Job Description P32138 Confidence 100.00% Date Thu Jan 5 11:49:24 GMT 2012 Rank 6 Aligned Residues 564 % Identity 20% Template c2g3nA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:alpha-glucosidase; PDBTitle: crystal structure of the sulfolobus solfataricus alpha-2 glucosidase mala in complex with beta-octyl-glucopyranoside Resolution 2.55 Å

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		72	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.		.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.			.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.																																					.	.
Query SS confidence																			.																																					.	.
Query Sequence		V	S	Q	S	P	D	G	W	L	I	H	F	S	R	G	S	D	.	I	S	A	T	L	N	I	S	A	D	D	Q	G	R	L	L	L	E	L	Q	N	D	N	L	N	H	N	R	I	W	L	R	L	A	A	Q	.	.	P	E	D	H	I	Y	G	C	G	E	Q	F	S	Y	F	D	L	R	G	K	P	F	P	L
Query Conservation																			.																																					.	.
Alig confidence																			.																																					.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	K	I	Y	E	N	K	G	V	Y	K	V	V	I	G	E	P	F	P	P	I	E	F	P	L	E	Q	K	I	S	S	N	K	S	L	S	E	L	G	L	T	I	V	Q	Q	G	N	K	V	I	V	E	K	S	L	D	L	K	E	H	I	I	G	L	G	E	K	A	F	E	L	D	R	K	R	K	R	Y	V	M
Template Known Secondary structure								S	S							S	S				S	S					S				B		S			T	T	T	T	T							T	T										T	T							S	S		S	S		S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.
		149	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.				190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.			.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.
Predicted Secondary structure																																											.	.	.																			.	.
Query SS confidence																																											.	.	.																			.	.
Query Sequence		W	T	S	E	Q	G	V	G	R	N	K	Q	T	Y	V	T	W	Q	A	D	C	K	E	N	A	G	G	D	Y	Y	W	T	F	F	P	Q	P	T	F	V	S	.	.	.	T	Q	K	Y	Y	C	H	V	D	N	S	C	Y	M	N	F	D	F	.	.	S	A	P	E	Y	H	E	L	A	L	W	E	D	K	A	T
Query Conservation																																											.	.	.																			.	.
Alig confidence								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			.	.	.																			.	.
Template Conservation								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	N	V	D	A	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	Y	K	K	Y	Q	D	P	L	Y	V	S	I	P	L	F	I	S	V	K	D	G	V	A	T	G	Y	F	F	N	S	A	S	K	V	I	F	D	V	G	L	E	E	Y	D	K	V	I	V	T	I	P	E	D	S	V	E
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S			T	T					S											T	T											S							S	S	S	S	T	T							S	S	S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		84	.	.	.	.	.																		90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.
		224	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.		.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.		.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.
Predicted Secondary structure																																								.																												.
Query SS confidence																																								.																												.
Query Sequence		L	R	F	E	C	A	D	T	Y	I	S	L	L	E	K	L	T	A	L	L	G	R	Q	P	E	L	P	D	W	I	Y	D	G	V	T	L	G	I	.	Q	G	G	T	E	V	C	Q	K	K	L	D	T	M	R	N	A	G	V	K	V	N	G	I	W	A	Q	.	D	W	S	G	I	R	M	T	S	F	G	K	R
Query Conservation																																								.																												.
Alig confidence																																								.																												.								.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		F	Y	V	I	E	G	P	R	I	E	D	V	L	E	K	Y	T	E	L	T	G	K	P	F	L	P	P	M	W	A	F	G	Y	M	I	S	R	Y	S	Y	Y	P	Q	D	K	V	V	E	L	V	D	I	M	Q	K	E	G	F	R	V	A	G	V	F	L	D	I	H	Y	M	D	S	Y	K	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure								S	S																				G	G	G	G	S						T	T			S														T	T										G	G	G	S	B	T	T	B	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		147	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220
		302	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	M	W	N	W	K	W	N	S	E	N	Y	P	Q	L	D	S	R	I	K	Q	W	N	Q	E	G	V	Q	F	L	A	Y	I	N	P	Y	V	A	S	D	K	D	L	C	E	E	A	A	Q	H	G	Y	L	A	K	D	A	S	G	G	D	Y	L	V	E	F	G	E	F	Y	G	G	V	V	D	L	T	N	P	E
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.
Template Conservation		.	.	.
Template Sequence		.	.	.	L	F	T	W	H	P	Y	R	F	P	E	P	K	K	L	I	D	E	L	H	K	R	N	V	K	L	I	T	I	V	D	H	G	I	R	V	D	Q	N	Y	S	P	F	L	S	G	M	G	K	F	C	E	I	E	S	G	E	L	F	V	G	K	M	W	P	G	T	T	V	Y	P	D	F	F	R	E	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	T	T				T	T	T		S												T	T									S						T	T								T	T	S	B				T	T	S	S	B						T	T						B		T	T	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.
