	Y	A	S	A	C	L	R	Y	W	V	E	T	C
Template Known Secondary structure				T	T										S			T	T		S	T	T	S	B			S										B		B		T	T	S	S	B			.	.	.	S	S	S	S	S			B		T	T	S																	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.
Template SS confidence
		252	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.				.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.
		398	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	Y	L	P	T	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W
Query Conservation
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template Sequence		H	V	D	G	F	R	F	D	L	A	A	V	M	G	R	T	P	E	F	R	Q	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	P	L	F	T	A	I	Q	N	C	P	V	L	S	Q	V	K	L	I	A	E	P	W	D	I	A	P	G	G	Y	Q	V	G	.	N	F	P	P	L	F	A	E	W
Template Known Secondary structure									T	T	T					B	S	S	S	B		T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											T	T	G	G	G	S							B		S	S	T	T		B		T	T	.		S		T	T
Template Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																		.
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350																.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.		.	.	.	.	.	.	390	.	.
		478	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.																																																											.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	A	M	T	G	H	G
Query Conservation																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence			.	.													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.
Template Sequence		N	.	.	D	H	F	R	D	A	A	R	R	F	W	L	H	Y	D	L	P	L	G	A	F	A	G	R	F	A	A	S	S	D	V	F	K	R	N	G	R	L	P	S	A	A	I	N	L	V	T	A	H	D	G	F	T	L	R	D	C	V	C	F	N	H	K	H	N	E	A	N	G	E	E	N	R	D	G	T	N
Template Known Secondary structure			.	.													T	S		S										B	T	T					S	S	T	T			G	G	G					S			S	S	S							T	T		S	S				G	G	G	S	S	T	T		S	S		S
Template Predicted Secondary structure			.	.
Template SS confidence
		393			.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470
		500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.																						.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.		.	550	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Query SS confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Query Sequence		L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T	L	F	E	M	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C	D	F	S	A	F	T	P	M	M	R	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	.	D	G	D	A	E	T	I	A	H
Query Conservation																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Alig confidence																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.													.
Template Conservation
Template Sequence		N	N	Y	S	N	N	H	G	K	E	G	L	G	G	S	L	D	L	V	E	R	R	R	D	S	I	H	A	L	L	T	T	L	L	L	S	Q	G	T	P	M	L	L	A	G	D	E	H	G	H	S	Q	H	G	N	N	N	A	Y	C	Q	D	N	Q	L	T	W	L	D	W	S	Q	A	S	S	G	L	T	A	F
Template Known Secondary structure								T	T	S	S	S	S																								S	B	S						T	T	T	T	T	T				T	T		S			T	T			S	T	T	T	S			G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		471	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550
		558	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.			610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																						.	.
Query SS confidence																																																						.	.
Query Sequence		F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y	Q	Y	L	L	.	.	G	R	D	I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	E	D	N	W
Query Conservation																																																						.	.
Alig confidence													.																																									.	.							.	.
Template Conservation													.																																																	.	.
Template Sequence		T	A	A	L	I	H	L	R	K	R	I	.	P	A	L	V	E	N	R	W	W	E	E	G	D	G	N	V	R	W	L	N	R	Y	A	Q	P	L	S	T	D	E	W	Q	N	G	P	K	Q	L	Q	I	L	L	S	D	R	F	L	I	.	.	A	I	N	A	T	L	E	V	T	E	I	V	L	P	A	G	E	W
Template Known Secondary structure										T	T		.					S						T	T	S	S	S						T	T	S	S	B									S		S							T	T	T				.	.					S	S	S								S	S
Template Predicted Secondary structure													.																																																	.	.
Template SS confidence
		551	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.		.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.			610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.
		636	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.			.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.
Predicted Secondary structure														.	.
Query SS confidence														.	.
Query Sequence		V	H	A	W	T	G	E	A	F	R	G	G	.	.	E	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F	Y	R
Query Conservation														.	.
Alig confidence														.	.
Template Conservation
Template Sequence		H	A	I	P	P	F	A	G	E	D	N	P	V	I	T	A	V	W	Q	G	P	A	H	G	L	C	V	F	Q	R
Template Known Secondary structure					T	T	S	S		T	T						S						T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		628	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.