Job Description P32138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 2 Aligned Residues 622 % Identity 20% Template c2qmjA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:maltase-glucoamylase, intestinal; PDBTitle: crystral structure of the n-terminal subunit of human maltase-2 glucoamylase in complex with acarbose Resolution 1.90 Å

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		12	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70				.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.	.	.
Query SS confidence																																																													.	.	.
Query Sequence		Q	F	H	Q	N	N	D	S	F	T	L	H	F	Q	Q	R	L	I	L	T	H	S	K	D	N	P	C	L	W	I	G	S	G	I	A	D	I	D	M	F	R	G	N	F	S	I	K	D	K	L	Q	E	K	I	A	L	T	D	A	.	.	.	I	V	S	Q	S	P	D	G	W	L	I	H	F	S	R	G	S	D
Query Conservation																																																													.	.	.
Alig confidence																			.																																										.	.	.
Template Conservation																			.
Template Sequence		N	L	V	N	T	N	A	G	F	T	A	R	L	K	N	L	P	.	S	S	P	V	F	G	S	N	V	D	N	V	L	L	T	A	E	Y	Q	T	S	N	R	F	H	F	K	L	T	D	Q	T	N	N	R	F	E	V	P	H	E	H	V	Q	S	F	S	G	N	A	A	A	S	L	T	Y	Q	V	E	I	S	R
Template Known Secondary structure							S	S										S	.				T	T	S		B		S											T	T									T	T	S								S	S						S				S	S		S
Template Predicted Secondary structure																			.
Template SS confidence
		57	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.		.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.
		89	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.		.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.				.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																						.													.	.	.
Query SS confidence																																						.													.	.	.
Query Sequence		I	S	A	T	L	N	I	S	A	D	D	Q	G	R	L	L	L	E	L	Q	N	D	N	L	N	H	N	R	I	W	L	R	L	A	A	Q	.	P	E	D	H	I	Y	G	C	G	E	Q	F	.	.	.	S	Y	F	D	L	R	G	K	P	F	P	L	W	T	S	E	Q	G	V	G	R	N	K	Q	T	Y	V	T
Query Conservation																																						.													.	.	.
Alig confidence																																						.													.	.	.																									.	.	.	.
Template Conservation																																																																														.	.	.	.
Template Sequence		Q	P	F	S	I	K	V	T	R	R	S	N	N	R	V	L	F	D	S	S	I	G	P	L	L	F	A	D	Q	F	L	Q	L	S	T	R	L	P	S	T	N	V	Y	G	L	G	E	H	V	H	Q	Q	Y	R	H	D	M	N	W	K	T	W	P	I	F	N	R	D	T	T	P	N	G	N	G	T	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		T	T								T	T	T							G	G	G	S						T	T									S		S							S	S			S	S	S	S				S	S													S	T	T			.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		136	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.						.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.
Query Sequence		W	Q	A	D	C	K	E	N	A	G	G	D	Y	Y	W	T	F	F	P	Q	P	T	F	V	.	.	.	.	.	S	T	Q	K	Y	Y	C	H	V	D	N	S	C	Y	M	N	F	D	F	S	A	P	E	Y	H	E	L	A	L	W	E	D	K	A	T	L	R	F	E	C	A	D	T	Y	I	S	L	L	E	K	L
Query Conservation																										.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	N	L	Y	G	A	Q	T	F	F	L	C	L	E	D	A	S	G	L	S	F	G	V	F	L	M	N	S	N	A	M	E	V	V	L	Q	P	A	P	A	I	T	Y	R	T	I	G	G	I	L	D	F	Y	V	F	L	G	N	T	P	E	Q	V	V	Q	E	Y
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.			S											S	T	T												S								T	T	T							S	S	S										S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																212	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.
		240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.																												.
Query SS confidence																								.																												.
Query Sequence		T	A	L	L	G	R	Q	P	E	L	P	D	W	I	Y	D	G	V	T	L	G	I	.	Q	G	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R	V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y	P	Q	L	D
Query Conservation																								.																												.
Alig confidence																								.																												.								.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	E	L	I	G	R	P	A	L	P	S	Y	W	A	L	G	F	H	L	S	R	Y	E	Y	G	T	L	D	N	M	R	E	V	V	E	R	N	R	A	A	Q	L	P	Y	D	V	Q	H	A	D	I	D	Y	M	D	E	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	F	T	Y	D	S	V	D	F	K	G	F	P
Template Known Secondary structure													G	G	G	G	S						S				S														T	T										G	G	G	S	B	T	T	B	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T				T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																												.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		278	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.										.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.