Template SS confidence
					221	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.
		382	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.																													410	.	.	.	.	.	.	.				.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Query Sequence		A	Y	A	W	F	K	E	V	I	K	K	N	M	I	E	L	G	C	G	G	W	M	A	D	F	G	E	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	T	D	T	Y	L	H	.	.	.	N	G	V	S	A	E	I	M	H	N	A	W	P
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Alig confidence													.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.
Template Conservation													.
Template Sequence		T	R	E	W	W	A	G	L	I	S	E	.	W	L	S	Q	G	V	D	G	I	W	L	D	M	N	E	P	T	D	F	S	R	A	I	E	I	R	D	V	L	S	S	L	P	V	Q	F	R	D	D	R	L	V	T	T	F	P	D	N	V	V	H	Y	L	R	G	K	R	V	K	H	E	K	V	R	N	A	Y	P
Template Known Secondary structure													.			T	T	T								S	T	T	T	B												S	S	S	S	S							G	G	G	G	B			T	T						T	T									G	G	G
Template Predicted Secondary structure													.
Template SS confidence
		298	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.		.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.
		431	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	W	A	K	C	N	Y	E	A	L	E	E	T	G	K	L	G	E	I	L	F	F	M	R	A	G	S	T	G	S	Q	K	Y	S	T	M	M	W	A	G	D	Q	N	V	D	W	S	L	D	D	G	L	A	S	V	V	P	A	A	L	S	L	A	M	T	G	H	G	L	H	H	S	D	I	G	G	Y	T	T
Query Conservation
Alig confidence																		.																				.													.	.	.
Template Conservation																		.																				.													.	.	.
Template Sequence		L	Y	E	A	M	A	T	F	K	G	F	R	T	S	H	R	.	N	E	I	F	I	L	S	R	A	G	Y	A	G	I	Q	R	Y	A	F	.	I	W	T	G	D	N	T	P	S	W	D	D	.	.	.	L	K	L	Q	L	Q	L	V	L	G	L	S	I	S	G	V	P	F	V	G	C	D	I	G	G	F	Q	G
Template Known Secondary structure															T	T		.	S	S						S	S			T	T	G	G	G	T			.					S				S				.	.	.													T	T	T			S						T		S
Template Predicted Secondary structure																		.																				.													.	.	.
Template SS confidence
		377	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.		.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.		.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.				.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.
		511	.	.	.			.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure						.	.
Query SS confidence						.	.
Query Sequence		L	F	E	M	.	.	K	R	S	K	E	L	L	L	R	W	C	D	F	S	A	F	T	P	M	M	R	T	H	E	G	N	R	P	G	D	N	W	Q	F	D	G	D	A	E	T	I	A	H	F	A	R	M	T	T	V	F	T	T	L	K	P	Y	L	K	E	A	V	A	L	N	A	K	S	G	L	P	V	M	R
Query Conservation						.	.
Alig confidence						.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	N	F	A	E	I	D	N	S	M	D	L	L	V	K	Y	Y	A	L	A	L	F	F	P	F	Y	R	S	H	K	A	T	D	G	I	D	T	E	P	V	F	L	P	D	Y	Y	K	E	K	V	K	E	I	V	E	L	R	Y	K	F	L	P	Y	I	Y	S	L	A	L	E	A	S	E	K	G	H	P	V	I	R
Template Known Secondary structure		S	S	S	S	S															T	T	T		S								T	T	S					G	G	G	S																																				S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		452	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.
		589	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	F	L	H	Y	E	D	D	A	H	T	Y	T	L	K	Y	Q	Y	L	L	G	R	D	I	L	V	A	P	V	H	E	E	G	R	S	D	W	T	L	Y	L	P	E	D	N	W	V	H	A	W	T	G	E	A	F	R	G	G	E	V	T	V	N	A	P	I	G	K	P	P	V	F	Y	R	A	D	S	E	W
Query Conservation
Alig confidence																																						.																							.	.
Template Conservation																																						.																							.	.
Template Sequence		P	L	F	Y	E	F	Q	D	D	D	D	M	Y	R	I	E	D	E	Y	M	V	G	K	Y	L	L	Y	A	P	I	V	S	K	E	E	S	.	R	L	V	T	L	P	R	G	K	W	Y	N	Y	W	N	G	E	I	I	N	G	K	.	.	S	V	V	K	S	T	H	E	L	P	I	Y	L	R	E	G	S	I	I
Template Known Secondary structure								T	T		G	G	G	G	G			S					T	T	T								S	S	S	S		.							S	S					T	T	T						S	S	.	.							S	S	S						S	S
Template Predicted Secondary structure																																						.																							.	.
Template SS confidence
		532	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.		.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.			590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.
		669	670
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	A
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		P	L
Template Known Secondary structure
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		609	610