		318	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.							.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390
Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.																				.
Query SS confidence																										.	.	.	.	.	.																				.
Query Sequence		S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	Y	V	A	S	D	.	.	.	.	.	.	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	G	.	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E	A	Y	A	W	F	K	E	V	I
Query Conservation																										.	.	.	.	.	.																				.
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation
Template Sequence		E	F	V	N	E	L	H	N	N	G	Q	K	L	V	I	I	V	D	P	A	I	S	N	N	S	S	S	S	K	P	Y	G	P	Y	D	R	G	S	D	M	K	I	W	V	N	S	S	D	G	V	T	P	L	I	G	E	V	W	P	G	Q	T	V	F	P	D	Y	T	N	P	N	C	A	V	W	W	T	K	E	F
Template Known Secondary structure										T	T									S								S	S	S												T		B		B		T	T	S	S	S	B						T	T						B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		349	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.
		391	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.																																			.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	K	N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	P	T	D	T	Y	L	H	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P	A	L	W	A	K	C
Query Conservation																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.												.
Template Conservation																																																																	.
Template Sequence		E	L	F	H	N	Q	V	E	F	D	G	I	W	I	D	M	N	E	V	S	N	F	V	D	G	S	V	S	G	C	S	T	N	N	L	N	N	P	P	F	T	P	R	I	L	D	G	Y	L	F	C	K	T	L	C	M	D	A	V	Q	H	W	G	.	K	Q	Y	D	I	H	N	L	Y	G	Y	S	M	A	V	A
Template Known Secondary structure						T	T	S			S						S	T	T	T			S	S	S	B	S	T	T					S	T	T	T	S		S				S		G	G	G		T	T	T	T	S	B		T	T				T	T		.						G	G	G
Template Predicted Secondary structure																																																																	.
Template SS confidence
		429	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.		.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.
		437	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T	L	F	E	M	K	R
Query Conservation
Alig confidence																																.													.	.	.																													.	.	.	.
Template Conservation																																.													.	.	.																													.	.	.	.
Template Sequence		T	A	E	A	A	K	T	V	F	P	N	K	R	S	F	I	L	T	R	S	T	F	A	G	S	G	K	F	A	A	.	H	W	L	G	D	N	T	A	T	W	D	D	.	.	.	L	R	W	S	I	P	G	V	L	E	F	N	L	F	G	I	P	M	V	G	P	D	I	C	G	F	A	L	.	.	.	.	D	T
Template Known Secondary structure										S	T	T	B							S	S			T	T	G	G	G	T			.					S		B	S	S				.	.	.														T	T			S						T		S	B	S	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																.													.	.	.																													.	.	.	.
Template SS confidence
		508	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.		.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.				550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.					.	.
		517	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.			.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.
Query SS confidence																								.	.
Query Sequence		S	K	E	L	L	L	R	W	C	D	F	S	A	F	T	P	M	M	R	T	H	E	.	.	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	D	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R	P	L	F	L	H	Y
Query Conservation																								.	.
Alig confidence																								.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	E	E	L	C	R	R	W	M	Q	L	G	A	F	Y	P	F	S	R	N	H	N	G	Q	G	Y	K	D	Q	D	P	A	S	F	G	A	D	S	L	L	L	N	S	S	R	H	Y	L	N	I	R	Y	T	L	L	P	Y	L	Y	T	L	F	F	R	A	H	S	R	G	D	T	V	A	R	P	L	L	H	E	F
Template Known Secondary structure														T	T	S	S	S							S	S	S				S	G	G	G	G		T	T																	T														T				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.		.	.		.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
Predicted Secondary structure																																																						.			.
Query SS confidence																																																						.			.
Query Sequence		E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D	I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	E	D	N	W	V	H	A	W	T	G	E	A	F	R	G	.	G	E	.	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F	Y	R	A	D	S	E	W	A	A
Query Conservation																																																						.			.
Alig confidence																																																						.			.
Template Conservation
Template Sequence		Y	E	D	N	S	T	W	D	V	H	Q	Q	F	L	W	G	P	G	L	L	I	T	P	V	L	D	E	G	A	E	K	V	M	A	Y	V	P	D	A	V	W	Y	D	Y	E	T	G	S	Q	V	R	W	R	K	Q	K	V	E	M	E	L	P	G	D	K	I	G	L	H	L	R	G	G	Y	I	F	P	T
Template Known Secondary structure		T	T		G	G	G	T	T			S					T	T	T								S	T	T		S								S	S					T	T	T			B		S			S									T	T								T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.